RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380305.4

PSMG4-202, Transcript of proteasome assembly chaperone 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PSMG4, Length 489 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMG4-202ENST00000380305 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.4■■■■■ 7.9
PSMG4-202ENST00000380305 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.25■■■■■ 6.75
PSMG4-202ENST00000380305 ABCC9O60706 1549 aa56.12■■■■■ 6.57
PSMG4-202ENST00000380305 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.92■■■■■ 6.22
PSMG4-202ENST00000380305 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.92■■■■■ 6.22
PSMG4-202ENST00000380305 NACADO15069 1562 aa53.85■■■■■ 6.21
PSMG4-202ENST00000380305 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.64■■■■■ 6.18
PSMG4-202ENST00000380305 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.48■■■■■ 6.15
PSMG4-202ENST00000380305 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.25■■■■■ 6.11
PSMG4-202ENST00000380305 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.68■■■■■ 6.02
PSMG4-202ENST00000380305 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.46■■■■■ 5.99
PSMG4-202ENST00000380305 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.29■■■■■ 5.96
PSMG4-202ENST00000380305 SCRIBQ14160 1630 aa52.29■■■■■ 5.96
PSMG4-202ENST00000380305 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.72■■■■■ 5.87
PSMG4-202ENST00000380305 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.54■■■■■ 5.84
PSMG4-202ENST00000380305 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.93■■■■■ 5.74
PSMG4-202ENST00000380305 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.73■■■■■ 5.71
PSMG4-202ENST00000380305 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.42■■■■■ 5.66
PSMG4-202ENST00000380305 SMARCA4P51532 1647 aa49.98■■■■■ 5.59
PSMG4-202ENST00000380305 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.92■■■■■ 5.58
PSMG4-202ENST00000380305 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.73■■■■■ 5.55
PSMG4-202ENST00000380305 NCAPD3P42695 1498 aa49.69■■■■■ 5.55
PSMG4-202ENST00000380305 SMARCA2P51531 1590 aa49.66■■■■■ 5.54
PSMG4-202ENST00000380305 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.65■■■■■ 5.54
PSMG4-202ENST00000380305 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.46■■■■■ 5.51
PSMG4-202ENST00000380305 HMGXB3Q12766 1538 aa49.44■■■■■ 5.5
PSMG4-202ENST00000380305 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.33■■■■■ 5.49
PSMG4-202ENST00000380305 WIZO95785 1651 aa49.1■■■■■ 5.45
PSMG4-202ENST00000380305 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.07■■■■■ 5.45
PSMG4-202ENST00000380305 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.58■■■■■ 5.37
PSMG4-202ENST00000380305 NESP48681 1621 aa48.54■■■■■ 5.36
PSMG4-202ENST00000380305 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.39■■■■■ 5.34
PSMG4-202ENST00000380305 ERCC6Q03468 1493 aa48.38■■■■■ 5.34
PSMG4-202ENST00000380305 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.26■■■■■ 5.32
PSMG4-202ENST00000380305 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.08■■■■■ 5.29
PSMG4-202ENST00000380305 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.02■■■■■ 5.28
PSMG4-202ENST00000380305 CFTRP13569 1480 aa47.96■■■■■ 5.27
PSMG4-202ENST00000380305 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.94■■■■■ 5.26
PSMG4-202ENST00000380305 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.86■■■■■ 5.25
PSMG4-202ENST00000380305 CUX2O14529 1486 aa47.84■■■■■ 5.25
PSMG4-202ENST00000380305 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.79■■■■■ 5.24
PSMG4-202ENST00000380305 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.72■■■■■ 5.23
PSMG4-202ENST00000380305 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.66■■■■■ 5.22
PSMG4-202ENST00000380305 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.59■■■■■ 5.21
PSMG4-202ENST00000380305 PRDM2Q13029 1718 aa47.55■■■■■ 5.2
PSMG4-202ENST00000380305 WDR62O43379 1518 aa47.42■■■■■ 5.18
PSMG4-202ENST00000380305 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.24■■■■■ 5.15
PSMG4-202ENST00000380305 TOPBP1Q92547 1522 aa46.95■■■■■ 5.11
PSMG4-202ENST00000380305 ABCC8Q09428 1581 aa46.92■■■■■ 5.1
PSMG4-202ENST00000380305 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.88■■■■■ 5.1
PSMG4-202ENST00000380305 IFT140Q96RY7 1462 aa46.65■■■■■ 5.06
PSMG4-202ENST00000380305 CUX1P39880 1505 aa46.58■■■■■ 5.05
PSMG4-202ENST00000380305 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.54■■■■■ 5.04
PSMG4-202ENST00000380305 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.46■■■■■ 5.03
PSMG4-202ENST00000380305 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.44■■■■■ 5.02
PSMG4-202ENST00000380305 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.44■■■■■ 5.02
PSMG4-202ENST00000380305 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.41■■■■■ 5.02
PSMG4-202ENST00000380305 SOGA1O94964 1423 aa46.37■■■■■ 5.01
PSMG4-202ENST00000380305 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.36■■■■■ 5.01
PSMG4-202ENST00000380305 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.28■■■■■ 5
PSMG4-202ENST00000380305 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.26■■■■■ 5
PSMG4-202ENST00000380305 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.21■■■■■ 4.99
PSMG4-202ENST00000380305 TOP2BQ02880 1626 aa46.15■■■■■ 4.98
PSMG4-202ENST00000380305 SYNJ1O43426 1573 aa46.15■■■■■ 4.98
PSMG4-202ENST00000380305 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.14■■■■■ 4.98
PSMG4-202ENST00000380305 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.12■■■■■ 4.97
PSMG4-202ENST00000380305 WDR97A6NE52 1622 aa46.03■■■■■ 4.96
PSMG4-202ENST00000380305 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.97■■■■■ 4.95
PSMG4-202ENST00000380305 OSCARQ8IYS5 282 aa45.89■■■■■ 4.94
PSMG4-202ENST00000380305 GRIN2BQ13224 1484 aa45.82■■■■■ 4.93
PSMG4-202ENST00000380305 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.82■■■■■ 4.93
PSMG4-202ENST00000380305 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.78■■■■■ 4.92
PSMG4-202ENST00000380305 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.77■■■■■ 4.92
PSMG4-202ENST00000380305 PBRM1Q86U86 1689 aa45.7■■■■■ 4.91
PSMG4-202ENST00000380305 FBLN2P98095 1184 aa45.7■■■■■ 4.91
PSMG4-202ENST00000380305 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.69■■■■■ 4.91
PSMG4-202ENST00000380305 CHD1O14646 1710 aa45.68■■■■■ 4.9
PSMG4-202ENST00000380305 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.55■■■■■ 4.88
PSMG4-202ENST00000380305 SYNJ2O15056 1496 aa45.52■■■■■ 4.88
PSMG4-202ENST00000380305 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.41■■■■■ 4.86
PSMG4-202ENST00000380305 ADAMTS12P58397 1594 aa45.36■■■■■ 4.85
PSMG4-202ENST00000380305 KIF27Q86VH2 1401 aa45.32■■■■■ 4.85
PSMG4-202ENST00000380305 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.29■■■■■ 4.84
PSMG4-202ENST00000380305 GRIN2AQ12879 1464 aa45.23■■■■■ 4.83
PSMG4-202ENST00000380305 TRIM41Q8WV44 630 aa45.19■■■■■ 4.82
PSMG4-202ENST00000380305 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.18■■■■■ 4.82
PSMG4-202ENST00000380305 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.13■■■■■ 4.82
PSMG4-202ENST00000380305 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.13■■■■■ 4.82
PSMG4-202ENST00000380305 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.13■■■■■ 4.82
PSMG4-202ENST00000380305 IGF1RP08069 1367 aa45.13■■■■■ 4.82
PSMG4-202ENST00000380305 ARHGEF11O15085 1522 aa45.12■■■■■ 4.81
PSMG4-202ENST00000380305 NUP160Q12769 1436 aa45.01■■■■■ 4.8
PSMG4-202ENST00000380305 CEP170Q5SW79 1584 aa45■■■■■ 4.79
PSMG4-202ENST00000380305 CUL7Q14999 1698 aa44.99■■■■■ 4.79
PSMG4-202ENST00000380305 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.9■■■■■ 4.78
PSMG4-202ENST00000380305 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.87■■■■■ 4.77
PSMG4-202ENST00000380305 ARAP1Q96P48 1450 aa44.77■■■■■ 4.76
PSMG4-202ENST00000380305 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.75■■■■■ 4.75
PSMG4-202ENST00000380305 SHROOM2Q13796 1616 aa44.67■■■■■ 4.74
PSMG4-202ENST00000380305 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.61■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms