RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478333.1

IFNGR1-204, Transcript of interferon gamma receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene IFNGR1, Length 643 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNGR1-204ENST00000478333 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.17■■■■■ 5.94
IFNGR1-204ENST00000478333 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.55■■■■■ 5.04
IFNGR1-204ENST00000478333 ABCC9O60706 1549 aa45.65■■■■■ 4.9
IFNGR1-204ENST00000478333 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.83■■■■■ 4.61
IFNGR1-204ENST00000478333 NACADO15069 1562 aa43.72■■■■■ 4.59
IFNGR1-204ENST00000478333 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.53■■■■■ 4.56
IFNGR1-204ENST00000478333 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
IFNGR1-204ENST00000478333 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.38■■■■■ 4.53
IFNGR1-204ENST00000478333 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.14■■■■■ 4.5
IFNGR1-204ENST00000478333 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.02■■■■■ 4.48
IFNGR1-204ENST00000478333 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.58■■■■■ 4.41
IFNGR1-204ENST00000478333 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.56■■■■■ 4.4
IFNGR1-204ENST00000478333 SCRIBQ14160 1630 aa42.46■■■■■ 4.39
IFNGR1-204ENST00000478333 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.02■■■■■ 4.32
IFNGR1-204ENST00000478333 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.01■■■■■ 4.32
IFNGR1-204ENST00000478333 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
IFNGR1-204ENST00000478333 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.33■■■■■ 4.21
IFNGR1-204ENST00000478333 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.01■■■■■ 4.16
IFNGR1-204ENST00000478333 SMARCA4P51532 1647 aa40.58■■■■■ 4.09
IFNGR1-204ENST00000478333 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
IFNGR1-204ENST00000478333 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.33■■■■■ 4.05
IFNGR1-204ENST00000478333 NCAPD3P42695 1498 aa40.31■■■■■ 4.04
IFNGR1-204ENST00000478333 SMARCA2P51531 1590 aa40.28■■■■■ 4.04
IFNGR1-204ENST00000478333 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.24■■■■■ 4.03
IFNGR1-204ENST00000478333 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.16■■■■■ 4.02
IFNGR1-204ENST00000478333 HMGXB3Q12766 1538 aa40.16■■■■■ 4.02
IFNGR1-204ENST00000478333 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
IFNGR1-204ENST00000478333 WIZO95785 1651 aa39.85■■■■□ 3.97
IFNGR1-204ENST00000478333 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
IFNGR1-204ENST00000478333 NESP48681 1621 aa39.48■■■■□ 3.91
IFNGR1-204ENST00000478333 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
IFNGR1-204ENST00000478333 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.33■■■■□ 3.89
IFNGR1-204ENST00000478333 ERCC6Q03468 1493 aa39.31■■■■□ 3.88
IFNGR1-204ENST00000478333 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.09■■■■□ 3.85
IFNGR1-204ENST00000478333 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.09■■■■□ 3.85
IFNGR1-204ENST00000478333 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.98■■■■□ 3.83
IFNGR1-204ENST00000478333 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.97■■■■□ 3.83
IFNGR1-204ENST00000478333 CUX2O14529 1486 aa38.97■■■■□ 3.83
IFNGR1-204ENST00000478333 CFTRP13569 1480 aa38.87■■■■□ 3.81
IFNGR1-204ENST00000478333 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.86■■■■□ 3.81
IFNGR1-204ENST00000478333 PRDM2Q13029 1718 aa38.75■■■■□ 3.79
IFNGR1-204ENST00000478333 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.71■■■■□ 3.79
IFNGR1-204ENST00000478333 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.68■■■■□ 3.78
IFNGR1-204ENST00000478333 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.66■■■■□ 3.78
IFNGR1-204ENST00000478333 WDR62O43379 1518 aa38.58■■■■□ 3.77
IFNGR1-204ENST00000478333 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
IFNGR1-204ENST00000478333 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.38■■■■□ 3.73
IFNGR1-204ENST00000478333 TOPBP1Q92547 1522 aa38.09■■■■□ 3.69
