RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428541.1

AC079305.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC079305.1, Length 499 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC079305.1-201ENST00000428541 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.02■■■■■ 8.48
AC079305.1-201ENST00000428541 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.59■■■■■ 7.29
AC079305.1-201ENST00000428541 ABCC9O60706 1549 aa59.62■■■■■ 7.13
AC079305.1-201ENST00000428541 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.2■■■■■ 6.75
AC079305.1-201ENST00000428541 NACADO15069 1562 aa57.06■■■■■ 6.73
AC079305.1-201ENST00000428541 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.01■■■■■ 6.72
AC079305.1-201ENST00000428541 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.63■■■■■ 6.66
AC079305.1-201ENST00000428541 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.58■■■■■ 6.65
AC079305.1-201ENST00000428541 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.27■■■■■ 6.6
AC079305.1-201ENST00000428541 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.86■■■■■ 6.53
AC079305.1-201ENST00000428541 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.68■■■■■ 6.5
AC079305.1-201ENST00000428541 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.48■■■■■ 6.47
AC079305.1-201ENST00000428541 SCRIBQ14160 1630 aa55.27■■■■■ 6.44
AC079305.1-201ENST00000428541 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.04■■■■■ 6.4
AC079305.1-201ENST00000428541 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.86■■■■■ 6.37
AC079305.1-201ENST00000428541 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.04■■■■■ 6.24
AC079305.1-201ENST00000428541 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.9■■■■■ 6.22
AC079305.1-201ENST00000428541 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.6■■■■■ 6.17
AC079305.1-201ENST00000428541 SMARCA4P51532 1647 aa52.84■■■■■ 6.05
AC079305.1-201ENST00000428541 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.74■■■■■ 6.03
AC079305.1-201ENST00000428541 NCAPD3P42695 1498 aa52.68■■■■■ 6.02
AC079305.1-201ENST00000428541 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.64■■■■■ 6.02
AC079305.1-201ENST00000428541 SMARCA2P51531 1590 aa52.56■■■■■ 6
AC079305.1-201ENST00000428541 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.42■■■■■ 5.98
AC079305.1-201ENST00000428541 HMGXB3Q12766 1538 aa52.36■■■■■ 5.97
AC079305.1-201ENST00000428541 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.33■■■■■ 5.97
AC079305.1-201ENST00000428541 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.19■■■■■ 5.95
AC079305.1-201ENST00000428541 WIZO95785 1651 aa51.83■■■■■ 5.89
AC079305.1-201ENST00000428541 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.72■■■■■ 5.87
AC079305.1-201ENST00000428541 NESP48681 1621 aa51.49■■■■■ 5.83
AC079305.1-201ENST00000428541 ERCC6Q03468 1493 aa51.41■■■■■ 5.82
AC079305.1-201ENST00000428541 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.32■■■■■ 5.81
AC079305.1-201ENST00000428541 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.26■■■■■ 5.8
AC079305.1-201ENST00000428541 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.13■■■■■ 5.78
AC079305.1-201ENST00000428541 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51■■■■■ 5.75
AC079305.1-201ENST00000428541 CUX2O14529 1486 aa50.97■■■■■ 5.75
AC079305.1-201ENST00000428541 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.85■■■■■ 5.73
AC079305.1-201ENST00000428541 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.77■■■■■ 5.72
AC079305.1-201ENST00000428541 CFTRP13569 1480 aa50.75■■■■■ 5.71
AC079305.1-201ENST00000428541 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.69■■■■■ 5.7
AC079305.1-201ENST00000428541 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.53■■■■■ 5.68
AC079305.1-201ENST00000428541 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.49■■■■■ 5.67
AC079305.1-201ENST00000428541 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.48■■■■■ 5.67
AC079305.1-201ENST00000428541 WDR62O43379 1518 aa50.32■■■■■ 5.65
AC079305.1-201ENST00000428541 PRDM2Q13029 1718 aa50.28■■■■■ 5.64
AC079305.1-201ENST00000428541 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.19■■■■■ 5.63
AC079305.1-201ENST00000428541 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.04■■■■■ 5.6
AC079305.1-201ENST00000428541 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.82■■■■■ 5.57
AC079305.1-201ENST00000428541 TOPBP1Q92547 1522 aa49.69■■■■■ 5.54
AC079305.1-201ENST00000428541 ABCC8Q09428 1581 aa49.67■■■■■ 5.54
AC079305.1-201ENST00000428541 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.59■■■■■ 5.53
AC079305.1-201ENST00000428541 IFT140Q96RY7 1462 aa49.45■■■■■ 5.51
AC079305.1-201ENST00000428541 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.25■■■■■ 5.48
AC079305.1-201ENST00000428541 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.24■■■■■ 5.47
AC079305.1-201ENST00000428541 CUX1P39880 1505 aa49.19■■■■■ 5.46
AC079305.1-201ENST00000428541 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.16■■■■■ 5.46
AC079305.1-201ENST00000428541 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.08■■■■■ 5.45
AC079305.1-201ENST00000428541 SOGA1O94964 1423 aa49.06■■■■■ 5.44
AC079305.1-201ENST00000428541 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.04■■■■■ 5.44
AC079305.1-201ENST00000428541 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.02■■■■■ 5.44
AC079305.1-201ENST00000428541 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.95■■■■■ 5.43
AC079305.1-201ENST00000428541 OSCARQ8IYS5 282 aa48.85■■■■■ 5.41
AC079305.1-201ENST00000428541 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.82■■■■■ 5.41
AC079305.1-201ENST00000428541 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.77■■■■■ 5.4
AC079305.1-201ENST00000428541 WDR97A6NE52 1622 aa48.75■■■■■ 5.39
AC079305.1-201ENST00000428541 TOP2BQ02880 1626 aa48.68■■■■■ 5.38
AC079305.1-201ENST00000428541 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.67■■■■■ 5.38
AC079305.1-201ENST00000428541 SYNJ1O43426 1573 aa48.65■■■■■ 5.38
AC079305.1-201ENST00000428541 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.59■■■■■ 5.37
AC079305.1-201ENST00000428541 GRIN2BQ13224 1484 aa48.51■■■■■ 5.36
AC079305.1-201ENST00000428541 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.48■■■■■ 5.35
AC079305.1-201ENST00000428541 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.47■■■■■ 5.35
AC079305.1-201ENST00000428541 CHD1O14646 1710 aa48.46■■■■■ 5.35
AC079305.1-201ENST00000428541 FBLN2P98095 1184 aa48.44■■■■■ 5.34
AC079305.1-201ENST00000428541 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.41■■■■■ 5.34
AC079305.1-201ENST00000428541 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.41■■■■■ 5.34
AC079305.1-201ENST00000428541 PBRM1Q86U86 1689 aa48.35■■■■■ 5.33
AC079305.1-201ENST00000428541 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.27■■■■■ 5.32
AC079305.1-201ENST00000428541 SYNJ2O15056 1496 aa48.23■■■■■ 5.31
AC079305.1-201ENST00000428541 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.05■■■■■ 5.28
AC079305.1-201ENST00000428541 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.05■■■■■ 5.28
AC079305.1-201ENST00000428541 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.05■■■■■ 5.28
AC079305.1-201ENST00000428541 TRIM41Q8WV44 630 aa48.04■■■■■ 5.28
AC079305.1-201ENST00000428541 ARHGEF11O15085 1522 aa48.02■■■■■ 5.28
AC079305.1-201ENST00000428541 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48■■■■■ 5.27
AC079305.1-201ENST00000428541 ADAMTS12P58397 1594 aa47.96■■■■■ 5.27
AC079305.1-201ENST00000428541 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.96■■■■■ 5.27
AC079305.1-201ENST00000428541 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.9■■■■■ 5.26
AC079305.1-201ENST00000428541 GRIN2AQ12879 1464 aa47.88■■■■■ 5.26
AC079305.1-201ENST00000428541 KIF27Q86VH2 1401 aa47.78■■■■■ 5.24
AC079305.1-201ENST00000428541 NUP160Q12769 1436 aa47.68■■■■■ 5.22
AC079305.1-201ENST00000428541 CEP170Q5SW79 1584 aa47.65■■■■■ 5.22
AC079305.1-201ENST00000428541 IGF1RP08069 1367 aa47.64■■■■■ 5.22
AC079305.1-201ENST00000428541 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.63■■■■■ 5.22
AC079305.1-201ENST00000428541 ARAP1Q96P48 1450 aa47.61■■■■■ 5.21
AC079305.1-201ENST00000428541 CUL7Q14999 1698 aa47.49■■■■■ 5.19
AC079305.1-201ENST00000428541 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.35■■■■■ 5.17
AC079305.1-201ENST00000428541 SHROOM2Q13796 1616 aa47.34■■■■■ 5.17
AC079305.1-201ENST00000428541 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.27■■■■■ 5.16
AC079305.1-201ENST00000428541 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.26■■■■■ 5.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms