RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314126.4

AKAP1-201, Transcript of A-kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AKAP1, Length 2,380 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP1-201ENST00000314126 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.2■■■□□ 2.91
AKAP1-201ENST00000314126 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.65■■■□□ 2.18
AKAP1-201ENST00000314126 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
AKAP1-201ENST00000314126 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.56■■■□□ 2
AKAP1-201ENST00000314126 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.46■■□□□ 1.99
AKAP1-201ENST00000314126 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.13■■□□□ 1.93
AKAP1-201ENST00000314126 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.86■■□□□ 1.89
AKAP1-201ENST00000314126 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
AKAP1-201ENST00000314126 NACADO15069 1562 aa26.49■■□□□ 1.83
AKAP1-201ENST00000314126 ABCC9O60706 1549 aa26.45■■□□□ 1.83
AKAP1-201ENST00000314126 SCRIBQ14160 1630 aa26.44■■□□□ 1.82
AKAP1-201ENST00000314126 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.1■■□□□ 1.77
AKAP1-201ENST00000314126 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.07■■□□□ 1.76
AKAP1-201ENST00000314126 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
AKAP1-201ENST00000314126 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.76■■□□□ 1.71
AKAP1-201ENST00000314126 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.71■■□□□ 1.71
AKAP1-201ENST00000314126 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.7■■□□□ 1.7
AKAP1-201ENST00000314126 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
AKAP1-201ENST00000314126 WIZO95785 1651 aa25.54■■□□□ 1.68
AKAP1-201ENST00000314126 SMARCA4P51532 1647 aa25.4■■□□□ 1.66
AKAP1-201ENST00000314126 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.36■■□□□ 1.65
AKAP1-201ENST00000314126 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.64
AKAP1-201ENST00000314126 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
AKAP1-201ENST00000314126 TRIM41Q8WV44 630 aa25.16■■□□□ 1.62
AKAP1-201ENST00000314126 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.1■■□□□ 1.61
AKAP1-201ENST00000314126 SMARCA2P51531 1590 aa25.07■■□□□ 1.6
AKAP1-201ENST00000314126 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
AKAP1-201ENST00000314126 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.06■■□□□ 1.6
AKAP1-201ENST00000314126 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.01■■□□□ 1.59
AKAP1-201ENST00000314126 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.78■■□□□ 1.56
AKAP1-201ENST00000314126 ABCC8Q09428 1581 aa24.74■■□□□ 1.55
AKAP1-201ENST00000314126 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
AKAP1-201ENST00000314126 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
AKAP1-201ENST00000314126 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.66■■□□□ 1.54
AKAP1-201ENST00000314126 HRCP23327 699 aa24.54■■□□□ 1.52
AKAP1-201ENST00000314126 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
AKAP1-201ENST00000314126 HMGXB3Q12766 1538 aa24.49■■□□□ 1.51
AKAP1-201ENST00000314126 EEA1Q15075 1411 aa24.46■■□□□ 1.51
AKAP1-201ENST00000314126 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
AKAP1-201ENST00000314126 NCAPD3P42695 1498 aa24.45■■□□□ 1.5
AKAP1-201ENST00000314126 SOGA1O94964 1423 aa24.39■■□□□ 1.5
AKAP1-201ENST00000314126 SYNJ1O43426 1573 aa24.37■■□□□ 1.49
AKAP1-201ENST00000314126 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.36■■□□□ 1.49
AKAP1-201ENST00000314126 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.28■■□□□ 1.48
AKAP1-201ENST00000314126 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.24■■□□□ 1.47
AKAP1-201ENST00000314126 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.22■■□□□ 1.47
AKAP1-201ENST00000314126 TOP2BQ02880 1626 aa24.22■■□□□ 1.47
AKAP1-201ENST00000314126 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.19■■□□□ 1.46
AKAP1-201ENST00000314126 GOLGA3Q08378 1498 aa24.17■■□□□ 1.46
AKAP1-201ENST00000314126 KIF21BO75037 1637 aa24.15■■□□□ 1.46
AKAP1-201ENST00000314126 CEP162Q5TB80 1403 aa24.15■■□□□ 1.46
AKAP1-201ENST00000314126 CFTRP13569 1480 aa24.1■■□□□ 1.45
AKAP1-201ENST00000314126 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.1■■□□□ 1.45
AKAP1-201ENST00000314126 PRDM2Q13029 1718 aa24.1■■□□□ 1.45
AKAP1-201ENST00000314126 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
AKAP1-201ENST00000314126 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.98■■□□□ 1.43
AKAP1-201ENST00000314126 CUX1P39880 1505 aa23.98■■□□□ 1.43
AKAP1-201ENST00000314126 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.87■■□□□ 1.41
AKAP1-201ENST00000314126 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
AKAP1-201ENST00000314126 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.86■■□□□ 1.41
AKAP1-201ENST00000314126 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.85■■□□□ 1.41
AKAP1-201ENST00000314126 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
AKAP1-201ENST00000314126 PRXQ9BXM0 1461 aa23.81■■□□□ 1.4
AKAP1-201ENST00000314126 CLIP1P30622 1438 aa23.8■■□□□ 1.4
AKAP1-201ENST00000314126 KIF27Q86VH2 1401 aa23.76■■□□□ 1.39
AKAP1-201ENST00000314126 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.7■■□□□ 1.38
AKAP1-201ENST00000314126 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.62■■□□□ 1.37
AKAP1-201ENST00000314126 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.6■■□□□ 1.37
AKAP1-201ENST00000314126 CUX2O14529 1486 aa23.56■■□□□ 1.36
AKAP1-201ENST00000314126 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.55■■□□□ 1.36
AKAP1-201ENST00000314126 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.52■■□□□ 1.35
AKAP1-201ENST00000314126 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
AKAP1-201ENST00000314126 ARAP1Q96P48 1450 aa23.51■■□□□ 1.35
AKAP1-201ENST00000314126 IGF1RP08069 1367 aa23.49■■□□□ 1.35
AKAP1-201ENST00000314126 NESP48681 1621 aa23.47■■□□□ 1.35
AKAP1-201ENST00000314126 TOPBP1Q92547 1522 aa23.45■■□□□ 1.34
AKAP1-201ENST00000314126 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
AKAP1-201ENST00000314126 APLP2Q06481 763 aa23.41■■□□□ 1.34
AKAP1-201ENST00000314126 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.41■■□□□ 1.34
AKAP1-201ENST00000314126 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
AKAP1-201ENST00000314126 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
AKAP1-201ENST00000314126 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.38■■□□□ 1.33
AKAP1-201ENST00000314126 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
AKAP1-201ENST00000314126 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.37■■□□□ 1.33
AKAP1-201ENST00000314126 WDR97A6NE52 1622 aa23.32■■□□□ 1.32
AKAP1-201ENST00000314126 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.31■■□□□ 1.32
AKAP1-201ENST00000314126 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
AKAP1-201ENST00000314126 CUL7Q14999 1698 aa23.28■■□□□ 1.32
AKAP1-201ENST00000314126 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.27■■□□□ 1.32
AKAP1-201ENST00000314126 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.22■■□□□ 1.31
AKAP1-201ENST00000314126 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.19■■□□□ 1.3
AKAP1-201ENST00000314126 MAP3K1Q13233 1512 aa23.18■■□□□ 1.3
AKAP1-201ENST00000314126 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.16■■□□□ 1.3
AKAP1-201ENST00000314126 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.15■■□□□ 1.3
AKAP1-201ENST00000314126 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
AKAP1-201ENST00000314126 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
AKAP1-201ENST00000314126 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
AKAP1-201ENST00000314126 TIAM1Q13009 1591 aa23.11■■□□□ 1.29
AKAP1-201ENST00000314126 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.11■■□□□ 1.29
AKAP1-201ENST00000314126 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.08■■□□□ 1.29
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