IFNGR1-204ENST00000478333 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.05■■■■□ 3.68
IFNGR1-204ENST00000478333 ABCC8Q09428 1581 aa38■■■■□ 3.67
IFNGR1-204ENST00000478333 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.91■■■■□ 3.66
IFNGR1-204ENST00000478333 IFT140Q96RY7 1462 aa37.85■■■■□ 3.65
IFNGR1-204ENST00000478333 CUX1P39880 1505 aa37.77■■■■□ 3.64
IFNGR1-204ENST00000478333 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.76■■■■□ 3.63
IFNGR1-204ENST00000478333 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.76■■■■□ 3.63
IFNGR1-204ENST00000478333 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.74■■■■□ 3.63
IFNGR1-204ENST00000478333 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
IFNGR1-204ENST00000478333 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.64■■■■□ 3.62
IFNGR1-204ENST00000478333 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.59■■■■□ 3.61
IFNGR1-204ENST00000478333 SOGA1O94964 1423 aa37.53■■■■□ 3.6
IFNGR1-204ENST00000478333 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.47■■■■□ 3.591e-8■■■■■ 43.7
IFNGR1-204ENST00000478333 WDR97A6NE52 1622 aa37.46■■■■□ 3.59
IFNGR1-204ENST00000478333 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.43■■■■□ 3.58
IFNGR1-204ENST00000478333 SYNJ1O43426 1573 aa37.42■■■■□ 3.58
IFNGR1-204ENST00000478333 TOP2BQ02880 1626 aa37.39■■■■□ 3.58
IFNGR1-204ENST00000478333 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.39■■■■□ 3.58
IFNGR1-204ENST00000478333 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
IFNGR1-204ENST00000478333 CHD1O14646 1710 aa37.27■■■■□ 3.56
IFNGR1-204ENST00000478333 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.25■■■■□ 3.55
IFNGR1-204ENST00000478333 OSCARQ8IYS5 282 aa37.22■■■■□ 3.55
IFNGR1-204ENST00000478333 PBRM1Q86U86 1689 aa37.21■■■■□ 3.55
IFNGR1-204ENST00000478333 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.2■■■■□ 3.55
IFNGR1-204ENST00000478333 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.16■■■■□ 3.54
IFNGR1-204ENST00000478333 GRIN2BQ13224 1484 aa37.13■■■■□ 3.54
IFNGR1-204ENST00000478333 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.13■■■■□ 3.53
IFNGR1-204ENST00000478333 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.53
IFNGR1-204ENST00000478333 FBLN2P98095 1184 aa36.98■■■■□ 3.51
IFNGR1-204ENST00000478333 SYNJ2O15056 1496 aa36.94■■■■□ 3.5
IFNGR1-204ENST00000478333 ADAMTS12P58397 1594 aa36.85■■■■□ 3.49
IFNGR1-204ENST00000478333 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.84■■■■□ 3.49
IFNGR1-204ENST00000478333 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.84■■■■□ 3.49
IFNGR1-204ENST00000478333 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.84■■■■□ 3.49
IFNGR1-204ENST00000478333 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.84■■■■□ 3.49
IFNGR1-204ENST00000478333 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.8■■■■□ 3.48
IFNGR1-204ENST00000478333 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.78■■■■□ 3.48
IFNGR1-204ENST00000478333 ARHGEF11O15085 1522 aa36.76■■■■□ 3.48
IFNGR1-204ENST00000478333 GRIN2AQ12879 1464 aa36.69■■■■□ 3.46
IFNGR1-204ENST00000478333 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.68■■■■□ 3.46
IFNGR1-204ENST00000478333 TRIM41Q8WV44 630 aa36.62■■■■□ 3.45
IFNGR1-204ENST00000478333 KIF27Q86VH2 1401 aa36.59■■■■□ 3.45
IFNGR1-204ENST00000478333 CEP170Q5SW79 1584 aa36.58■■■■□ 3.45
IFNGR1-204ENST00000478333 NUP160Q12769 1436 aa36.52■■■■□ 3.44
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IFNGR1-204ENST00000478333 ARAP1Q96P48 1450 aa36.47■■■■□ 3.43
IFNGR1-204ENST00000478333 IGF1RP08069 1367 aa36.46■■■■□ 3.43
IFNGR1-204ENST00000478333 SHROOM2Q13796 1616 aa36.34■■■■□ 3.41
IFNGR1-204ENST00000478333 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.33■■■■□ 3.41
IFNGR1-204ENST00000478333 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.33■■■■□ 3.41
IFNGR1-204ENST00000478333 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.29■■■■□ 3.4
IFNGR1-204ENST00000478333 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.24■■■■□ 3.39
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