Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 NAPA-205ENST00000594001 1417 ntTSL 225.9■■□□□ 1.749e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SCAMP4-204ENST00000414057 1477 ntTSL 1 (best)25.81■■□□□ 1.729e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SCAMP4-205ENST00000452128 718 ntTSL 224.88■■□□□ 1.579e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.549e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 AES-209ENST00000587393 1082 ntTSL 224.53■■□□□ 1.529e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.52e-9■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 CXXC1-215ENST00000591190 1021 ntTSL 324.29■■□□□ 1.483e-12■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 CXXC1-217ENST00000592078 686 ntTSL 224.09■■□□□ 1.453e-12■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.449e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 CLCN7-209ENST00000565092 2740 ntTSL 223.67■■□□□ 1.383e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PPFIA1-216ENST00000530746 575 ntTSL 322.93■■□□□ 1.269e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PXN-208ENST00000538144 1805 ntTSL 1 (best)22.8■■□□□ 1.249e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.22e-9■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.169e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.139e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SCAMP4-206ENST00000460767 569 ntTSL 421.83■■□□□ 1.089e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SCAMP4-212ENST00000590266 570 ntTSL 521.36■■□□□ 1.019e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PXN-203ENST00000323871 5457 ntTSL 221.3■■□□□ 19e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.939e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.99e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC20.57■□□□□ 0.889e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.89e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.722e-9■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.679e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.62e-9■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 GDPD5-205ENST00000527322 1000 ntTSL 1 (best)17.54■□□□□ 0.42e-9■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 GDPD5-206ENST00000527820 3211 ntTSL 1 (best)17.53■□□□□ 0.42e-9■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.42e-9■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.322e-9■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.219e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SCAMP4-208ENST00000489554 573 ntTSL 316.11■□□□□ 0.179e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-227ENST00000615748 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.159e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PXN-222ENST00000637624 4132 ntTSL 215.57■□□□□ 0.089e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 NAPA-207ENST00000594217 554 ntTSL 515.26■□□□□ 0.039e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 NAPA-217ENST00000597778 3898 ntTSL 214.71□□□□□ -0.059e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 UBE2E3-203ENST00000602291 766 ntTSL 314.59□□□□□ -0.079e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PXN-202ENST00000267257 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.139e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PXN-206ENST00000458477 3807 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.139e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-209ENST00000464238 412 ntTSL 213.35□□□□□ -0.279e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-206ENST00000462458 1987 ntTSL 1 (best)13.1□□□□□ -0.319e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 ATP8B2-202ENST00000368489 5861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.349e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SCHLAP1-201ENST00000629145 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.419e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 UBE2E3-210ENST00000602762 340 ntTSL 312.02□□□□□ -0.499e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 UBE2E3-204ENST00000602303 654 ntTSL 511.15□□□□□ -0.639e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 MAP1LC3B-205ENST00000564638 735 ntTSL 211.01□□□□□ -0.652e-9■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-226ENST00000608007 3138 ntTSL 1 (best)9.35□□□□□ -0.919e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 UBE2E3-212ENST00000602888 499 ntTSL 22.44□□□□□ -2.029e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 AES-211ENST00000592330 275 ntTSL 51.87□□□□□ -2.119e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PLXNB2-202ENST00000411680 704 ntTSL 226.25■■□□□ 1.792e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PLXNB2-212ENST00000496720 913 ntTSL 325.66■■□□□ 1.72e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 GRINA-207ENST00000531992 597 ntTSL 228.53■■■□□ 2.166e-11■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 GRINA-206ENST00000530898 558 ntTSL 224.23■■□□□ 1.476e-11■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 CTTN-204ENST00000393747 1315 ntTSL 528.07■■■□□ 2.087e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SRRM2-222ENST00000575009 1146 ntTSL 540.1■■■■■ 4.015e-15■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SRRM2-229ENST00000576894 2210 ntTSL 1 (best)30.21■■■□□ 2.435e-15■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SRRM2-225ENST00000576076 914 nt25.77■■□□□ 1.725e-15■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SRRM2-230ENST00000576924 3314 ntTSL 1 (best)22.59■■□□□ 1.215e-15■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SRRM2-208ENST00000571378 2870 ntTSL 1 (best)21.69■■□□□ 1.065e-15■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SRRM2-212ENST00000572952 1118 ntTSL 221.47■■□□□ 1.035e-15■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.985e-15■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SRRM2-209ENST00000572278 711 ntTSL 214.76□□□□□ -0.055e-15■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SRRM2-215ENST00000573498 994 ntTSL 310.7□□□□□ -0.75e-15■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 YWHAZ-207ENST00000395958 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.168e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 GALNT10-210ENST00000521786 600 ntTSL 342.49■■■■■ 4.397e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SMDT1-203ENST00000484235 556 ntTSL 1 (best)40.8■■■■■ 4.123e-8■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.953e-8■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.927e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SMDT1-202ENST00000422252 591 ntTSL 239.41■■■■□ 3.93e-8■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.817e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.727e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.727e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.657e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.67e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 STX1A-214ENST00000497980 503 ntTSL 337.43■■■■□ 3.587e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 ZNF639-207ENST00000491818 1228 ntTSL 537.12■■■■□ 3.537e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.417e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SMARCD1-204ENST00000547637 587 ntTSL 236.19■■■■□ 3.387e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SMARCD1-209ENST00000550477 911 ntTSL 336.19■■■■□ 3.387e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 CSNK1G3-204ENST00000508708 920 ntTSL 236.09■■■■□ 3.377e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.295e-8■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SMARCD1-203ENST00000547247 1584 ntTSL 1 (best)35.42■■■■□ 3.267e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 LAMA5-209ENST00000481120 386 ntTSL 234.92■■■■□ 3.187e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SMARCD1-212ENST00000551966 881 ntTSL 534.68■■■■□ 3.147e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 WDR4-206ENST00000479429 759 ntTSL 534.02■■■■□ 3.047e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.871e-10■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 ARFGEF1-206ENST00000519436 571 ntTSL 332.77■■■□□ 2.841e-10■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SARAF-210ENST00000522055 582 ntTSL 332.47■■■□□ 2.797e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 OSBPL5-205ENST00000465323 674 ntTSL 232.01■■■□□ 2.717e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 WDR4-204ENST00000470658 901 ntTSL 531.85■■■□□ 2.697e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SPPL2B-205ENST00000589515 1733 ntTSL 531.17■■■□□ 2.583e-8■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.57e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.51e-14■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.487e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 HMBS-215ENST00000542822 936 ntTSL 530.18■■■□□ 2.421e-10■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SARAF-202ENST00000517569 487 ntTSL 1 (best)29.76■■■□□ 2.357e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 HMBS-212ENST00000542044 1544 ntTSL 529.74■■■□□ 2.351e-10■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.351e-10■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.347e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 STX1A-211ENST00000491645 650 ntTSL 229.01■■■□□ 2.247e-6■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.217e-6■■■□□ 16.5
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