Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BANF1O75531 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BANF1O75531 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BANF1O75531 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BANF1O75531 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BANF1O75531 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BANF1O75531 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BANF1O75531 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BANF1O75531 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BANF1O75531 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BANF1O75531 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BANF1O75531 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BANF1O75531 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BANF1O75531 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BANF1O75531 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BANF1O75531 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BANF1O75531 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BANF1O75531 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BANF1O75531 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BANF1O75531 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BANF1O75531 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BANF1O75531 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BANF1O75531 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BANF1O75531 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BANF1O75531 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BANF1O75531 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BANF1O75531 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BANF1O75531 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BANF1O75531 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BANF1O75531 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BANF1O75531 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BANF1O75531 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BANF1O75531 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BANF1O75531 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BANF1O75531 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BANF1O75531 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BANF1O75531 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BANF1O75531 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BANF1O75531 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BANF1O75531 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BANF1O75531 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BANF1O75531 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BANF1O75531 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BANF1O75531 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BANF1O75531 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BANF1O75531 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BANF1O75531 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BANF1O75531 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BANF1O75531 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BANF1O75531 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BANF1O75531 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BANF1O75531 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BANF1O75531 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BANF1O75531 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BANF1O75531 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BANF1O75531 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BANF1O75531 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BANF1O75531 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BANF1O75531 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BANF1O75531 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BANF1O75531 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BANF1O75531 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BANF1O75531 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BANF1O75531 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BANF1O75531 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BANF1O75531 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BANF1O75531 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BANF1O75531 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BANF1O75531 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BANF1O75531 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BANF1O75531 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BANF1O75531 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BANF1O75531 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BANF1O75531 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BANF1O75531 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BANF1O75531 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BANF1O75531 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BANF1O75531 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BANF1O75531 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BANF1O75531 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BANF1O75531 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BANF1O75531 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BANF1O75531 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BANF1O75531 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BANF1O75531 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BANF1O75531 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BANF1O75531 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BANF1O75531 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BANF1O75531 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BANF1O75531 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BANF1O75531 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BANF1O75531 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BANF1O75531 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BANF1O75531 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BANF1O75531 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BANF1O75531 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BANF1O75531 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BANF1O75531 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BANF1O75531 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BANF1O75531 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms