RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591598.5

CTDP1-207, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTDP1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-207ENST00000591598 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.51■■■■□ 3.12
CTDP1-207ENST00000591598 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.03■■■□□ 2.4
CTDP1-207ENST00000591598 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDP1-207ENST00000591598 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
CTDP1-207ENST00000591598 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
CTDP1-207ENST00000591598 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDP1-207ENST00000591598 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.25■■■□□ 2.11
CTDP1-207ENST00000591598 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDP1-207ENST00000591598 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDP1-207ENST00000591598 SCRIBQ14160 1630 aa27.73■■■□□ 2.03
CTDP1-207ENST00000591598 ABCC9O60706 1549 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDP1-207ENST00000591598 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.66■■■□□ 2.02
CTDP1-207ENST00000591598 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.56■■■□□ 2
CTDP1-207ENST00000591598 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
CTDP1-207ENST00000591598 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.33■■□□□ 1.97
CTDP1-207ENST00000591598 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CTDP1-207ENST00000591598 TRIM41Q8WV44 630 aa27.26■■□□□ 1.95
CTDP1-207ENST00000591598 HRCP23327 699 aa27.21■■□□□ 1.95
CTDP1-207ENST00000591598 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.14■■□□□ 1.94
CTDP1-207ENST00000591598 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.11■■□□□ 1.93
CTDP1-207ENST00000591598 NACADO15069 1562 aa27.07■■□□□ 1.92
CTDP1-207ENST00000591598 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CTDP1-207ENST00000591598 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDP1-207ENST00000591598 WIZO95785 1651 aa26.79■■□□□ 1.88
CTDP1-207ENST00000591598 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CTDP1-207ENST00000591598 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.86
CTDP1-207ENST00000591598 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CTDP1-207ENST00000591598 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CTDP1-207ENST00000591598 ABCC8Q09428 1581 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDP1-207ENST00000591598 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.28■■□□□ 1.8
CTDP1-207ENST00000591598 SMARCA4P51532 1647 aa26.27■■□□□ 1.8
CTDP1-207ENST00000591598 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDP1-207ENST00000591598 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CTDP1-207ENST00000591598 SMARCA2P51531 1590 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDP1-207ENST00000591598 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CTDP1-207ENST00000591598 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CTDP1-207ENST00000591598 SOGA1O94964 1423 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDP1-207ENST00000591598 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CTDP1-207ENST00000591598 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CTDP1-207ENST00000591598 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDP1-207ENST00000591598 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDP1-207ENST00000591598 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDP1-207ENST00000591598 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CTDP1-207ENST00000591598 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CTDP1-207ENST00000591598 CEP162Q5TB80 1403 aa25.85■■□□□ 1.73
CTDP1-207ENST00000591598 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.8■■□□□ 1.722e-8■■■■■ 75.2
CTDP1-207ENST00000591598 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CTDP1-207ENST00000591598 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.72■■□□□ 1.71
CTDP1-207ENST00000591598 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDP1-207ENST00000591598 EEA1Q15075 1411 aa25.61■■□□□ 1.69
CTDP1-207ENST00000591598 GOLGA3Q08378 1498 aa25.59■■□□□ 1.69
CTDP1-207ENST00000591598 SYNJ1O43426 1573 aa25.58■■□□□ 1.69
CTDP1-207ENST00000591598 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.56■■□□□ 1.68
CTDP1-207ENST00000591598 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CTDP1-207ENST00000591598 APLP2Q06481 763 aa25.45■■□□□ 1.66
CTDP1-207ENST00000591598 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDP1-207ENST00000591598 CLIP1P30622 1438 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDP1-207ENST00000591598 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDP1-207ENST00000591598 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CTDP1-207ENST00000591598 KIF21BO75037 1637 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDP1-207ENST00000591598 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDP1-207ENST00000591598 TOP2BQ02880 1626 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDP1-207ENST00000591598 NCAPD3P42695 1498 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDP1-207ENST00000591598 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CTDP1-207ENST00000591598 CUX1P39880 1505 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDP1-207ENST00000591598 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CTDP1-207ENST00000591598 HMGXB3Q12766 1538 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDP1-207ENST00000591598 KIF27Q86VH2 1401 aa25■■□□□ 1.59
CTDP1-207ENST00000591598 ITGAEP38570 1179 aa25■■□□□ 1.59
CTDP1-207ENST00000591598 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CTDP1-207ENST00000591598 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDP1-207ENST00000591598 CFTRP13569 1480 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDP1-207ENST00000591598 PRXQ9BXM0 1461 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDP1-207ENST00000591598 NEUROD1Q13562 356 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDP1-207ENST00000591598 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CTDP1-207ENST00000591598 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
CTDP1-207ENST00000591598 ARAP1Q96P48 1450 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDP1-207ENST00000591598 CUX2O14529 1486 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDP1-207ENST00000591598 P3H3Q8IVL6 736 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDP1-207ENST00000591598 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CTDP1-207ENST00000591598 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.83■■□□□ 1.56
CTDP1-207ENST00000591598 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDP1-207ENST00000591598 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CTDP1-207ENST00000591598 IGF1RP08069 1367 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDP1-207ENST00000591598 MIER1Q8N108 512 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDP1-207ENST00000591598 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDP1-207ENST00000591598 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDP1-207ENST00000591598 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.7■■□□□ 1.55
CTDP1-207ENST00000591598 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.7■■□□□ 1.54
CTDP1-207ENST00000591598 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.66■■□□□ 1.54
CTDP1-207ENST00000591598 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CTDP1-207ENST00000591598 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CTDP1-207ENST00000591598 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDP1-207ENST00000591598 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDP1-207ENST00000591598 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.58■■□□□ 1.53
CTDP1-207ENST00000591598 NESP48681 1621 aa24.58■■□□□ 1.52
CTDP1-207ENST00000591598 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDP1-207ENST00000591598 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CTDP1-207ENST00000591598 PRDM2Q13029 1718 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDP1-207ENST00000591598 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.44■■□□□ 1.5
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