RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576591.1

AKAP1-218, Transcript of A-kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene AKAP1, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP1-218ENST00000576591 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.48■■■■□ 3.27
AKAP1-218ENST00000576591 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.42■■■□□ 2.62
AKAP1-218ENST00000576591 ABCC9O60706 1549 aa30.44■■■□□ 2.46
AKAP1-218ENST00000576591 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
AKAP1-218ENST00000576591 NACADO15069 1562 aa29.45■■■□□ 2.31
AKAP1-218ENST00000576591 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.4■■■□□ 2.3
AKAP1-218ENST00000576591 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.39■■■□□ 2.3
AKAP1-218ENST00000576591 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.39■■■□□ 2.3
AKAP1-218ENST00000576591 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.38■■■□□ 2.29
AKAP1-218ENST00000576591 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.79■■■□□ 2.2
AKAP1-218ENST00000576591 SCRIBQ14160 1630 aa28.68■■■□□ 2.18
AKAP1-218ENST00000576591 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.58■■■□□ 2.17
AKAP1-218ENST00000576591 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.48■■■□□ 2.15
AKAP1-218ENST00000576591 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.25■■■□□ 2.11
AKAP1-218ENST00000576591 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
AKAP1-218ENST00000576591 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.73■■■□□ 2.03
AKAP1-218ENST00000576591 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.64■■■□□ 2.01
AKAP1-218ENST00000576591 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.56■■■□□ 2
AKAP1-218ENST00000576591 SMARCA4P51532 1647 aa27.48■■□□□ 1.99
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AKAP1-218ENST00000576591 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.37■■□□□ 1.97
AKAP1-218ENST00000576591 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.25■■□□□ 1.95
AKAP1-218ENST00000576591 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.22■■□□□ 1.95
AKAP1-218ENST00000576591 SMARCA2P51531 1590 aa27.2■■□□□ 1.94
AKAP1-218ENST00000576591 NCAPD3P42695 1498 aa27.19■■□□□ 1.94
AKAP1-218ENST00000576591 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
AKAP1-218ENST00000576591 HMGXB3Q12766 1538 aa27.09■■□□□ 1.93
AKAP1-218ENST00000576591 WIZO95785 1651 aa27.08■■□□□ 1.92
AKAP1-218ENST00000576591 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
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AKAP1-218ENST00000576591 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
AKAP1-218ENST00000576591 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.49■■□□□ 1.83
AKAP1-218ENST00000576591 NESP48681 1621 aa26.46■■□□□ 1.83
AKAP1-218ENST00000576591 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.41■■□□□ 1.82
AKAP1-218ENST00000576591 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.39■■□□□ 1.82
AKAP1-218ENST00000576591 CFTRP13569 1480 aa26.32■■□□□ 1.8
AKAP1-218ENST00000576591 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.18■■□□□ 1.78
AKAP1-218ENST00000576591 ERCC6Q03468 1493 aa26.16■■□□□ 1.78
AKAP1-218ENST00000576591 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.15■■□□□ 1.78
AKAP1-218ENST00000576591 PRDM2Q13029 1718 aa26.13■■□□□ 1.77
AKAP1-218ENST00000576591 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.09■■□□□ 1.77
AKAP1-218ENST00000576591 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.02■■□□□ 1.76
AKAP1-218ENST00000576591 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
AKAP1-218ENST00000576591 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.93■■□□□ 1.74
AKAP1-218ENST00000576591 WDR62O43379 1518 aa25.87■■□□□ 1.73
AKAP1-218ENST00000576591 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
AKAP1-218ENST00000576591 CUX2O14529 1486 aa25.83■■□□□ 1.73
AKAP1-218ENST00000576591 TOPBP1Q92547 1522 aa25.73■■□□□ 1.71
AKAP1-218ENST00000576591 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.71■■□□□ 1.71
AKAP1-218ENST00000576591 ABCC8Q09428 1581 aa25.68■■□□□ 1.7
AKAP1-218ENST00000576591 CUX1P39880 1505 aa25.66■■□□□ 1.7
AKAP1-218ENST00000576591 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.68
AKAP1-218ENST00000576591 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
AKAP1-218ENST00000576591 SYNJ1O43426 1573 aa25.52■■□□□ 1.68
AKAP1-218ENST00000576591 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.5■■□□□ 1.67
AKAP1-218ENST00000576591 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.5■■□□□ 1.67
AKAP1-218ENST00000576591 TOP2BQ02880 1626 aa25.49■■□□□ 1.67
AKAP1-218ENST00000576591 IFT140Q96RY7 1462 aa25.47■■□□□ 1.67
AKAP1-218ENST00000576591 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
AKAP1-218ENST00000576591 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.41■■□□□ 1.66
AKAP1-218ENST00000576591 SOGA1O94964 1423 aa25.38■■□□□ 1.65
AKAP1-218ENST00000576591 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
AKAP1-218ENST00000576591 WDR97A6NE52 1622 aa25.32■■□□□ 1.64
AKAP1-218ENST00000576591 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.27■■□□□ 1.64
AKAP1-218ENST00000576591 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
AKAP1-218ENST00000576591 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
AKAP1-218ENST00000576591 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
AKAP1-218ENST00000576591 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.17■■□□□ 1.62
AKAP1-218ENST00000576591 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.11■■□□□ 1.61
AKAP1-218ENST00000576591 TRIM41Q8WV44 630 aa25.08■■□□□ 1.61
AKAP1-218ENST00000576591 GRIN2BQ13224 1484 aa25.07■■□□□ 1.6
AKAP1-218ENST00000576591 PBRM1Q86U86 1689 aa25.06■■□□□ 1.6
AKAP1-218ENST00000576591 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.04■■□□□ 1.6
AKAP1-218ENST00000576591 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.02■■□□□ 1.6
AKAP1-218ENST00000576591 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
AKAP1-218ENST00000576591 KIF27Q86VH2 1401 aa24.97■■□□□ 1.59
AKAP1-218ENST00000576591 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.96■■□□□ 1.59
AKAP1-218ENST00000576591 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.91■■□□□ 1.58
AKAP1-218ENST00000576591 ADAMTS12P58397 1594 aa24.9■■□□□ 1.58
AKAP1-218ENST00000576591 CHD1O14646 1710 aa24.89■■□□□ 1.57
AKAP1-218ENST00000576591 IGF1RP08069 1367 aa24.88■■□□□ 1.57
AKAP1-218ENST00000576591 SYNJ2O15056 1496 aa24.88■■□□□ 1.57
AKAP1-218ENST00000576591 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.83■■□□□ 1.57
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AKAP1-218ENST00000576591 FBLN2P98095 1184 aa24.78■■□□□ 1.56
AKAP1-218ENST00000576591 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
AKAP1-218ENST00000576591 GRIN2AQ12879 1464 aa24.76■■□□□ 1.55
AKAP1-218ENST00000576591 OSCARQ8IYS5 282 aa24.75■■□□□ 1.55
AKAP1-218ENST00000576591 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.71■■□□□ 1.55
AKAP1-218ENST00000576591 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.7■■□□□ 1.54
AKAP1-218ENST00000576591 EEA1Q15075 1411 aa24.69■■□□□ 1.54
AKAP1-218ENST00000576591 NUP160Q12769 1436 aa24.67■■□□□ 1.54
AKAP1-218ENST00000576591 CEP170Q5SW79 1584 aa24.66■■□□□ 1.54
AKAP1-218ENST00000576591 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.66■■□□□ 1.54
AKAP1-218ENST00000576591 PRXQ9BXM0 1461 aa24.63■■□□□ 1.53
AKAP1-218ENST00000576591 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.6■■□□□ 1.53
AKAP1-218ENST00000576591 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.6■■□□□ 1.53
AKAP1-218ENST00000576591 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
AKAP1-218ENST00000576591 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.46■■□□□ 1.51
AKAP1-218ENST00000576591 KIF21BO75037 1637 aa24.46■■□□□ 1.51
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