Protein–RNA interactions for Protein: Q92759

GTF2H4, General transcription factor IIH subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H4Q92759 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2H4Q92759 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2H4Q92759 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2H4Q92759 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2H4Q92759 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2H4Q92759 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2H4Q92759 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2H4Q92759 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2H4Q92759 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2H4Q92759 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2H4Q92759 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2H4Q92759 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2H4Q92759 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2H4Q92759 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2H4Q92759 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2H4Q92759 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2H4Q92759 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2H4Q92759 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H4Q92759 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H4Q92759 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H4Q92759 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H4Q92759 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF2H4Q92759 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2H4Q92759 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2H4Q92759 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H4Q92759 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H4Q92759 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H4Q92759 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H4Q92759 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H4Q92759 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H4Q92759 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H4Q92759 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H4Q92759 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H4Q92759 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H4Q92759 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H4Q92759 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H4Q92759 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H4Q92759 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H4Q92759 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H4Q92759 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2H4Q92759 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2H4Q92759 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2H4Q92759 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2H4Q92759 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2H4Q92759 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms