RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468084.1

C1orf122-204, Transcript of chromosome 1 open reading frame 122, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene C1orf122, Length 1,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf122-204ENST00000468084 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.15■■■■■ 8.18
C1orf122-204ENST00000468084 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.81■■■■■ 7.01
C1orf122-204ENST00000468084 ABCC9O60706 1549 aa57.49■■■■■ 6.79
C1orf122-204ENST00000468084 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.35■■■■■ 6.45
C1orf122-204ENST00000468084 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.31■■■■■ 6.44
C1orf122-204ENST00000468084 NACADO15069 1562 aa55.27■■■■■ 6.44
C1orf122-204ENST00000468084 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.13■■■■■ 6.42
C1orf122-204ENST00000468084 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.92■■■■■ 6.38
C1orf122-204ENST00000468084 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.72■■■■■ 6.35
C1orf122-204ENST00000468084 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.02■■■■■ 6.24
C1orf122-204ENST00000468084 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.7■■■■■ 6.19
C1orf122-204ENST00000468084 SCRIBQ14160 1630 aa53.7■■■■■ 6.19
C1orf122-204ENST00000468084 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.57■■■■■ 6.17
C1orf122-204ENST00000468084 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.1■■■■■ 6.09
C1orf122-204ENST00000468084 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.56■■■■■ 6
C1orf122-204ENST00000468084 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.21■■■■■ 5.95
C1orf122-204ENST00000468084 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.98■■■■■ 5.91
C1orf122-204ENST00000468084 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.65■■■■■ 5.86
C1orf122-204ENST00000468084 SMARCA4P51532 1647 aa51.34■■■■■ 5.81
C1orf122-204ENST00000468084 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.31■■■■■ 5.8
C1orf122-204ENST00000468084 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.01■■■■■ 5.76
C1orf122-204ENST00000468084 SMARCA2P51531 1590 aa51.01■■■■■ 5.76
C1orf122-204ENST00000468084 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.98■■■■■ 5.75
C1orf122-204ENST00000468084 NCAPD3P42695 1498 aa50.96■■■■■ 5.75
C1orf122-204ENST00000468084 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.8■■■■■ 5.72
C1orf122-204ENST00000468084 HMGXB3Q12766 1538 aa50.77■■■■■ 5.72
C1orf122-204ENST00000468084 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.66■■■■■ 5.7
C1orf122-204ENST00000468084 WIZO95785 1651 aa50.44■■■■■ 5.66
C1orf122-204ENST00000468084 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.41■■■■■ 5.66
C1orf122-204ENST00000468084 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.95■■■■■ 5.59
C1orf122-204ENST00000468084 NESP48681 1621 aa49.73■■■■■ 5.55
C1orf122-204ENST00000468084 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.66■■■■■ 5.54
C1orf122-204ENST00000468084 ERCC6Q03468 1493 aa49.61■■■■■ 5.53
C1orf122-204ENST00000468084 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.5■■■■■ 5.51
C1orf122-204ENST00000468084 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.33■■■■■ 5.49
C1orf122-204ENST00000468084 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.31■■■■■ 5.48
C1orf122-204ENST00000468084 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.26■■■■■ 5.48
C1orf122-204ENST00000468084 CFTRP13569 1480 aa49.21■■■■■ 5.47
C1orf122-204ENST00000468084 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.17■■■■■ 5.46
C1orf122-204ENST00000468084 CUX2O14529 1486 aa48.99■■■■■ 5.43
C1orf122-204ENST00000468084 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.98■■■■■ 5.43
C1orf122-204ENST00000468084 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.96■■■■■ 5.43
C1orf122-204ENST00000468084 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.93■■■■■ 5.42
C1orf122-204ENST00000468084 PRDM2Q13029 1718 aa48.89■■■■■ 5.42
C1orf122-204ENST00000468084 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.82■■■■■ 5.41
C1orf122-204ENST00000468084 WDR62O43379 1518 aa48.64■■■■■ 5.38
C1orf122-204ENST00000468084 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.43■■■■■ 5.34
C1orf122-204ENST00000468084 ABCC8Q09428 1581 aa48.2■■■■■ 5.31
C1orf122-204ENST00000468084 TOPBP1Q92547 1522 aa48.18■■■■■ 5.3
C1orf122-204ENST00000468084 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.15■■■■■ 5.3
C1orf122-204ENST00000468084 IFT140Q96RY7 1462 aa47.88■■■■■ 5.26
C1orf122-204ENST00000468084 CUX1P39880 1505 aa47.82■■■■■ 5.25
C1orf122-204ENST00000468084 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.78■■■■■ 5.24
C1orf122-204ENST00000468084 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.69■■■■■ 5.22
C1orf122-204ENST00000468084 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.62■■■■■ 5.21
C1orf122-204ENST00000468084 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.61■■■■■ 5.21
C1orf122-204ENST00000468084 SOGA1O94964 1423 aa47.58■■■■■ 5.21
C1orf122-204ENST00000468084 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.58■■■■■ 5.21
C1orf122-204ENST00000468084 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.55■■■■■ 5.2
C1orf122-204ENST00000468084 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.49■■■■■ 5.19
C1orf122-204ENST00000468084 TOP2BQ02880 1626 aa47.45■■■■■ 5.19
C1orf122-204ENST00000468084 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.45■■■■■ 5.19
C1orf122-204ENST00000468084 SYNJ1O43426 1573 aa47.44■■■■■ 5.18
C1orf122-204ENST00000468084 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.36■■■■■ 5.172e-7■■■■■ 29.4
C1orf122-204ENST00000468084 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.33■■■■■ 5.17
C1orf122-204ENST00000468084 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.3■■■■■ 5.16
C1orf122-204ENST00000468084 WDR97A6NE52 1622 aa47.3■■■■■ 5.16
C1orf122-204ENST00000468084 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.2■■■■■ 5.15
C1orf122-204ENST00000468084 GRIN2BQ13224 1484 aa47.04■■■■■ 5.12
C1orf122-204ENST00000468084 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.04■■■■■ 5.12
C1orf122-204ENST00000468084 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.02■■■■■ 5.12
C1orf122-204ENST00000468084 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.97■■■■■ 5.11
C1orf122-204ENST00000468084 OSCARQ8IYS5 282 aa46.96■■■■■ 5.11
C1orf122-204ENST00000468084 PBRM1Q86U86 1689 aa46.96■■■■■ 5.11
C1orf122-204ENST00000468084 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.91■■■■■ 5.1
C1orf122-204ENST00000468084 FBLN2P98095 1184 aa46.86■■■■■ 5.09
C1orf122-204ENST00000468084 CHD1O14646 1710 aa46.85■■■■■ 5.09
C1orf122-204ENST00000468084 SYNJ2O15056 1496 aa46.72■■■■■ 5.07
C1orf122-204ENST00000468084 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.72■■■■■ 5.07
C1orf122-204ENST00000468084 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.66■■■■■ 5.06
C1orf122-204ENST00000468084 KIF27Q86VH2 1401 aa46.6■■■■■ 5.05
C1orf122-204ENST00000468084 ADAMTS12P58397 1594 aa46.6■■■■■ 5.05
C1orf122-204ENST00000468084 TRIM41Q8WV44 630 aa46.53■■■■■ 5.04
C1orf122-204ENST00000468084 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.51■■■■■ 5.04
C1orf122-204ENST00000468084 GRIN2AQ12879 1464 aa46.43■■■■■ 5.02
C1orf122-204ENST00000468084 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.33■■■■■ 5.01
C1orf122-204ENST00000468084 IGF1RP08069 1367 aa46.32■■■■■ 5.01
C1orf122-204ENST00000468084 CUL7Q14999 1698 aa46.28■■■■■ 5
C1orf122-204ENST00000468084 ARHGEF11O15085 1522 aa46.22■■■■■ 4.99
C1orf122-204ENST00000468084 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.21■■■■■ 4.99
C1orf122-204ENST00000468084 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.21■■■■■ 4.99
C1orf122-204ENST00000468084 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.21■■■■■ 4.99
C1orf122-204ENST00000468084 NUP160Q12769 1436 aa46.19■■■■■ 4.98
C1orf122-204ENST00000468084 CEP170Q5SW79 1584 aa46.18■■■■■ 4.98
C1orf122-204ENST00000468084 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.12■■■■■ 4.97
C1orf122-204ENST00000468084 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.09■■■■■ 4.97
C1orf122-204ENST00000468084 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.93■■■■■ 4.94
C1orf122-204ENST00000468084 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.85■■■■■ 4.93
C1orf122-204ENST00000468084 ARAP1Q96P48 1450 aa45.84■■■■■ 4.93
C1orf122-204ENST00000468084 SHROOM2Q13796 1616 aa45.83■■■■■ 4.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms