RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395873.7

ZNF248-204, Transcript of zinc finger protein 248, humanhuman

TSL 3

Gene ZNF248, Length 698 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248-204ENST00000395873 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.33■■■■■ 6.29
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ZNF248-204ENST00000395873 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.04■■■■■ 4.96
ZNF248-204ENST00000395873 NACADO15069 1562 aa45.85■■■■■ 4.93
ZNF248-204ENST00000395873 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.5■■■■■ 4.87
ZNF248-204ENST00000395873 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.42■■■■■ 4.86
ZNF248-204ENST00000395873 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.15■■■■■ 4.82
ZNF248-204ENST00000395873 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.01■■■■■ 4.8
ZNF248-204ENST00000395873 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.01■■■■■ 4.8
ZNF248-204ENST00000395873 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.58■■■■■ 4.73
ZNF248-204ENST00000395873 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.52■■■■■ 4.72
ZNF248-204ENST00000395873 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.25■■■■■ 4.67
ZNF248-204ENST00000395873 SCRIBQ14160 1630 aa44.24■■■■■ 4.67
ZNF248-204ENST00000395873 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.21■■■■■ 4.67
ZNF248-204ENST00000395873 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
ZNF248-204ENST00000395873 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.4■■■■■ 4.54
ZNF248-204ENST00000395873 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.15■■■■■ 4.5
ZNF248-204ENST00000395873 SMARCA4P51532 1647 aa42.31■■■■■ 4.36
ZNF248-204ENST00000395873 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
ZNF248-204ENST00000395873 NCAPD3P42695 1498 aa42.21■■■■■ 4.35
ZNF248-204ENST00000395873 SMARCA2P51531 1590 aa42.18■■■■■ 4.34
ZNF248-204ENST00000395873 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.13■■■■■ 4.34
ZNF248-204ENST00000395873 HMGXB3Q12766 1538 aa42.05■■■■■ 4.32
ZNF248-204ENST00000395873 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.93■■■■■ 4.3
ZNF248-204ENST00000395873 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
ZNF248-204ENST00000395873 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.79■■■■■ 4.28
ZNF248-204ENST00000395873 ERCC6Q03468 1493 aa41.44■■■■■ 4.22
ZNF248-204ENST00000395873 WIZO95785 1651 aa41.39■■■■■ 4.22
ZNF248-204ENST00000395873 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.29■■■■■ 4.2
ZNF248-204ENST00000395873 NESP48681 1621 aa41.26■■■■■ 4.2
ZNF248-204ENST00000395873 CUX2O14529 1486 aa41.21■■■■■ 4.19
ZNF248-204ENST00000395873 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
ZNF248-204ENST00000395873 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.98■■■■■ 4.15
ZNF248-204ENST00000395873 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
ZNF248-204ENST00000395873 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.94■■■■■ 4.15
ZNF248-204ENST00000395873 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.94■■■■■ 4.14
ZNF248-204ENST00000395873 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
ZNF248-204ENST00000395873 CFTRP13569 1480 aa40.61■■■■■ 4.09
ZNF248-204ENST00000395873 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.57■■■■■ 4.08
ZNF248-204ENST00000395873 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.53■■■■■ 4.08
ZNF248-204ENST00000395873 PRDM2Q13029 1718 aa40.51■■■■■ 4.08
ZNF248-204ENST00000395873 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.49■■■■■ 4.07
ZNF248-204ENST00000395873 WDR62O43379 1518 aa40.47■■■■■ 4.07
ZNF248-204ENST00000395873 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.41■■■■■ 4.06
ZNF248-204ENST00000395873 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.38■■■■■ 4.05
ZNF248-204ENST00000395873 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
ZNF248-204ENST00000395873 ABCC8Q09428 1581 aa39.88■■■■□ 3.97
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ZNF248-204ENST00000395873 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.76■■■■□ 3.96
ZNF248-204ENST00000395873 IFT140Q96RY7 1462 aa39.7■■■■□ 3.95
ZNF248-204ENST00000395873 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
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ZNF248-204ENST00000395873 CUX1P39880 1505 aa39.26■■■■□ 3.88
ZNF248-204ENST00000395873 WDR97A6NE52 1622 aa39.24■■■■□ 3.87
ZNF248-204ENST00000395873 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.24■■■■□ 3.87
ZNF248-204ENST00000395873 SOGA1O94964 1423 aa39.23■■■■□ 3.87
ZNF248-204ENST00000395873 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.17■■■■□ 3.86
ZNF248-204ENST00000395873 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.16■■■■□ 3.86
ZNF248-204ENST00000395873 CHD1O14646 1710 aa39.06■■■■□ 3.84
ZNF248-204ENST00000395873 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
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ZNF248-204ENST00000395873 TOP2BQ02880 1626 aa38.89■■■■□ 3.82
ZNF248-204ENST00000395873 GRIN2BQ13224 1484 aa38.88■■■■□ 3.81
ZNF248-204ENST00000395873 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.87■■■■□ 3.81
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ZNF248-204ENST00000395873 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.86■■■■□ 3.81
ZNF248-204ENST00000395873 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.86■■■■□ 3.81
ZNF248-204ENST00000395873 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.86■■■■□ 3.81
ZNF248-204ENST00000395873 TRIM41Q8WV44 630 aa38.83■■■■□ 3.81
ZNF248-204ENST00000395873 FBLN2P98095 1184 aa38.82■■■■□ 3.8
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ZNF248-204ENST00000395873 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.81■■■■□ 3.8
ZNF248-204ENST00000395873 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.81■■■■□ 3.8
ZNF248-204ENST00000395873 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.79■■■■□ 3.8
ZNF248-204ENST00000395873 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.78■■■■□ 3.8
ZNF248-204ENST00000395873 SYNJ1O43426 1573 aa38.77■■■■□ 3.8
ZNF248-204ENST00000395873 ARHGEF11O15085 1522 aa38.72■■■■□ 3.79
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ZNF248-204ENST00000395873 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.68■■■■□ 3.78
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ZNF248-204ENST00000395873 ADAMTS12P58397 1594 aa38.44■■■■□ 3.74
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ZNF248-204ENST00000395873 ARAP1Q96P48 1450 aa38.32■■■■□ 3.72
ZNF248-204ENST00000395873 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.3■■■■□ 3.72
ZNF248-204ENST00000395873 NUP160Q12769 1436 aa38.19■■■■□ 3.7
ZNF248-204ENST00000395873 CEP170Q5SW79 1584 aa38.18■■■■□ 3.7
ZNF248-204ENST00000395873 KIF27Q86VH2 1401 aa38.12■■■■□ 3.69
ZNF248-204ENST00000395873 CUL7Q14999 1698 aa38.07■■■■□ 3.68
ZNF248-204ENST00000395873 SHROOM2Q13796 1616 aa38.04■■■■□ 3.68
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ZNF248-204ENST00000395873 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.9■■■■□ 3.66
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ZNF248-204ENST00000395873 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.76■■■■□ 3.63
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