RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378268.1

EBPL-202, Transcript of EBP like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene EBPL, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBPL-202ENST00000378268 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.27■■■■■ 8.2
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EBPL-202ENST00000378268 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.69■■■■■ 6.51
EBPL-202ENST00000378268 NACADO15069 1562 aa55.56■■■■■ 6.48
EBPL-202ENST00000378268 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.51■■■■■ 6.48
EBPL-202ENST00000378268 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.17■■■■■ 6.42
EBPL-202ENST00000378268 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.13■■■■■ 6.42
EBPL-202ENST00000378268 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.82■■■■■ 6.37
EBPL-202ENST00000378268 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.42■■■■■ 6.3
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EBPL-202ENST00000378268 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.97■■■■■ 6.23
EBPL-202ENST00000378268 SCRIBQ14160 1630 aa53.88■■■■■ 6.22
EBPL-202ENST00000378268 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.4■■■■■ 6.14
EBPL-202ENST00000378268 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.34■■■■■ 6.13
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EBPL-202ENST00000378268 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.44■■■■■ 5.98
EBPL-202ENST00000378268 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.12■■■■■ 5.93
EBPL-202ENST00000378268 SMARCA4P51532 1647 aa51.49■■■■■ 5.83
EBPL-202ENST00000378268 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.41■■■■■ 5.82
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EBPL-202ENST00000378268 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.24■■■■■ 5.79
EBPL-202ENST00000378268 SMARCA2P51531 1590 aa51.2■■■■■ 5.79
EBPL-202ENST00000378268 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.08■■■■■ 5.77
EBPL-202ENST00000378268 HMGXB3Q12766 1538 aa50.99■■■■■ 5.75
EBPL-202ENST00000378268 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.97■■■■■ 5.75
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EBPL-202ENST00000378268 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.41■■■■■ 5.66
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EBPL-202ENST00000378268 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.75■■■■■ 5.55
EBPL-202ENST00000378268 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.63■■■■■ 5.54
EBPL-202ENST00000378268 CUX2O14529 1486 aa49.54■■■■■ 5.52
EBPL-202ENST00000378268 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.52■■■■■ 5.52
EBPL-202ENST00000378268 CFTRP13569 1480 aa49.41■■■■■ 5.5
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EBPL-202ENST00000378268 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.17■■■■■ 5.46
EBPL-202ENST00000378268 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.13■■■■■ 5.46
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EBPL-202ENST00000378268 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.01■■■■■ 5.44
EBPL-202ENST00000378268 WDR62O43379 1518 aa48.97■■■■■ 5.43
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EBPL-202ENST00000378268 TOPBP1Q92547 1522 aa48.38■■■■■ 5.34
EBPL-202ENST00000378268 ABCC8Q09428 1581 aa48.38■■■■■ 5.33
EBPL-202ENST00000378268 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.32■■■■■ 5.33
EBPL-202ENST00000378268 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.23■■■■■ 5.31
EBPL-202ENST00000378268 IFT140Q96RY7 1462 aa48.14■■■■■ 5.3
EBPL-202ENST00000378268 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.96■■■■■ 5.27
EBPL-202ENST00000378268 CUX1P39880 1505 aa47.93■■■■■ 5.26
EBPL-202ENST00000378268 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.92■■■■■ 5.26
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EBPL-202ENST00000378268 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.82■■■■■ 5.25
EBPL-202ENST00000378268 SOGA1O94964 1423 aa47.76■■■■■ 5.24
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EBPL-202ENST00000378268 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.75■■■■■ 5.23
EBPL-202ENST00000378268 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.63■■■■■ 5.22
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EBPL-202ENST00000378268 WDR97A6NE52 1622 aa47.5■■■■■ 5.19
EBPL-202ENST00000378268 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.48■■■■■ 5.19
EBPL-202ENST00000378268 TOP2BQ02880 1626 aa47.48■■■■■ 5.19
EBPL-202ENST00000378268 SYNJ1O43426 1573 aa47.45■■■■■ 5.19
EBPL-202ENST00000378268 OSCARQ8IYS5 282 aa47.45■■■■■ 5.19
EBPL-202ENST00000378268 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.34■■■■■ 5.17
EBPL-202ENST00000378268 GRIN2BQ13224 1484 aa47.23■■■■■ 5.15
EBPL-202ENST00000378268 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.21■■■■■ 5.15
EBPL-202ENST00000378268 CHD1O14646 1710 aa47.21■■■■■ 5.15
EBPL-202ENST00000378268 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.21■■■■■ 5.15
EBPL-202ENST00000378268 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.18■■■■■ 5.14
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EBPL-202ENST00000378268 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.13■■■■■ 5.13
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EBPL-202ENST00000378268 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.78■■■■■ 5.08
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EBPL-202ENST00000378268 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.72■■■■■ 5.07
EBPL-202ENST00000378268 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.72■■■■■ 5.07
EBPL-202ENST00000378268 ARHGEF11O15085 1522 aa46.68■■■■■ 5.06
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EBPL-202ENST00000378268 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.65■■■■■ 5.06
EBPL-202ENST00000378268 TRIM41Q8WV44 630 aa46.62■■■■■ 5.05
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EBPL-202ENST00000378268 KIF27Q86VH2 1401 aa46.59■■■■■ 5.05
EBPL-202ENST00000378268 NUP160Q12769 1436 aa46.41■■■■■ 5.02
EBPL-202ENST00000378268 CEP170Q5SW79 1584 aa46.4■■■■■ 5.02
EBPL-202ENST00000378268 IGF1RP08069 1367 aa46.39■■■■■ 5.02
EBPL-202ENST00000378268 CUL7Q14999 1698 aa46.33■■■■■ 5.01
EBPL-202ENST00000378268 ARAP1Q96P48 1450 aa46.29■■■■■ 5
EBPL-202ENST00000378268 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.26■■■■■ 5
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EBPL-202ENST00000378268 SHROOM2Q13796 1616 aa46.09■■■■■ 4.97
EBPL-202ENST00000378268 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.08■■■■■ 4.97
EBPL-202ENST00000378268 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46■■■■■ 4.95
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