Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD3Q9Y3P4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD3Q9Y3P4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD3Q9Y3P4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms