Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC5P28715 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC5P28715 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC5P28715 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC5P28715 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC5P28715 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC5P28715 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC5P28715 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC5P28715 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC5P28715 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC5P28715 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC5P28715 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC5P28715 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC5P28715 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC5P28715 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERCC5P28715 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERCC5P28715 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERCC5P28715 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERCC5P28715 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC5P28715 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC5P28715 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC5P28715 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC5P28715 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC5P28715 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC5P28715 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC5P28715 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC5P28715 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC5P28715 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC5P28715 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC5P28715 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC5P28715 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC5P28715 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC5P28715 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC5P28715 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC5P28715 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC5P28715 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC5P28715 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC5P28715 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC5P28715 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC5P28715 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
ERCC5P28715 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ERCC5P28715 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERCC5P28715 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERCC5P28715 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC5P28715 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC5P28715 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC5P28715 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC5P28715 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC5P28715 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC5P28715 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC5P28715 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC5P28715 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC5P28715 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC5P28715 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC5P28715 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC5P28715 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC5P28715 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC5P28715 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC5P28715 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC5P28715 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC5P28715 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ERCC5P28715 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERCC5P28715 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC5P28715 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC5P28715 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC5P28715 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC5P28715 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC5P28715 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC5P28715 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC5P28715 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC5P28715 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC5P28715 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC5P28715 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC5P28715 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC5P28715 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms