Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.092e-8■■■■■ 29.6
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GTF2F1P35269 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.791e-6■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 TRAF7-202ENST00000564067 874 ntTSL 320.62■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 29.6
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GTF2F1P35269 ARPC1B-212ENST00000455009 580 ntTSL 321.91■■□□□ 1.11e-6■■■■■ 29.6
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GTF2F1P35269 ARPC1B-205ENST00000427217 545 ntTSL 321.65■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 ARPC1B-213ENST00000458033 561 ntTSL 221.65■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 ARPC1B-206ENST00000429246 348 ntTSL 521.65■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 ARPC1B-203ENST00000417330 559 ntTSL 221.65■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 29.6
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GTF2F1P35269 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 ARPC1B-209ENST00000443222 669 ntTSL 217.28■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 29.6
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GTF2F1P35269 ADARB1-209ENST00000464215 389 ntTSL 38.06□□□□□ -1.127e-8■■■■■ 29.5
GTF2F1P35269 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.396e-8■■■■■ 29.5
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GTF2F1P35269 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.071e-7■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.181e-7■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 CSDE1-212ENST00000529046 571 ntTSL 47.27□□□□□ -1.251e-7■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.291e-7■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 CSDE1-211ENST00000525970 503 ntTSL 46.85□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 CSDE1-210ENST00000525878 626 ntTSL 46.37□□□□□ -1.391e-7■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 CSDE1-208ENST00000524652 562 ntTSL 44.28□□□□□ -1.721e-7■■■■■ 29.4
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GTF2F1P35269 EHBP1-219ENST00000494958 1127 ntTSL 1 (best)6.29□□□□□ -1.42e-13■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 ALDH16A1-204ENST00000593417 2343 ntTSL 225.9■■□□□ 1.741e-7■■■■■ 29.4
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GTF2F1P35269 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.163e-9■■■■■ 29.4
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GTF2F1P35269 SNRNP70-204ENST00000595231 1673 ntTSL 1 (best)24.05■■□□□ 1.443e-8■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 SNRNP70-209ENST00000601065 1757 ntTSL 323.02■■□□□ 1.283e-8■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 SNRNP70-202ENST00000401730 3144 ntTSL 219.75■□□□□ 0.753e-8■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 EPB41-206ENST00000373798 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 29.4
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GTF2F1P35269 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.392e-12■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.142e-12■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.072e-12■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.032e-12■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.962e-12■■■■■ 29.4
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GTF2F1P35269 PKMYT1-214ENST00000574415 1006 ntTSL 518.66■□□□□ 0.582e-12■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 PKMYT1-207ENST00000572059 880 ntTSL 518.51■□□□□ 0.552e-12■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 PKMYT1-208ENST00000572619 495 ntTSL 417.58■□□□□ 0.42e-12■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.713e-7■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 F7-206ENST00000541084 2873 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 F7-202ENST00000375581 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.233e-7■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 B3GNTL1-202ENST00000570947 390 ntTSL 312.44□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.212e-8■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 HDGF-209ENST00000495212 744 ntTSL 322.5■■□□□ 1.192e-8■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 HDGF-205ENST00000469145 844 ntTSL 220.92■□□□□ 0.942e-8■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 HDGF-208ENST00000482651 966 ntTSL 39.67□□□□□ -0.862e-8■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.236e-7■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 HDLBP-244ENST00000490697 581 ntTSL 419.84■□□□□ 0.775e-9■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 HDLBP-212ENST00000426343 594 ntTSL 419.84■□□□□ 0.775e-9■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 HDLBP-208ENST00000422080 578 ntTSL 319.84■□□□□ 0.775e-9■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.065e-9■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 HDLBP-227ENST00000458564 420 ntTSL 311.94□□□□□ -0.55e-9■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 HDLBP-224ENST00000452065 996 ntTSL 511.92□□□□□ -0.55e-9■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 HDLBP-213ENST00000427007 459 ntTSL 311.64□□□□□ -0.555e-9■■■■■ 29.4
GTF2F1P35269 HDLBP-222ENST00000449504 566 ntTSL 58.57□□□□□ -1.045e-9■■■■■ 29.4
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