RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436881.2

C9orf172-201, Transcript of Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf172, Length 4,387 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172-201ENST00000436881 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.83■■■□□ 2.21
C9orf172-201ENST00000436881 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.18■■■□□ 2.1
C9orf172-201ENST00000436881 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
C9orf172-201ENST00000436881 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.8■■□□□ 1.88
C9orf172-201ENST00000436881 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.6■■□□□ 1.69
C9orf172-201ENST00000436881 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.35■■□□□ 1.65
C9orf172-201ENST00000436881 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
C9orf172-201ENST00000436881 APLP2Q06481 763 aa25.16■■□□□ 1.62
C9orf172-201ENST00000436881 TRIM41Q8WV44 630 aa25.16■■□□□ 1.62
C9orf172-201ENST00000436881 HRCP23327 699 aa25■■□□□ 1.59
C9orf172-201ENST00000436881 ABCC9O60706 1549 aa24.9■■□□□ 1.58
C9orf172-201ENST00000436881 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.81■■□□□ 1.56
C9orf172-201ENST00000436881 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
C9orf172-201ENST00000436881 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
C9orf172-201ENST00000436881 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
C9orf172-201ENST00000436881 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
C9orf172-201ENST00000436881 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
C9orf172-201ENST00000436881 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.5■■□□□ 1.51
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C9orf172-201ENST00000436881 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.49
C9orf172-201ENST00000436881 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
C9orf172-201ENST00000436881 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
C9orf172-201ENST00000436881 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
C9orf172-201ENST00000436881 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
C9orf172-201ENST00000436881 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.98■■□□□ 1.43
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.94■■□□□ 1.42
C9orf172-201ENST00000436881 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.73■■□□□ 1.39
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C9orf172-201ENST00000436881 ITGAEP38570 1179 aa23.63■■□□□ 1.37
C9orf172-201ENST00000436881 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
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C9orf172-201ENST00000436881 SCRIBQ14160 1630 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf172-201ENST00000436881 NEFLP07196 543 aa23.39■■□□□ 1.33
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C9orf172-201ENST00000436881 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf172-201ENST00000436881 MYT1Q01538 1121 aa23.27■■□□□ 1.32
C9orf172-201ENST00000436881 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.24■■□□□ 1.31
C9orf172-201ENST00000436881 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
C9orf172-201ENST00000436881 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
C9orf172-201ENST00000436881 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
C9orf172-201ENST00000436881 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.13■■□□□ 1.29
C9orf172-201ENST00000436881 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.08■■□□□ 1.29
C9orf172-201ENST00000436881 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
C9orf172-201ENST00000436881 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.02■■□□□ 1.28
C9orf172-201ENST00000436881 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.01■■□□□ 1.27
C9orf172-201ENST00000436881 NEUROD1Q13562 356 aa23■■□□□ 1.27
C9orf172-201ENST00000436881 NACADO15069 1562 aa22.98■■□□□ 1.27
C9orf172-201ENST00000436881 FBLN2P98095 1184 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
C9orf172-201ENST00000436881 TRIM52Q96A61 297 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf172-201ENST00000436881 P3H3Q8IVL6 736 aa22.87■■□□□ 1.25
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C9orf172-201ENST00000436881 EEA1Q15075 1411 aa22.69■■□□□ 1.22
C9orf172-201ENST00000436881 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
C9orf172-201ENST00000436881 ANP32CO43423 234 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf172-201ENST00000436881 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
C9orf172-201ENST00000436881 ARID3CA6NKF2 412 aa22.58■■□□□ 1.21
C9orf172-201ENST00000436881 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.57■■□□□ 1.2
C9orf172-201ENST00000436881 CLIP1P30622 1438 aa22.57■■□□□ 1.2
C9orf172-201ENST00000436881 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
C9orf172-201ENST00000436881 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
C9orf172-201ENST00000436881 MIER1Q8N108 512 aa22.5■■□□□ 1.19
C9orf172-201ENST00000436881 GOLGA3Q08378 1498 aa22.49■■□□□ 1.19
C9orf172-201ENST00000436881 CEP162Q5TB80 1403 aa22.47■■□□□ 1.19
C9orf172-201ENST00000436881 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
C9orf172-201ENST00000436881 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.42■■□□□ 1.18
C9orf172-201ENST00000436881 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
C9orf172-201ENST00000436881 BCANQ96GW7 911 aa22.36■■□□□ 1.17
C9orf172-201ENST00000436881 TONSLQ96HA7 1378 aa22.35■■□□□ 1.17
C9orf172-201ENST00000436881 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.33■■□□□ 1.17
C9orf172-201ENST00000436881 KIF27Q86VH2 1401 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf172-201ENST00000436881 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf172-201ENST00000436881 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.31■■□□□ 1.16
C9orf172-201ENST00000436881 ERCC6Q03468 1493 aa22.21■■□□□ 1.15
C9orf172-201ENST00000436881 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.21■■□□□ 1.15
C9orf172-201ENST00000436881 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
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C9orf172-201ENST00000436881 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf172-201ENST00000436881 SOGA1O94964 1423 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf172-201ENST00000436881 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf172-201ENST00000436881 TSPY4P0CV99 314 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf172-201ENST00000436881 TSPY10P0CW01 314 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf172-201ENST00000436881 ABCC8Q09428 1581 aa22.05■■□□□ 1.12
C9orf172-201ENST00000436881 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
C9orf172-201ENST00000436881 FKBP8Q14318 412 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf172-201ENST00000436881 SMARCA2P51531 1590 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf172-201ENST00000436881 WIZO95785 1651 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf172-201ENST00000436881 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.97■■□□□ 1.11
C9orf172-201ENST00000436881 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.97■■□□□ 1.11
C9orf172-201ENST00000436881 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
C9orf172-201ENST00000436881 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
C9orf172-201ENST00000436881 CUX2O14529 1486 aa21.94■■□□□ 1.1
C9orf172-201ENST00000436881 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.94■■□□□ 1.1
C9orf172-201ENST00000436881 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
C9orf172-201ENST00000436881 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.91■■□□□ 1.1
C9orf172-201ENST00000436881 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
C9orf172-201ENST00000436881 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
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