Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT86O43790 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT86O43790 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT86O43790 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT86O43790 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT86O43790 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT86O43790 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT86O43790 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT86O43790 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT86O43790 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT86O43790 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT86O43790 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT86O43790 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT86O43790 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT86O43790 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT86O43790 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT86O43790 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT86O43790 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT86O43790 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT86O43790 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT86O43790 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT86O43790 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT86O43790 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT86O43790 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT86O43790 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT86O43790 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT86O43790 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT86O43790 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT86O43790 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT86O43790 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT86O43790 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT86O43790 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT86O43790 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT86O43790 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT86O43790 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT86O43790 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT86O43790 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT86O43790 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT86O43790 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT86O43790 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT86O43790 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT86O43790 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT86O43790 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT86O43790 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT86O43790 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT86O43790 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT86O43790 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT86O43790 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT86O43790 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT86O43790 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT86O43790 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT86O43790 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT86O43790 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT86O43790 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT86O43790 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT86O43790 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT86O43790 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT86O43790 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT86O43790 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT86O43790 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT86O43790 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT86O43790 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT86O43790 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT86O43790 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KRT86O43790 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT86O43790 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT86O43790 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT86O43790 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT86O43790 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT86O43790 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT86O43790 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT86O43790 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT86O43790 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT86O43790 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT86O43790 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT86O43790 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT86O43790 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT86O43790 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT86O43790 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT86O43790 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT86O43790 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT86O43790 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT86O43790 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT86O43790 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT86O43790 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT86O43790 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT86O43790 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT86O43790 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT86O43790 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT86O43790 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT86O43790 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT86O43790 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT86O43790 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT86O43790 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT86O43790 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT86O43790 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT86O43790 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT86O43790 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT86O43790 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT86O43790 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms