Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ITGA8P53708 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ITGA8P53708 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ITGA8P53708 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ITGA8P53708 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ITGA8P53708 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
ITGA8P53708 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ITGA8P53708 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ITGA8P53708 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ITGA8P53708 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ITGA8P53708 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ITGA8P53708 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ITGA8P53708 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ITGA8P53708 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ITGA8P53708 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ITGA8P53708 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ITGA8P53708 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ITGA8P53708 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ITGA8P53708 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ITGA8P53708 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ITGA8P53708 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ITGA8P53708 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ITGA8P53708 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ITGA8P53708 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITGA8P53708 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGA8P53708 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ITGA8P53708 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ITGA8P53708 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ITGA8P53708 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ITGA8P53708 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ITGA8P53708 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGA8P53708 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ITGA8P53708 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGA8P53708 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGA8P53708 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGA8P53708 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ITGA8P53708 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ITGA8P53708 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ITGA8P53708 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ITGA8P53708 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGA8P53708 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGA8P53708 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ITGA8P53708 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGA8P53708 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITGA8P53708 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGA8P53708 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGA8P53708 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGA8P53708 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGA8P53708 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ITGA8P53708 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ITGA8P53708 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGA8P53708 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGA8P53708 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITGA8P53708 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGA8P53708 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGA8P53708 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGA8P53708 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGA8P53708 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGA8P53708 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGA8P53708 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGA8P53708 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGA8P53708 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGA8P53708 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGA8P53708 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGA8P53708 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGA8P53708 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGA8P53708 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGA8P53708 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGA8P53708 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGA8P53708 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGA8P53708 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGA8P53708 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGA8P53708 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGA8P53708 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGA8P53708 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ITGA8P53708 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGA8P53708 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGA8P53708 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGA8P53708 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGA8P53708 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGA8P53708 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGA8P53708 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGA8P53708 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGA8P53708 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGA8P53708 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGA8P53708 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGA8P53708 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ITGA8P53708 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGA8P53708 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITGA8P53708 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGA8P53708 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGA8P53708 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGA8P53708 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGA8P53708 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGA8P53708 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGA8P53708 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGA8P53708 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGA8P53708 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGA8P53708 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGA8P53708 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.3 ms