RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000388835.3

KRT18-201, Transcript of keratin 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KRT18, Length 1,562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18-201ENST00000388835 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.53■■■■■ 7.76
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KRT18-201ENST00000388835 ABCC9O60706 1549 aa56.62■■■■■ 6.65
KRT18-201ENST00000388835 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.97■■■■■ 6.23
KRT18-201ENST00000388835 NACADO15069 1562 aa53.66■■■■■ 6.18
KRT18-201ENST00000388835 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.63■■■■■ 6.18
KRT18-201ENST00000388835 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.95■■■■■ 6.07
KRT18-201ENST00000388835 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.82■■■■■ 6.05
KRT18-201ENST00000388835 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.8■■■■■ 6.04
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KRT18-201ENST00000388835 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.71■■■■■ 6.03
KRT18-201ENST00000388835 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.43■■■■■ 5.98
KRT18-201ENST00000388835 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.39■■■■■ 5.98
KRT18-201ENST00000388835 SCRIBQ14160 1630 aa51.92■■■■■ 5.9
KRT18-201ENST00000388835 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.62■■■■■ 5.85
KRT18-201ENST00000388835 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.13■■■■■ 5.78
KRT18-201ENST00000388835 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.08■■■■■ 5.77
KRT18-201ENST00000388835 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.93■■■■■ 5.74
KRT18-201ENST00000388835 NCAPD3P42695 1498 aa49.51■■■■■ 5.52
KRT18-201ENST00000388835 SMARCA4P51532 1647 aa49.51■■■■■ 5.52
KRT18-201ENST00000388835 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.45■■■■■ 5.51
KRT18-201ENST00000388835 SMARCA2P51531 1590 aa49.33■■■■■ 5.49
KRT18-201ENST00000388835 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.29■■■■■ 5.48
KRT18-201ENST00000388835 HMGXB3Q12766 1538 aa49.19■■■■■ 5.47
KRT18-201ENST00000388835 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.02■■■■■ 5.44
KRT18-201ENST00000388835 MROH2BQ7Z745 1585 aa49■■■■■ 5.43
KRT18-201ENST00000388835 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.96■■■■■ 5.43
KRT18-201ENST00000388835 ERCC6Q03468 1493 aa48.85■■■■■ 5.41
KRT18-201ENST00000388835 NESP48681 1621 aa48.74■■■■■ 5.39
KRT18-201ENST00000388835 CUX2O14529 1486 aa48.57■■■■■ 5.37
KRT18-201ENST00000388835 WIZO95785 1651 aa48.46■■■■■ 5.35
KRT18-201ENST00000388835 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.38■■■■■ 5.33
KRT18-201ENST00000388835 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.18■■■■■ 5.3
KRT18-201ENST00000388835 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.13■■■■■ 5.29
KRT18-201ENST00000388835 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.12■■■■■ 5.29
KRT18-201ENST00000388835 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.09■■■■■ 5.29
KRT18-201ENST00000388835 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.08■■■■■ 5.29
KRT18-201ENST00000388835 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.06■■■■■ 5.28
KRT18-201ENST00000388835 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.82■■■■■ 5.25
KRT18-201ENST00000388835 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.67■■■■■ 5.22
KRT18-201ENST00000388835 CFTRP13569 1480 aa47.57■■■■■ 5.21
KRT18-201ENST00000388835 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.56■■■■■ 5.2
KRT18-201ENST00000388835 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.54■■■■■ 5.2
KRT18-201ENST00000388835 WDR62O43379 1518 aa47.52■■■■■ 5.2
KRT18-201ENST00000388835 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.29■■■■■ 5.16
KRT18-201ENST00000388835 PRDM2Q13029 1718 aa47.18■■■■■ 5.14
KRT18-201ENST00000388835 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.14■■■■■ 5.14
KRT18-201ENST00000388835 TOPBP1Q92547 1522 aa46.68■■■■■ 5.06
KRT18-201ENST00000388835 IFT140Q96RY7 1462 aa46.58■■■■■ 5.05
KRT18-201ENST00000388835 ABCC8Q09428 1581 aa46.55■■■■■ 5.04
KRT18-201ENST00000388835 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.53■■■■■ 5.04
KRT18-201ENST00000388835 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.52■■■■■ 5.04
KRT18-201ENST00000388835 OSCARQ8IYS5 282 aa46.46■■■■■ 5.03
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KRT18-201ENST00000388835 TRIM41Q8WV44 630 aa46.33■■■■■ 5.01
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KRT18-201ENST00000388835 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.23■■■■■ 4.99
KRT18-201ENST00000388835 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.14■■■■■ 4.982e-7■■■■□ 21.9
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KRT18-201ENST00000388835 CUX1P39880 1505 aa46.01■■■■■ 4.96
KRT18-201ENST00000388835 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46■■■■■ 4.95
KRT18-201ENST00000388835 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.92■■■■■ 4.94
KRT18-201ENST00000388835 CHD1O14646 1710 aa45.9■■■■■ 4.94
KRT18-201ENST00000388835 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.84■■■■■ 4.93
KRT18-201ENST00000388835 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.84■■■■■ 4.93
KRT18-201ENST00000388835 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.84■■■■■ 4.93
KRT18-201ENST00000388835 FBLN2P98095 1184 aa45.84■■■■■ 4.93
KRT18-201ENST00000388835 WDR97A6NE52 1622 aa45.72■■■■■ 4.91
KRT18-201ENST00000388835 ARHGEF11O15085 1522 aa45.71■■■■■ 4.91
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KRT18-201ENST00000388835 GRIN2BQ13224 1484 aa45.58■■■■■ 4.89
KRT18-201ENST00000388835 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.52■■■■■ 4.88
KRT18-201ENST00000388835 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.5■■■■■ 4.87
KRT18-201ENST00000388835 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.48■■■■■ 4.87
KRT18-201ENST00000388835 PBRM1Q86U86 1689 aa45.47■■■■■ 4.87
KRT18-201ENST00000388835 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.45■■■■■ 4.87
KRT18-201ENST00000388835 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.4■■■■■ 4.86
KRT18-201ENST00000388835 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.38■■■■■ 4.86
KRT18-201ENST00000388835 SYNJ2O15056 1496 aa45.38■■■■■ 4.86
KRT18-201ENST00000388835 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.36■■■■■ 4.85
KRT18-201ENST00000388835 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.35■■■■■ 4.85
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KRT18-201ENST00000388835 SYNJ1O43426 1573 aa45.34■■■■■ 4.85
KRT18-201ENST00000388835 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.31■■■■■ 4.84
KRT18-201ENST00000388835 ARAP1Q96P48 1450 aa45.28■■■■■ 4.84
KRT18-201ENST00000388835 ADAMTS12P58397 1594 aa45.02■■■■■ 4.8
KRT18-201ENST00000388835 GRIN2AQ12879 1464 aa44.99■■■■■ 4.79
KRT18-201ENST00000388835 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.89■■■■■ 4.78
KRT18-201ENST00000388835 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.89■■■■■ 4.78
KRT18-201ENST00000388835 CEP170Q5SW79 1584 aa44.84■■■■■ 4.77
KRT18-201ENST00000388835 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.82■■■■■ 4.76
KRT18-201ENST00000388835 NUP160Q12769 1436 aa44.8■■■■■ 4.76
KRT18-201ENST00000388835 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.69■■■■■ 4.75
KRT18-201ENST00000388835 SHROOM2Q13796 1616 aa44.58■■■■■ 4.73
KRT18-201ENST00000388835 KIF27Q86VH2 1401 aa44.47■■■■■ 4.71
KRT18-201ENST00000388835 IGF1RP08069 1367 aa44.42■■■■■ 4.7
KRT18-201ENST00000388835 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.39■■■■■ 4.7
KRT18-201ENST00000388835 JPH4Q96JJ6 628 aa44.39■■■■■ 4.7
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