RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521786.5

GALNT10-210, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10, humanhuman

TSL 3

Gene GALNT10, Length 600 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT10-210ENST00000521786 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.23■■■■■ 8.35
GALNT10-210ENST00000521786 ABCC9O60706 1549 aa61.11■■■■■ 7.37
GALNT10-210ENST00000521786 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.48■■■■■ 7.27
GALNT10-210ENST00000521786 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.88■■■■■ 6.86
GALNT10-210ENST00000521786 DNAJC5BQ9UF47 199 aa57.78■■■■■ 6.84
GALNT10-210ENST00000521786 NACADO15069 1562 aa57.35■■■■■ 6.77
GALNT10-210ENST00000521786 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.07■■■■■ 6.73
GALNT10-210ENST00000521786 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.84■■■■■ 6.69
GALNT10-210ENST00000521786 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.43■■■■■ 6.62
GALNT10-210ENST00000521786 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.39■■■■■ 6.62
GALNT10-210ENST00000521786 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.19■■■■■ 6.59
GALNT10-210ENST00000521786 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.61■■■■■ 6.49
GALNT10-210ENST00000521786 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.47■■■■■ 6.47
GALNT10-210ENST00000521786 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.42■■■■■ 6.46
GALNT10-210ENST00000521786 SCRIBQ14160 1630 aa55.14■■■■■ 6.42
GALNT10-210ENST00000521786 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55.11■■■■■ 6.41
GALNT10-210ENST00000521786 CECR2Q9BXF3 1484 aa55.1■■■■■ 6.41
GALNT10-210ENST00000521786 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.89■■■■■ 6.38
GALNT10-210ENST00000521786 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa53.45■■■■■ 6.15
GALNT10-210ENST00000521786 NCAPD3P42695 1498 aa52.99■■■■■ 6.07
GALNT10-210ENST00000521786 CUX2O14529 1486 aa52.86■■■■■ 6.05
GALNT10-210ENST00000521786 ERCC6Q03468 1493 aa52.82■■■■■ 6.05
GALNT10-210ENST00000521786 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.75■■■■■ 6.04
GALNT10-210ENST00000521786 SMARCA2P51531 1590 aa52.56■■■■■ 6
GALNT10-210ENST00000521786 SMARCA4P51532 1647 aa52.52■■■■■ 6
GALNT10-210ENST00000521786 HMGXB3Q12766 1538 aa52.52■■■■■ 6
GALNT10-210ENST00000521786 NESP48681 1621 aa52.32■■■■■ 5.97
GALNT10-210ENST00000521786 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.23■■■■■ 5.95
GALNT10-210ENST00000521786 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.21■■■■■ 5.95
GALNT10-210ENST00000521786 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.01■■■■■ 5.92
GALNT10-210ENST00000521786 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.85■■■■■ 5.89
GALNT10-210ENST00000521786 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.85■■■■■ 5.89
GALNT10-210ENST00000521786 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.8■■■■■ 5.88
GALNT10-210ENST00000521786 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.63■■■■■ 5.86
GALNT10-210ENST00000521786 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.54■■■■■ 5.84
GALNT10-210ENST00000521786 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.37■■■■■ 5.81
GALNT10-210ENST00000521786 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.19■■■■■ 5.79
GALNT10-210ENST00000521786 WIZO95785 1651 aa51.11■■■■■ 5.77
GALNT10-210ENST00000521786 WDR62O43379 1518 aa51.05■■■■■ 5.76
GALNT10-210ENST00000521786 TRIM41Q8WV44 630 aa50.94■■■■■ 5.75
GALNT10-210ENST00000521786 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.9■■■■■ 5.74
GALNT10-210ENST00000521786 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.78■■■■■ 5.72
GALNT10-210ENST00000521786 CFTRP13569 1480 aa50.65■■■■■ 5.7
GALNT10-210ENST00000521786 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.55■■■■■ 5.68
GALNT10-210ENST00000521786 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.46■■■■■ 5.67
GALNT10-210ENST00000521786 OSCARQ8IYS5 282 aa50.4■■■■■ 5.66
GALNT10-210ENST00000521786 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.38■■■■■ 5.66
GALNT10-210ENST00000521786 PRDM2Q13029 1718 aa49.95■■■■■ 5.59
GALNT10-210ENST00000521786 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.92■■■■■ 5.58
GALNT10-210ENST00000521786 IFT140Q96RY7 1462 aa49.89■■■■■ 5.58
GALNT10-210ENST00000521786 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.86■■■■■ 5.57
GALNT10-210ENST00000521786 TOPBP1Q92547 1522 aa49.75■■■■■ 5.55
GALNT10-210ENST00000521786 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.73■■■■■ 5.55
GALNT10-210ENST00000521786 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.73■■■■■ 5.55
GALNT10-210ENST00000521786 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.73■■■■■ 5.55
GALNT10-210ENST00000521786 ABCC8Q09428 1581 aa49.61■■■■■ 5.53
GALNT10-210ENST00000521786 ARHGEF11O15085 1522 aa49.55■■■■■ 5.52
GALNT10-210ENST00000521786 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.53■■■■■ 5.52
GALNT10-210ENST00000521786 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.5■■■■■ 5.52
GALNT10-210ENST00000521786 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.36■■■■■ 5.49
GALNT10-210ENST00000521786 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.3■■■■■ 5.48
GALNT10-210ENST00000521786 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49.28■■■■■ 5.48
GALNT10-210ENST00000521786 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.22■■■■■ 5.47
GALNT10-210ENST00000521786 CHD1O14646 1710 aa49.2■■■■■ 5.47
GALNT10-210ENST00000521786 FBLN2P98095 1184 aa49.19■■■■■ 5.47
GALNT10-210ENST00000521786 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.06■■■■■ 5.44
GALNT10-210ENST00000521786 ARAP1Q96P48 1450 aa49.05■■■■■ 5.44
GALNT10-210ENST00000521786 SOGA1O94964 1423 aa49■■■■■ 5.44
GALNT10-210ENST00000521786 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.99■■■■■ 5.43
GALNT10-210ENST00000521786 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.92■■■■■ 5.42
GALNT10-210ENST00000521786 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.84■■■■■ 5.41
GALNT10-210ENST00000521786 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.84■■■■■ 5.41
GALNT10-210ENST00000521786 WDR97A6NE52 1622 aa48.77■■■■■ 5.4
GALNT10-210ENST00000521786 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.73■■■■■ 5.39
GALNT10-210ENST00000521786 CUX1P39880 1505 aa48.69■■■■■ 5.39
GALNT10-210ENST00000521786 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.68■■■■■ 5.38
GALNT10-210ENST00000521786 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.67■■■■■ 5.38
GALNT10-210ENST00000521786 GRIN2BQ13224 1484 aa48.63■■■■■ 5.38
GALNT10-210ENST00000521786 SYNJ1O43426 1573 aa48.63■■■■■ 5.38
GALNT10-210ENST00000521786 SYNJ2O15056 1496 aa48.53■■■■■ 5.36
GALNT10-210ENST00000521786 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.39■■■■■ 5.34
GALNT10-210ENST00000521786 PBRM1Q86U86 1689 aa48.31■■■■■ 5.32
GALNT10-210ENST00000521786 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.24■■■■■ 5.31
GALNT10-210ENST00000521786 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.18■■■■■ 5.3
GALNT10-210ENST00000521786 GRIN2AQ12879 1464 aa48■■■■■ 5.27
GALNT10-210ENST00000521786 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.99■■■■■ 5.27
GALNT10-210ENST00000521786 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.98■■■■■ 5.27
GALNT10-210ENST00000521786 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.9■■■■■ 5.26
GALNT10-210ENST00000521786 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP47.89■■■■■ 5.26
GALNT10-210ENST00000521786 ADAMTS12P58397 1594 aa47.88■■■■■ 5.26
GALNT10-210ENST00000521786 NUP160Q12769 1436 aa47.86■■■■■ 5.25
GALNT10-210ENST00000521786 CEP170Q5SW79 1584 aa47.83■■■■■ 5.25
GALNT10-210ENST00000521786 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.76■■■■■ 5.24
GALNT10-210ENST00000521786 TOP2BQ02880 1626 aa47.74■■■■■ 5.23
GALNT10-210ENST00000521786 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.73■■■■■ 5.23
GALNT10-210ENST00000521786 SHROOM2Q13796 1616 aa47.64■■■■■ 5.22
GALNT10-210ENST00000521786 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.62■■■■■ 5.21
GALNT10-210ENST00000521786 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.46■■■■■ 5.19
GALNT10-210ENST00000521786 JPH4Q96JJ6 628 aa47.4■■■■■ 5.18
GALNT10-210ENST00000521786 KIF13AQ9H1H9 1805 aa47.23■■■■■ 5.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms