Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NICN1Q9BSH3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NICN1Q9BSH3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NICN1Q9BSH3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NICN1Q9BSH3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NICN1Q9BSH3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NICN1Q9BSH3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NICN1Q9BSH3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NICN1Q9BSH3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NICN1Q9BSH3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NICN1Q9BSH3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NICN1Q9BSH3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NICN1Q9BSH3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NICN1Q9BSH3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NICN1Q9BSH3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NICN1Q9BSH3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NICN1Q9BSH3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NICN1Q9BSH3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NICN1Q9BSH3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NICN1Q9BSH3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NICN1Q9BSH3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NICN1Q9BSH3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NICN1Q9BSH3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NICN1Q9BSH3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NICN1Q9BSH3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NICN1Q9BSH3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NICN1Q9BSH3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NICN1Q9BSH3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NICN1Q9BSH3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NICN1Q9BSH3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NICN1Q9BSH3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NICN1Q9BSH3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NICN1Q9BSH3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NICN1Q9BSH3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NICN1Q9BSH3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NICN1Q9BSH3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NICN1Q9BSH3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NICN1Q9BSH3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NICN1Q9BSH3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NICN1Q9BSH3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NICN1Q9BSH3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NICN1Q9BSH3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NICN1Q9BSH3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NICN1Q9BSH3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NICN1Q9BSH3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NICN1Q9BSH3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NICN1Q9BSH3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NICN1Q9BSH3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NICN1Q9BSH3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NICN1Q9BSH3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NICN1Q9BSH3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NICN1Q9BSH3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NICN1Q9BSH3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NICN1Q9BSH3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NICN1Q9BSH3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NICN1Q9BSH3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NICN1Q9BSH3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NICN1Q9BSH3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NICN1Q9BSH3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NICN1Q9BSH3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NICN1Q9BSH3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NICN1Q9BSH3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NICN1Q9BSH3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NICN1Q9BSH3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NICN1Q9BSH3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NICN1Q9BSH3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NICN1Q9BSH3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NICN1Q9BSH3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NICN1Q9BSH3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NICN1Q9BSH3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NICN1Q9BSH3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NICN1Q9BSH3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NICN1Q9BSH3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NICN1Q9BSH3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NICN1Q9BSH3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NICN1Q9BSH3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NICN1Q9BSH3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NICN1Q9BSH3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NICN1Q9BSH3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NICN1Q9BSH3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NICN1Q9BSH3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NICN1Q9BSH3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NICN1Q9BSH3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NICN1Q9BSH3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NICN1Q9BSH3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NICN1Q9BSH3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NICN1Q9BSH3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NICN1Q9BSH3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NICN1Q9BSH3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NICN1Q9BSH3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NICN1Q9BSH3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NICN1Q9BSH3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NICN1Q9BSH3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NICN1Q9BSH3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NICN1Q9BSH3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NICN1Q9BSH3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NICN1Q9BSH3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NICN1Q9BSH3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NICN1Q9BSH3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NICN1Q9BSH3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms