Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTY1

SLC16A9, Monocarboxylate transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A9Q7RTY1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC16A9Q7RTY1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC16A9Q7RTY1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC16A9Q7RTY1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A9Q7RTY1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC16A9Q7RTY1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC16A9Q7RTY1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC16A9Q7RTY1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC16A9Q7RTY1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC16A9Q7RTY1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC16A9Q7RTY1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC16A9Q7RTY1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC16A9Q7RTY1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC16A9Q7RTY1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC16A9Q7RTY1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC16A9Q7RTY1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC16A9Q7RTY1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC16A9Q7RTY1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC16A9Q7RTY1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC16A9Q7RTY1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC16A9Q7RTY1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC16A9Q7RTY1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC16A9Q7RTY1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC16A9Q7RTY1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms