Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF3P17036 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF3P17036 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF3P17036 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF3P17036 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF3P17036 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF3P17036 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF3P17036 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF3P17036 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF3P17036 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF3P17036 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF3P17036 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF3P17036 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF3P17036 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF3P17036 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF3P17036 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF3P17036 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF3P17036 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF3P17036 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF3P17036 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF3P17036 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF3P17036 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF3P17036 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms