Protein–RNA interactions for Protein: P53701

HCCS, Cytochrome c-type heme lyase, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCCSP53701 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCCSP53701 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCCSP53701 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCCSP53701 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCCSP53701 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCCSP53701 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCCSP53701 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCCSP53701 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCCSP53701 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCCSP53701 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCCSP53701 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCCSP53701 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCCSP53701 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCCSP53701 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCCSP53701 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCCSP53701 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCCSP53701 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCCSP53701 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCCSP53701 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCCSP53701 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HCCSP53701 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HCCSP53701 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCCSP53701 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCCSP53701 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCCSP53701 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCCSP53701 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCCSP53701 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCCSP53701 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCCSP53701 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCCSP53701 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCCSP53701 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCCSP53701 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCCSP53701 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCCSP53701 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCCSP53701 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCCSP53701 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCCSP53701 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCCSP53701 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCCSP53701 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCCSP53701 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCCSP53701 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCCSP53701 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCCSP53701 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCCSP53701 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HCCSP53701 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCCSP53701 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCCSP53701 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCCSP53701 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCCSP53701 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCCSP53701 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCCSP53701 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCCSP53701 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCCSP53701 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCCSP53701 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCCSP53701 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCCSP53701 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCCSP53701 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCCSP53701 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCCSP53701 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCCSP53701 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCCSP53701 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCCSP53701 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCCSP53701 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HCCSP53701 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCCSP53701 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCCSP53701 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCCSP53701 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCCSP53701 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCCSP53701 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCCSP53701 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCCSP53701 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCCSP53701 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCCSP53701 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCCSP53701 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCCSP53701 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCCSP53701 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCCSP53701 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCCSP53701 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCCSP53701 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCCSP53701 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCCSP53701 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCCSP53701 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCCSP53701 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCCSP53701 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCCSP53701 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCCSP53701 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCCSP53701 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCCSP53701 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCCSP53701 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCCSP53701 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCCSP53701 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCCSP53701 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCCSP53701 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCCSP53701 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCCSP53701 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCCSP53701 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCCSP53701 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCCSP53701 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCCSP53701 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HCCSP53701 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms