RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508708.1

CSNK1G3-204, Transcript of casein kinase 1 gamma 3, humanhuman

TSL 2

Gene CSNK1G3, Length 920 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G3-204ENST00000508708 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.8■■■■■ 6.84
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CSNK1G3-204ENST00000508708 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.61■■■■■ 5.37
CSNK1G3-204ENST00000508708 NACADO15069 1562 aa48.51■■■■■ 5.36
CSNK1G3-204ENST00000508708 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.17■■■■■ 5.3
CSNK1G3-204ENST00000508708 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.16■■■■■ 5.3
CSNK1G3-204ENST00000508708 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.13■■■■■ 5.3
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CSNK1G3-204ENST00000508708 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.57■■■■■ 5.21
CSNK1G3-204ENST00000508708 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.25■■■■■ 5.15
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CSNK1G3-204ENST00000508708 SCRIBQ14160 1630 aa46.97■■■■■ 5.11
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CSNK1G3-204ENST00000508708 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.7■■■■■ 5.07
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CSNK1G3-204ENST00000508708 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.85■■■■■ 4.93
CSNK1G3-204ENST00000508708 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.57■■■■■ 4.89
CSNK1G3-204ENST00000508708 SMARCA4P51532 1647 aa44.93■■■■■ 4.78
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CSNK1G3-204ENST00000508708 NCAPD3P42695 1498 aa44.78■■■■■ 4.76
CSNK1G3-204ENST00000508708 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.75■■■■■ 4.75
CSNK1G3-204ENST00000508708 SMARCA2P51531 1590 aa44.66■■■■■ 4.74
CSNK1G3-204ENST00000508708 HMGXB3Q12766 1538 aa44.55■■■■■ 4.72
CSNK1G3-204ENST00000508708 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.55■■■■■ 4.72
CSNK1G3-204ENST00000508708 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.54■■■■■ 4.72
CSNK1G3-204ENST00000508708 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.33■■■■■ 4.69
CSNK1G3-204ENST00000508708 WIZO95785 1651 aa44.03■■■■■ 4.64
CSNK1G3-204ENST00000508708 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.91■■■■■ 4.62
CSNK1G3-204ENST00000508708 NESP48681 1621 aa43.79■■■■■ 4.6
CSNK1G3-204ENST00000508708 ERCC6Q03468 1493 aa43.65■■■■■ 4.58
CSNK1G3-204ENST00000508708 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.63■■■■■ 4.58
CSNK1G3-204ENST00000508708 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.56
CSNK1G3-204ENST00000508708 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.41■■■■■ 4.54
CSNK1G3-204ENST00000508708 CUX2O14529 1486 aa43.38■■■■■ 4.53
CSNK1G3-204ENST00000508708 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.29■■■■■ 4.52
CSNK1G3-204ENST00000508708 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.27■■■■■ 4.52
CSNK1G3-204ENST00000508708 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.26■■■■■ 4.52
CSNK1G3-204ENST00000508708 CFTRP13569 1480 aa43.13■■■■■ 4.5
CSNK1G3-204ENST00000508708 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.01■■■■■ 4.48
CSNK1G3-204ENST00000508708 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.93■■■■■ 4.46
CSNK1G3-204ENST00000508708 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.93■■■■■ 4.46
CSNK1G3-204ENST00000508708 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.9■■■■■ 4.46
CSNK1G3-204ENST00000508708 WDR62O43379 1518 aa42.84■■■■■ 4.45
CSNK1G3-204ENST00000508708 PRDM2Q13029 1718 aa42.78■■■■■ 4.44
CSNK1G3-204ENST00000508708 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
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CSNK1G3-204ENST00000508708 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.35■■■■■ 4.37
CSNK1G3-204ENST00000508708 TOPBP1Q92547 1522 aa42.22■■■■■ 4.35
CSNK1G3-204ENST00000508708 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.16■■■■■ 4.34
CSNK1G3-204ENST00000508708 ABCC8Q09428 1581 aa42.14■■■■■ 4.34
CSNK1G3-204ENST00000508708 IFT140Q96RY7 1462 aa42.02■■■■■ 4.32
CSNK1G3-204ENST00000508708 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
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CSNK1G3-204ENST00000508708 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.69■■■■■ 4.26
CSNK1G3-204ENST00000508708 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.65■■■■■ 4.26
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CSNK1G3-204ENST00000508708 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.56■■■■■ 4.24
CSNK1G3-204ENST00000508708 WDR97A6NE52 1622 aa41.47■■■■■ 4.23
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CSNK1G3-204ENST00000508708 OSCARQ8IYS5 282 aa41.4■■■■■ 4.22
CSNK1G3-204ENST00000508708 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.37■■■■■ 4.21
CSNK1G3-204ENST00000508708 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.37■■■■■ 4.21
CSNK1G3-204ENST00000508708 TOP2BQ02880 1626 aa41.36■■■■■ 4.21
CSNK1G3-204ENST00000508708 SYNJ1O43426 1573 aa41.35■■■■■ 4.21
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CSNK1G3-204ENST00000508708 CHD1O14646 1710 aa41.22■■■■■ 4.19
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CSNK1G3-204ENST00000508708 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.19■■■■■ 4.18
CSNK1G3-204ENST00000508708 GRIN2BQ13224 1484 aa41.19■■■■■ 4.18
CSNK1G3-204ENST00000508708 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.15■■■■■ 4.18
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CSNK1G3-204ENST00000508708 SYNJ2O15056 1496 aa40.98■■■■■ 4.15
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CSNK1G3-204ENST00000508708 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.89■■■■■ 4.14
CSNK1G3-204ENST00000508708 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.89■■■■■ 4.14
CSNK1G3-204ENST00000508708 ARHGEF11O15085 1522 aa40.87■■■■■ 4.13
CSNK1G3-204ENST00000508708 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
CSNK1G3-204ENST00000508708 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.83■■■■■ 4.13
CSNK1G3-204ENST00000508708 ADAMTS12P58397 1594 aa40.82■■■■■ 4.12
CSNK1G3-204ENST00000508708 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.78■■■■■ 4.12
CSNK1G3-204ENST00000508708 TRIM41Q8WV44 630 aa40.74■■■■■ 4.11
CSNK1G3-204ENST00000508708 GRIN2AQ12879 1464 aa40.69■■■■■ 4.1
CSNK1G3-204ENST00000508708 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.67■■■■■ 4.1
CSNK1G3-204ENST00000508708 NUP160Q12769 1436 aa40.56■■■■■ 4.08
CSNK1G3-204ENST00000508708 ARAP1Q96P48 1450 aa40.54■■■■■ 4.08
CSNK1G3-204ENST00000508708 CEP170Q5SW79 1584 aa40.53■■■■■ 4.08
CSNK1G3-204ENST00000508708 KIF27Q86VH2 1401 aa40.51■■■■■ 4.08
CSNK1G3-204ENST00000508708 IGF1RP08069 1367 aa40.4■■■■■ 4.06
CSNK1G3-204ENST00000508708 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.37■■■■■ 4.05
CSNK1G3-204ENST00000508708 CUL7Q14999 1698 aa40.34■■■■■ 4.05
CSNK1G3-204ENST00000508708 SHROOM2Q13796 1616 aa40.3■■■■■ 4.04
CSNK1G3-204ENST00000508708 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.23■■■■■ 4.03
CSNK1G3-204ENST00000508708 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.23■■■■■ 4.03
CSNK1G3-204ENST00000508708 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.12■■■■■ 4.01
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