Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NICN1Q9BSH3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NICN1Q9BSH3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NICN1Q9BSH3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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