Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ATL2Q8NHH9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATL2Q8NHH9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ATL2Q8NHH9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ATL2Q8NHH9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ATL2Q8NHH9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATL2Q8NHH9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ATL2Q8NHH9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ATL2Q8NHH9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATL2Q8NHH9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATL2Q8NHH9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATL2Q8NHH9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATL2Q8NHH9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATL2Q8NHH9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ATL2Q8NHH9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATL2Q8NHH9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ATL2Q8NHH9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATL2Q8NHH9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ATL2Q8NHH9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ATL2Q8NHH9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ATL2Q8NHH9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATL2Q8NHH9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ATL2Q8NHH9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATL2Q8NHH9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATL2Q8NHH9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATL2Q8NHH9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATL2Q8NHH9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATL2Q8NHH9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATL2Q8NHH9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ATL2Q8NHH9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ATL2Q8NHH9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ATL2Q8NHH9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ATL2Q8NHH9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATL2Q8NHH9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATL2Q8NHH9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ATL2Q8NHH9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ATL2Q8NHH9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ATL2Q8NHH9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ATL2Q8NHH9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ATL2Q8NHH9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATL2Q8NHH9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATL2Q8NHH9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATL2Q8NHH9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATL2Q8NHH9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATL2Q8NHH9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATL2Q8NHH9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATL2Q8NHH9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATL2Q8NHH9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATL2Q8NHH9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATL2Q8NHH9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATL2Q8NHH9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATL2Q8NHH9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATL2Q8NHH9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATL2Q8NHH9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATL2Q8NHH9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATL2Q8NHH9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATL2Q8NHH9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATL2Q8NHH9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATL2Q8NHH9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATL2Q8NHH9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATL2Q8NHH9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATL2Q8NHH9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATL2Q8NHH9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATL2Q8NHH9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ATL2Q8NHH9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ATL2Q8NHH9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
ATL2Q8NHH9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATL2Q8NHH9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATL2Q8NHH9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATL2Q8NHH9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATL2Q8NHH9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATL2Q8NHH9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATL2Q8NHH9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATL2Q8NHH9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ATL2Q8NHH9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATL2Q8NHH9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATL2Q8NHH9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATL2Q8NHH9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATL2Q8NHH9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATL2Q8NHH9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATL2Q8NHH9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
ATL2Q8NHH9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATL2Q8NHH9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATL2Q8NHH9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATL2Q8NHH9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATL2Q8NHH9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATL2Q8NHH9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATL2Q8NHH9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ATL2Q8NHH9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATL2Q8NHH9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATL2Q8NHH9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATL2Q8NHH9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATL2Q8NHH9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ATL2Q8NHH9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATL2Q8NHH9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATL2Q8NHH9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATL2Q8NHH9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATL2Q8NHH9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATL2Q8NHH9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATL2Q8NHH9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms