Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFNA1P20827 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFNA1P20827 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFNA1P20827 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFNA1P20827 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms