Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRBV5-3A0A0A0MS03 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRBV5-3A0A0A0MS03 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TRBV5-3A0A0A0MS03 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRBV5-3A0A0A0MS03 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRBV5-3A0A0A0MS03 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRBV5-3A0A0A0MS03 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRBV5-3A0A0A0MS03 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TRBV5-3A0A0A0MS03 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRBV5-3A0A0A0MS03 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRBV5-3A0A0A0MS03 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRBV5-3A0A0A0MS03 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRBV5-3A0A0A0MS03 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRBV5-3A0A0A0MS03 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRBV5-3A0A0A0MS03 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRBV5-3A0A0A0MS03 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRBV5-3A0A0A0MS03 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRBV5-3A0A0A0MS03 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRBV5-3A0A0A0MS03 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRBV5-3A0A0A0MS03 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRBV5-3A0A0A0MS03 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRBV5-3A0A0A0MS03 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRBV5-3A0A0A0MS03 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRBV5-3A0A0A0MS03 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRBV5-3A0A0A0MS03 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRBV5-3A0A0A0MS03 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRBV5-3A0A0A0MS03 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRBV5-3A0A0A0MS03 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRBV5-3A0A0A0MS03 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRBV5-3A0A0A0MS03 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRBV5-3A0A0A0MS03 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
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