RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303212.2

NRTN-201, Transcript of neurturin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NRTN, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRTN-201ENST00000303212 NISCHQ9Y2I1 1504 aa69.5■■■■■ 8.72
NRTN-201ENST00000303212 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa62.17■■■■■ 7.54
NRTN-201ENST00000303212 ABCC9O60706 1549 aa61.42■■■■■ 7.42
NRTN-201ENST00000303212 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.85■■■■■ 7.01
NRTN-201ENST00000303212 NACADO15069 1562 aa58.6■■■■■ 6.97
NRTN-201ENST00000303212 DCAF8L2P0C7V8 631 aa58.35■■■■■ 6.93
NRTN-201ENST00000303212 MYO15BQ96JP2 1530 aa58.02■■■■■ 6.88
NRTN-201ENST00000303212 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP57.77■■■■■ 6.84
NRTN-201ENST00000303212 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa57.51■■■■■ 6.8
NRTN-201ENST00000303212 UNC13AQ9UPW8 1703 aa57.41■■■■■ 6.78
NRTN-201ENST00000303212 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP57.22■■■■■ 6.75
NRTN-201ENST00000303212 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.98■■■■■ 6.71
NRTN-201ENST00000303212 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.85■■■■■ 6.69
NRTN-201ENST00000303212 SCRIBQ14160 1630 aa56.63■■■■■ 6.66
NRTN-201ENST00000303212 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa56.49■■■■■ 6.63
NRTN-201ENST00000303212 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP55.6■■■■■ 6.49
NRTN-201ENST00000303212 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55.54■■■■■ 6.48
NRTN-201ENST00000303212 CECR2Q9BXF3 1484 aa55.29■■■■■ 6.44
NRTN-201ENST00000303212 SMARCA4P51532 1647 aa54.1■■■■■ 6.25
NRTN-201ENST00000303212 NCAPD3P42695 1498 aa54.03■■■■■ 6.24
NRTN-201ENST00000303212 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP53.98■■■■■ 6.23
NRTN-201ENST00000303212 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.95■■■■■ 6.23
NRTN-201ENST00000303212 SMARCA2P51531 1590 aa53.93■■■■■ 6.22
NRTN-201ENST00000303212 HMGXB3Q12766 1538 aa53.76■■■■■ 6.2
NRTN-201ENST00000303212 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.58■■■■■ 6.17
NRTN-201ENST00000303212 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53.53■■■■■ 6.16
NRTN-201ENST00000303212 MROH2BQ7Z745 1585 aa53.52■■■■■ 6.16
NRTN-201ENST00000303212 ERCC6Q03468 1493 aa53.08■■■■■ 6.09
NRTN-201ENST00000303212 WIZO95785 1651 aa52.92■■■■■ 6.06
NRTN-201ENST00000303212 NESP48681 1621 aa52.9■■■■■ 6.06
NRTN-201ENST00000303212 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.78■■■■■ 6.04
NRTN-201ENST00000303212 CUX2O14529 1486 aa52.75■■■■■ 6.04
NRTN-201ENST00000303212 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.66■■■■■ 6.02
NRTN-201ENST00000303212 PDS5BQ9NTI5 1447 aa52.46■■■■■ 5.99
NRTN-201ENST00000303212 CADPSQ9ULU8 1353 aa52.43■■■■■ 5.98
NRTN-201ENST00000303212 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP52.38■■■■■ 5.98
NRTN-201ENST00000303212 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP52.31■■■■■ 5.96
NRTN-201ENST00000303212 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa52.31■■■■■ 5.96
NRTN-201ENST00000303212 CFTRP13569 1480 aa51.97■■■■■ 5.91
NRTN-201ENST00000303212 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.93■■■■■ 5.9
NRTN-201ENST00000303212 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.89■■■■■ 5.9
NRTN-201ENST00000303212 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.85■■■■■ 5.89
NRTN-201ENST00000303212 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.84■■■■■ 5.89
NRTN-201ENST00000303212 WDR62O43379 1518 aa51.78■■■■■ 5.88
NRTN-201ENST00000303212 CCDC88BA6NC98 1476 aa51.7■■■■■ 5.87
NRTN-201ENST00000303212 PRDM2Q13029 1718 aa51.58■■■■■ 5.85
NRTN-201ENST00000303212 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP51.33■■■■■ 5.81
NRTN-201ENST00000303212 ABCC8Q09428 1581 aa50.96■■■■■ 5.75
NRTN-201ENST00000303212 TOPBP1Q92547 1522 aa50.93■■■■■ 5.74
NRTN-201ENST00000303212 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.85■■■■■ 5.73
NRTN-201ENST00000303212 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.83■■■■■ 5.73
NRTN-201ENST00000303212 IFT140Q96RY7 1462 aa50.82■■■■■ 5.73
NRTN-201ENST00000303212 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.57■■■■■ 5.69
NRTN-201ENST00000303212 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.45■■■■■ 5.67
NRTN-201ENST00000303212 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP50.42■■■■■ 5.66
NRTN-201ENST00000303212 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP50.4■■■■■ 5.66
NRTN-201ENST00000303212 OSCARQ8IYS5 282 aa50.4■■■■■ 5.66
NRTN-201ENST00000303212 CUX1P39880 1505 aa50.26■■■■■ 5.64
NRTN-201ENST00000303212 SOGA1O94964 1423 aa50.24■■■■■ 5.63
NRTN-201ENST00000303212 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.24■■■■■ 5.63
NRTN-201ENST00000303212 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP50.2■■■■■ 5.63
NRTN-201ENST00000303212 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50.2■■■■■ 5.63
NRTN-201ENST00000303212 WDR97A6NE52 1622 aa50.08■■■■■ 5.61
NRTN-201ENST00000303212 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.01■■■■■ 5.6
NRTN-201ENST00000303212 CHD1O14646 1710 aa49.88■■■■■ 5.58
NRTN-201ENST00000303212 TRIM41Q8WV44 630 aa49.88■■■■■ 5.58
NRTN-201ENST00000303212 FBLN2P98095 1184 aa49.8■■■■■ 5.56
NRTN-201ENST00000303212 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.78■■■■■ 5.56
NRTN-201ENST00000303212 GRIN2BQ13224 1484 aa49.77■■■■■ 5.56
NRTN-201ENST00000303212 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.74■■■■■ 5.55
NRTN-201ENST00000303212 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.73■■■■■ 5.55
NRTN-201ENST00000303212 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.72■■■■■ 5.55
NRTN-201ENST00000303212 TOP2BQ02880 1626 aa49.7■■■■■ 5.55
NRTN-201ENST00000303212 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.7■■■■■ 5.55
NRTN-201ENST00000303212 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.67■■■■■ 5.54
NRTN-201ENST00000303212 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.67■■■■■ 5.54
NRTN-201ENST00000303212 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.67■■■■■ 5.54
NRTN-201ENST00000303212 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.66■■■■■ 5.54
NRTN-201ENST00000303212 PBRM1Q86U86 1689 aa49.61■■■■■ 5.53
NRTN-201ENST00000303212 SYNJ1O43426 1573 aa49.61■■■■■ 5.53
NRTN-201ENST00000303212 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49.59■■■■■ 5.53
NRTN-201ENST00000303212 ARHGEF11O15085 1522 aa49.59■■■■■ 5.53
NRTN-201ENST00000303212 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.57■■■■■ 5.53
NRTN-201ENST00000303212 SYNJ2O15056 1496 aa49.52■■■■■ 5.52
NRTN-201ENST00000303212 CLASP1Q7Z460 1538 aa49.33■■■■■ 5.49
NRTN-201ENST00000303212 ADAMTS12P58397 1594 aa49.18■■■■■ 5.46
NRTN-201ENST00000303212 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49.14■■■■■ 5.46
NRTN-201ENST00000303212 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49.13■■■■■ 5.46
NRTN-201ENST00000303212 ARAP1Q96P48 1450 aa49.12■■■■■ 5.45
NRTN-201ENST00000303212 GRIN2AQ12879 1464 aa49.11■■■■■ 5.45
NRTN-201ENST00000303212 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49.08■■■■■ 5.45
NRTN-201ENST00000303212 NUP160Q12769 1436 aa48.9■■■■■ 5.42
NRTN-201ENST00000303212 CEP170Q5SW79 1584 aa48.87■■■■■ 5.41
NRTN-201ENST00000303212 KIF27Q86VH2 1401 aa48.77■■■■■ 5.4
NRTN-201ENST00000303212 SHROOM2Q13796 1616 aa48.61■■■■■ 5.37
NRTN-201ENST00000303212 CUL7Q14999 1698 aa48.6■■■■■ 5.37
NRTN-201ENST00000303212 IGF1RP08069 1367 aa48.57■■■■■ 5.37
NRTN-201ENST00000303212 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.53■■■■■ 5.36
NRTN-201ENST00000303212 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.48■■■■■ 5.35
NRTN-201ENST00000303212 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.44■■■■■ 5.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms