Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGR3Q06889 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGR3Q06889 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGR3Q06889 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGR3Q06889 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGR3Q06889 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGR3Q06889 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGR3Q06889 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGR3Q06889 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGR3Q06889 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EGR3Q06889 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGR3Q06889 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EGR3Q06889 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EGR3Q06889 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EGR3Q06889 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EGR3Q06889 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGR3Q06889 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EGR3Q06889 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EGR3Q06889 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGR3Q06889 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGR3Q06889 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGR3Q06889 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EGR3Q06889 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGR3Q06889 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGR3Q06889 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGR3Q06889 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EGR3Q06889 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EGR3Q06889 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EGR3Q06889 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EGR3Q06889 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGR3Q06889 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGR3Q06889 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGR3Q06889 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGR3Q06889 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGR3Q06889 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGR3Q06889 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EGR3Q06889 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms