Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPA33Q99795 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPA33Q99795 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPA33Q99795 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPA33Q99795 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPA33Q99795 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GPA33Q99795 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPA33Q99795 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPA33Q99795 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPA33Q99795 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPA33Q99795 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPA33Q99795 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPA33Q99795 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPA33Q99795 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms