RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530301.5

RDX-210, Transcript of radixin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RDX, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDX-210ENST00000530301 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.21■■■■■ 7.07
RDX-210ENST00000530301 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.81■■■■■ 5.88
RDX-210ENST00000530301 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.72■■■■■ 5.55
RDX-210ENST00000530301 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.15■■■■■ 5.46
RDX-210ENST00000530301 ABCC9O60706 1549 aa48.71■■■■■ 5.39
RDX-210ENST00000530301 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.69■■■■■ 5.39
RDX-210ENST00000530301 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.66■■■■■ 5.38
RDX-210ENST00000530301 NACADO15069 1562 aa48.27■■■■■ 5.32
RDX-210ENST00000530301 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.89■■■■■ 5.26
RDX-210ENST00000530301 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.82■■■■■ 5.25
RDX-210ENST00000530301 SCRIBQ14160 1630 aa47.33■■■■■ 5.17
RDX-210ENST00000530301 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.67■■■■■ 5.06
RDX-210ENST00000530301 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.19■■■■■ 4.98
RDX-210ENST00000530301 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.17■■■■■ 4.98
RDX-210ENST00000530301 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.85■■■■■ 4.93
RDX-210ENST00000530301 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.83■■■■■ 4.93
RDX-210ENST00000530301 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.82■■■■■ 4.93
RDX-210ENST00000530301 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.8■■■■■ 4.92
RDX-210ENST00000530301 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.6■■■■■ 4.89
RDX-210ENST00000530301 SMARCA4P51532 1647 aa45.51■■■■■ 4.88
RDX-210ENST00000530301 WIZO95785 1651 aa45.22■■■■■ 4.83
RDX-210ENST00000530301 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.08■■■■■ 4.81
RDX-210ENST00000530301 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.91■■■■■ 4.78
RDX-210ENST00000530301 SMARCA2P51531 1590 aa44.88■■■■■ 4.78
RDX-210ENST00000530301 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
RDX-210ENST00000530301 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.77■■■■■ 4.76
RDX-210ENST00000530301 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.54■■■■■ 4.72
RDX-210ENST00000530301 NCAPD3P42695 1498 aa44.5■■■■■ 4.71
RDX-210ENST00000530301 HMGXB3Q12766 1538 aa44.45■■■■■ 4.71
RDX-210ENST00000530301 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.35■■■■■ 4.69
RDX-210ENST00000530301 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.27■■■■■ 4.68
RDX-210ENST00000530301 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.18■■■■■ 4.66
RDX-210ENST00000530301 TRIM41Q8WV44 630 aa43.6■■■■■ 4.57
RDX-210ENST00000530301 CFTRP13569 1480 aa43.44■■■■■ 4.54
RDX-210ENST00000530301 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.31■■■■■ 4.52
RDX-210ENST00000530301 PRDM2Q13029 1718 aa43.3■■■■■ 4.52
RDX-210ENST00000530301 ABCC8Q09428 1581 aa43.28■■■■■ 4.52
RDX-210ENST00000530301 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.21■■■■■ 4.51
RDX-210ENST00000530301 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.02■■■■■ 4.48
RDX-210ENST00000530301 SYNJ1O43426 1573 aa42.9■■■■■ 4.46
RDX-210ENST00000530301 TOP2BQ02880 1626 aa42.89■■■■■ 4.46
RDX-210ENST00000530301 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.86■■■■■ 4.45
RDX-210ENST00000530301 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.86■■■■■ 4.45
RDX-210ENST00000530301 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.77■■■■■ 4.44
RDX-210ENST00000530301 EEA1Q15075 1411 aa42.77■■■■■ 4.44
RDX-210ENST00000530301 NESP48681 1621 aa42.69■■■■■ 4.42
RDX-210ENST00000530301 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.69■■■■■ 4.42
RDX-210ENST00000530301 CUX1P39880 1505 aa42.66■■■■■ 4.42
RDX-210ENST00000530301 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.55■■■■■ 4.4
RDX-210ENST00000530301 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
RDX-210ENST00000530301 SOGA1O94964 1423 aa42.48■■■■■ 4.39
RDX-210ENST00000530301 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.44■■■■■ 4.38
RDX-210ENST00000530301 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.4■■■■■ 4.38
RDX-210ENST00000530301 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.35■■■■■ 4.37
RDX-210ENST00000530301 TOPBP1Q92547 1522 aa42.3■■■■■ 4.36
RDX-210ENST00000530301 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.29■■■■■ 4.36
RDX-210ENST00000530301 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.25■■■■■ 4.35
RDX-210ENST00000530301 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.25■■■■■ 4.35
RDX-210ENST00000530301 KIF27Q86VH2 1401 aa42.19■■■■■ 4.34
RDX-210ENST00000530301 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
RDX-210ENST00000530301 KIF21BO75037 1637 aa42.07■■■■■ 4.33
RDX-210ENST00000530301 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.07■■■■■ 4.32
RDX-210ENST00000530301 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.06■■■■■ 4.32
RDX-210ENST00000530301 GOLGA3Q08378 1498 aa42■■■■■ 4.31
RDX-210ENST00000530301 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.98■■■■■ 4.31
RDX-210ENST00000530301 CUX2O14529 1486 aa41.97■■■■■ 4.31
RDX-210ENST00000530301 ERCC6Q03468 1493 aa41.9■■■■■ 4.3
RDX-210ENST00000530301 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.89■■■■■ 4.3
RDX-210ENST00000530301 WDR62O43379 1518 aa41.85■■■■■ 4.29
RDX-210ENST00000530301 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.85■■■■■ 4.29
RDX-210ENST00000530301 PRXQ9BXM0 1461 aa41.82■■■■■ 4.29
RDX-210ENST00000530301 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.82■■■■■ 4.28
RDX-210ENST00000530301 WDR97A6NE52 1622 aa41.79■■■■■ 4.28
RDX-210ENST00000530301 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.76■■■■■ 4.28
RDX-210ENST00000530301 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
RDX-210ENST00000530301 IGF1RP08069 1367 aa41.72■■■■■ 4.27
RDX-210ENST00000530301 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.66■■■■■ 4.26
RDX-210ENST00000530301 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
RDX-210ENST00000530301 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
RDX-210ENST00000530301 IFT140Q96RY7 1462 aa41.6■■■■■ 4.25
RDX-210ENST00000530301 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.59■■■■■ 4.25
RDX-210ENST00000530301 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.55■■■■■ 4.24
RDX-210ENST00000530301 CUL7Q14999 1698 aa41.54■■■■■ 4.24
RDX-210ENST00000530301 CEP162Q5TB80 1403 aa41.53■■■■■ 4.24
RDX-210ENST00000530301 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.52■■■■■ 4.24
RDX-210ENST00000530301 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
RDX-210ENST00000530301 CLIP1P30622 1438 aa41.28■■■■■ 4.2
RDX-210ENST00000530301 PBRM1Q86U86 1689 aa41.27■■■■■ 4.2
RDX-210ENST00000530301 GRIN2BQ13224 1484 aa41.25■■■■■ 4.19
RDX-210ENST00000530301 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.19■■■■■ 4.18
RDX-210ENST00000530301 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.13■■■■■ 4.17
RDX-210ENST00000530301 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
RDX-210ENST00000530301 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
RDX-210ENST00000530301 ADAMTS12P58397 1594 aa41.04■■■■■ 4.16
RDX-210ENST00000530301 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41■■■■■ 4.15
RDX-210ENST00000530301 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
RDX-210ENST00000530301 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.94■■■■■ 4.14
RDX-210ENST00000530301 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.85■■■■■ 4.13
RDX-210ENST00000530301 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.83■■■■■ 4.13
RDX-210ENST00000530301 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.81■■■■■ 4.12
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