RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 NISCHQ9Y2I1 1504 aa69.08■■■■■ 8.65
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCC9O60706 1549 aa62.84■■■■■ 7.65
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa62.13■■■■■ 7.54
CAPNS1-217ENST00000629983 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa59.49■■■■■ 7.11
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC5BQ9UF47 199 aa59.32■■■■■ 7.09
CAPNS1-217ENST00000629983 NACADO15069 1562 aa58.92■■■■■ 7.02
CAPNS1-217ENST00000629983 DCAF8L2P0C7V8 631 aa58.8■■■■■ 7
CAPNS1-217ENST00000629983 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP58.47■■■■■ 6.95
CAPNS1-217ENST00000629983 UNC13AQ9UPW8 1703 aa57.95■■■■■ 6.87
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO15BQ96JP2 1530 aa57.87■■■■■ 6.85
CAPNS1-217ENST00000629983 BICRAQ9NZM4 1560 aa57.69■■■■■ 6.83
CAPNS1-217ENST00000629983 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP57.15■■■■■ 6.74
CAPNS1-217ENST00000629983 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.95■■■■■ 6.71
CAPNS1-217ENST00000629983 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa56.9■■■■■ 6.7
CAPNS1-217ENST00000629983 SCRIBQ14160 1630 aa56.74■■■■■ 6.67
CAPNS1-217ENST00000629983 CECR2Q9BXF3 1484 aa56.64■■■■■ 6.66
CAPNS1-217ENST00000629983 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa56.63■■■■■ 6.66
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP56.39■■■■■ 6.62
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa54.87■■■■■ 6.37
CAPNS1-217ENST00000629983 NCAPD3P42695 1498 aa54.41■■■■■ 6.3
CAPNS1-217ENST00000629983 ERCC6Q03468 1493 aa54.35■■■■■ 6.29
CAPNS1-217ENST00000629983 CUX2O14529 1486 aa54.3■■■■■ 6.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54.21■■■■■ 6.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SMARCA2P51531 1590 aa54.03■■■■■ 6.24
CAPNS1-217ENST00000629983 SMARCA4P51532 1647 aa53.99■■■■■ 6.23
CAPNS1-217ENST00000629983 HMGXB3Q12766 1538 aa53.95■■■■■ 6.23
CAPNS1-217ENST00000629983 NESP48681 1621 aa53.79■■■■■ 6.2
CAPNS1-217ENST00000629983 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53.71■■■■■ 6.19
CAPNS1-217ENST00000629983 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP53.68■■■■■ 6.18
CAPNS1-217ENST00000629983 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.39■■■■■ 6.14
CAPNS1-217ENST00000629983 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP53.27■■■■■ 6.12
CAPNS1-217ENST00000629983 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa53.26■■■■■ 6.12
CAPNS1-217ENST00000629983 MROH2BQ7Z745 1585 aa53.24■■■■■ 6.11
CAPNS1-217ENST00000629983 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53.08■■■■■ 6.09
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa52.97■■■■■ 6.07
CAPNS1-217ENST00000629983 CADPSQ9ULU8 1353 aa52.8■■■■■ 6.04
CAPNS1-217ENST00000629983 MRC2Q9UBG0 1479 aa52.63■■■■■ 6.01
CAPNS1-217ENST00000629983 WIZO95785 1651 aa52.55■■■■■ 6
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR62O43379 1518 aa52.45■■■■■ 5.99
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM41Q8WV44 630 aa52.44■■■■■ 5.99
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP164Q9UPV0 1460 aa52.34■■■■■ 5.97
CAPNS1-217ENST00000629983 FANCD2Q9BXW9 1451 aa52.22■■■■■ 5.95
CAPNS1-217ENST00000629983 CFTRP13569 1480 aa52.05■■■■■ 5.92
CAPNS1-217ENST00000629983 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.97■■■■■ 5.91
CAPNS1-217ENST00000629983 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.89■■■■■ 5.9
CAPNS1-217ENST00000629983 OSCARQ8IYS5 282 aa51.81■■■■■ 5.88
CAPNS1-217ENST00000629983 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP51.78■■■■■ 5.88
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC88BA6NC98 1476 aa51.32■■■■■ 5.81
CAPNS1-217ENST00000629983 PRDM2Q13029 1718 aa51.32■■■■■ 5.81
CAPNS1-217ENST00000629983 IFT140Q96RY7 1462 aa51.29■■■■■ 5.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP51.25■■■■■ 5.79
CAPNS1-217ENST00000629983 TOPBP1Q92547 1522 aa51.14■■■■■ 5.78
CAPNS1-217ENST00000629983 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa51.09■■■■■ 5.77
CAPNS1-217ENST00000629983 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa51.09■■■■■ 5.77
CAPNS1-217ENST00000629983 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa51.09■■■■■ 5.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCC8Q09428 1581 aa50.98■■■■■ 5.75
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF11O15085 1522 aa50.92■■■■■ 5.74
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP50.91■■■■■ 5.74
CAPNS1-217ENST00000629983 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.89■■■■■ 5.74
CAPNS1-217ENST00000629983 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP50.75■■■■■ 5.718e-9■□□□□ 10.5
CAPNS1-217ENST00000629983 CYB5RLQ6IPT4 315 aa50.68■■■■■ 5.7
CAPNS1-217ENST00000629983 FBLN2P98095 1184 aa50.67■■■■■ 5.7
CAPNS1-217ENST00000629983 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP50.64■■■■■ 5.7
CAPNS1-217ENST00000629983 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.59■■■■■ 5.69
CAPNS1-217ENST00000629983 CHD1O14646 1710 aa50.56■■■■■ 5.68
CAPNS1-217ENST00000629983 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50.46■■■■■ 5.67
CAPNS1-217ENST00000629983 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.4■■■■■ 5.66
CAPNS1-217ENST00000629983 ARAP1Q96P48 1450 aa50.39■■■■■ 5.66
CAPNS1-217ENST00000629983 SOGA1O94964 1423 aa50.39■■■■■ 5.66
CAPNS1-217ENST00000629983 TRHP20396 242 aaPredicted RBP50.37■■■■■ 5.65
CAPNS1-217ENST00000629983 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa50.24■■■■■ 5.63
CAPNS1-217ENST00000629983 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.23■■■■■ 5.63
CAPNS1-217ENST00000629983 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP50.15■■■■■ 5.62
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR97A6NE52 1622 aa50.09■■■■■ 5.61
CAPNS1-217ENST00000629983 CUX1P39880 1505 aa50.06■■■■■ 5.6
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP50.02■■■■■ 5.6
CAPNS1-217ENST00000629983 GRIN2BQ13224 1484 aa50.01■■■■■ 5.6
CAPNS1-217ENST00000629983 CLASP1Q7Z460 1538 aa50.01■■■■■ 5.6
CAPNS1-217ENST00000629983 SYNJ1O43426 1573 aa50■■■■■ 5.59
CAPNS1-217ENST00000629983 SYNJ2O15056 1496 aa49.88■■■■■ 5.57
CAPNS1-217ENST00000629983 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.76■■■■■ 5.56
CAPNS1-217ENST00000629983 PBRM1Q86U86 1689 aa49.66■■■■■ 5.54
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.59■■■■■ 5.53
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49.51■■■■■ 5.52
CAPNS1-217ENST00000629983 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.49■■■■■ 5.51
CAPNS1-217ENST00000629983 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.35■■■■■ 5.49
CAPNS1-217ENST00000629983 GRIN2AQ12879 1464 aa49.34■■■■■ 5.49
CAPNS1-217ENST00000629983 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP49.31■■■■■ 5.48
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAMTS12P58397 1594 aa49.23■■■■■ 5.47
CAPNS1-217ENST00000629983 ERCC6L2Q5T890 1561 aa49.23■■■■■ 5.47
CAPNS1-217ENST00000629983 NUP160Q12769 1436 aa49.17■■■■■ 5.46
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP170Q5SW79 1584 aa49.15■■■■■ 5.46
CAPNS1-217ENST00000629983 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49.11■■■■■ 5.45
CAPNS1-217ENST00000629983 TOP2BQ02880 1626 aa49.08■■■■■ 5.45
CAPNS1-217ENST00000629983 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.05■■■■■ 5.44
CAPNS1-217ENST00000629983 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.94■■■■■ 5.43
CAPNS1-217ENST00000629983 SHROOM2Q13796 1616 aa48.92■■■■■ 5.42
CAPNS1-217ENST00000629983 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP48.82■■■■■ 5.41
CAPNS1-217ENST00000629983 JPH4Q96JJ6 628 aa48.73■■■■■ 5.39
CAPNS1-217ENST00000629983 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.53■■■■■ 5.36
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