Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC153Q494R4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC153Q494R4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC153Q494R4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC153Q494R4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC153Q494R4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC153Q494R4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC153Q494R4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC153Q494R4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC153Q494R4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC153Q494R4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC153Q494R4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC153Q494R4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC153Q494R4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC153Q494R4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC153Q494R4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC153Q494R4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC153Q494R4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC153Q494R4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC153Q494R4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC153Q494R4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC153Q494R4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC153Q494R4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC153Q494R4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC153Q494R4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC153Q494R4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC153Q494R4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC153Q494R4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC153Q494R4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC153Q494R4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC153Q494R4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC153Q494R4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC153Q494R4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC153Q494R4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC153Q494R4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC153Q494R4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC153Q494R4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC153Q494R4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC153Q494R4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC153Q494R4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC153Q494R4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC153Q494R4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC153Q494R4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC153Q494R4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC153Q494R4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC153Q494R4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC153Q494R4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC153Q494R4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC153Q494R4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC153Q494R4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC153Q494R4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms