Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UFM1P61960 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UFM1P61960 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UFM1P61960 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UFM1P61960 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UFM1P61960 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UFM1P61960 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UFM1P61960 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UFM1P61960 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UFM1P61960 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UFM1P61960 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UFM1P61960 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UFM1P61960 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UFM1P61960 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UFM1P61960 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UFM1P61960 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UFM1P61960 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UFM1P61960 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UFM1P61960 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UFM1P61960 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UFM1P61960 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UFM1P61960 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UFM1P61960 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UFM1P61960 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UFM1P61960 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UFM1P61960 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UFM1P61960 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UFM1P61960 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UFM1P61960 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UFM1P61960 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UFM1P61960 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UFM1P61960 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UFM1P61960 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UFM1P61960 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UFM1P61960 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UFM1P61960 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UFM1P61960 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UFM1P61960 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UFM1P61960 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UFM1P61960 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UFM1P61960 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UFM1P61960 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UFM1P61960 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UFM1P61960 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UFM1P61960 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UFM1P61960 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UFM1P61960 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UFM1P61960 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UFM1P61960 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UFM1P61960 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UFM1P61960 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UFM1P61960 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UFM1P61960 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UFM1P61960 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UFM1P61960 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UFM1P61960 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UFM1P61960 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UFM1P61960 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UFM1P61960 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UFM1P61960 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UFM1P61960 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UFM1P61960 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UFM1P61960 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UFM1P61960 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UFM1P61960 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UFM1P61960 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UFM1P61960 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UFM1P61960 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UFM1P61960 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFM1P61960 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFM1P61960 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UFM1P61960 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFM1P61960 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UFM1P61960 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UFM1P61960 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UFM1P61960 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UFM1P61960 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UFM1P61960 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UFM1P61960 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UFM1P61960 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UFM1P61960 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UFM1P61960 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UFM1P61960 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UFM1P61960 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UFM1P61960 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UFM1P61960 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UFM1P61960 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UFM1P61960 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UFM1P61960 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UFM1P61960 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UFM1P61960 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UFM1P61960 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UFM1P61960 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UFM1P61960 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UFM1P61960 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UFM1P61960 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UFM1P61960 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UFM1P61960 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UFM1P61960 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UFM1P61960 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms