Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 AKAP1-215ENST00000575186 578 ntTSL 422.02■■□□□ 1.125e-6■■■■□ 20.6
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TARDBPQ13148 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.126e-6■■■■□ 20.5
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TARDBPQ13148 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.146e-6■■■■□ 20.5
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TARDBPQ13148 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.176e-6■■■■□ 20.5
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TARDBPQ13148 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.226e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.236e-6■■■■□ 20.5
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TARDBPQ13148 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.366e-6■■■■□ 20.5
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