Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATL2Q8NHH9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATL2Q8NHH9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATL2Q8NHH9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATL2Q8NHH9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms