Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.61e-9■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.691e-9■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.47□□□□□ -1.691e-9■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 SCN1A-221ENST00000641996 12903 nt3.63□□□□□ -1.831e-9■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.5□□□□□ -2.011e-9■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 RPTOR-209ENST00000575542 5536 ntTSL 1 (best)14.92□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 LPCAT1-202ENST00000475622 5610 ntTSL 517.32■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.34e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 TNS3-208ENST00000457718 3836 ntTSL 510.58□□□□□ -0.726e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.726e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.539e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 AGAP3-207ENST00000467724 826 ntTSL 518.52■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 AGAP3-225ENST00000498559 581 ntTSL 216.7■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 AGAP3-213ENST00000475145 413 ntTSL 210.95□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 AGAP3-208ENST00000468796 540 ntTSL 48.25□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 IGF2BP1-202ENST00000431824 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.612e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.395e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.055e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.855e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 CARD10-210ENST00000494166 560 ntTSL 519.57■□□□□ 0.724e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.654e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 CARD10-205ENST00000437756 2140 ntTSL 1 (best)17.98■□□□□ 0.474e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 AGPAT3-213ENST00000479117 1510 ntTSL 517.49■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.154e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 CSNK1G2-209ENST00000591752 648 ntTSL 515.92■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.084e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 AGPAT3-210ENST00000457068 924 ntTSL 314.81□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 AGPAT3-206ENST00000422850 1003 ntTSL 514.81□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 AGPAT3-214ENST00000481319 616 ntTSL 313.34□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 CALM3-213ENST00000602169 590 ntTSL 212.83□□□□□ -0.364e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.64e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 CALM3-203ENST00000477244 696 ntTSL 310.59□□□□□ -0.714e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 AGPAT3-211ENST00000467358 3955 ntTSL 210.28□□□□□ -0.761e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 CALM3-210ENST00000597868 927 ntTSL 310.01□□□□□ -0.814e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 KIF1C-203ENST00000573815 726 ntTSL 59.7□□□□□ -0.861e-12■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 GSAP-209ENST00000449779 2975 ntTSL 27.86□□□□□ -1.154e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.387e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.677e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 KRT18-206ENST00000549078 2088 ntTSL 518.91■□□□□ 0.627e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.67e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 KRT18-203ENST00000546656 521 ntTSL 212.95□□□□□ -0.347e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 KRT18-205ENST00000548496 695 ntTSL 211.56□□□□□ -0.567e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 TMEM68-205ENST00000519780 707 ntTSL 58.61□□□□□ -1.034e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 TMEM68-201ENST00000334667 2401 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.054e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.344e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 TMEM68-207ENST00000520061 659 ntTSL 36.71□□□□□ -1.344e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 TMEM68-211ENST00000522090 1000 ntTSL 36.65□□□□□ -1.344e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 TMEM68-212ENST00000522470 726 ntTSL 35.07□□□□□ -1.64e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.64e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.654e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.694e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 TMEM68-203ENST00000517576 751 ntTSL 53.71□□□□□ -1.824e-8■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.447e-7■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 NEU1-208ENST00000491768 1875 ntTSL 519.1■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 NEU1-207ENST00000480384 2214 ntTSL 217.46■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 NEU1-209ENST00000495807 4616 ntTSL 212.67□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 28.3
PCBP2Q15366 PTMS-205ENST00000540828 644 ntTSL 1 (best)19.77■□□□□ 0.764e-17■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 TGFBR3-210ENST00000533089 6455 ntTSL 1 (best)6.63□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 TGFBR3-209ENST00000532540 3913 ntTSL 1 (best)6.3□□□□□ -1.42e-6■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 RFX3-207ENST00000449190 869 ntTSL 38.81□□□□□ -17e-7■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 AP2A2-206ENST00000525891 743 ntTSL 418.08■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.886e-7■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.972e-6■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.72e-6■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 RDX-211ENST00000530749 2558 ntTSL 221.35■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 RDX-214ENST00000533678 531 ntTSL 415.49■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 RDX-217ENST00000534683 562 ntTSL 415.41■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 RDX-209ENST00000530131 1911 ntTSL 214.98□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 RDX-216ENST00000533991 544 ntTSL 414.48□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 RDX-205ENST00000528556 803 ntTSL 38.16□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.139e-7■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.49e-7■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 DHRS11-209ENST00000610443 4505 nt11.45□□□□□ -0.589e-7■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 DHRS11-214ENST00000617959 976 ntTSL 210.13□□□□□ -0.799e-7■■■■■ 28.2
PCBP2Q15366 DHRS11-216ENST00000621871 883 ntTSL 36.32□□□□□ -1.49e-7■■■■■ 28.2
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