Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA8P53708 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA8P53708 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA8P53708 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA8P53708 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA8P53708 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA8P53708 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA8P53708 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA8P53708 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA8P53708 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA8P53708 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA8P53708 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA8P53708 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA8P53708 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA8P53708 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA8P53708 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA8P53708 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA8P53708 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA8P53708 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA8P53708 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA8P53708 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA8P53708 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA8P53708 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA8P53708 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA8P53708 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA8P53708 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA8P53708 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA8P53708 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA8P53708 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA8P53708 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA8P53708 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA8P53708 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA8P53708 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA8P53708 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA8P53708 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA8P53708 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA8P53708 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA8P53708 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGA8P53708 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA8P53708 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA8P53708 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA8P53708 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA8P53708 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA8P53708 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA8P53708 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA8P53708 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA8P53708 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA8P53708 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA8P53708 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA8P53708 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA8P53708 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA8P53708 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms