Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBV5-3A0A0A0MS03 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBV5-3A0A0A0MS03 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBV5-3A0A0A0MS03 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBV5-3A0A0A0MS03 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV5-3A0A0A0MS03 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRBV5-3A0A0A0MS03 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRBV5-3A0A0A0MS03 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRBV5-3A0A0A0MS03 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRBV5-3A0A0A0MS03 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBV5-3A0A0A0MS03 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBV5-3A0A0A0MS03 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBV5-3A0A0A0MS03 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBV5-3A0A0A0MS03 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBV5-3A0A0A0MS03 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBV5-3A0A0A0MS03 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBV5-3A0A0A0MS03 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBV5-3A0A0A0MS03 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBV5-3A0A0A0MS03 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRBV5-3A0A0A0MS03 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRBV5-3A0A0A0MS03 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBV5-3A0A0A0MS03 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBV5-3A0A0A0MS03 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBV5-3A0A0A0MS03 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBV5-3A0A0A0MS03 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRBV5-3A0A0A0MS03 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRBV5-3A0A0A0MS03 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBV5-3A0A0A0MS03 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBV5-3A0A0A0MS03 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBV5-3A0A0A0MS03 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBV5-3A0A0A0MS03 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRBV5-3A0A0A0MS03 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBV5-3A0A0A0MS03 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBV5-3A0A0A0MS03 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRBV5-3A0A0A0MS03 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRBV5-3A0A0A0MS03 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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