RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422080.5

HDLBP-208, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 3

Gene HDLBP, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-208	ENST00000422080	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		43.89	■■■■■ 4.62
HDLBP-208	ENST00000422080	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		39.14	■■■■□ 3.86
HDLBP-208	ENST00000422080	ABCC9	O60706	1549 aa		38.89	■■■■□ 3.82
HDLBP-208	ENST00000422080	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37.16	■■■■□ 3.54
HDLBP-208	ENST00000422080	NACAD	O15069	1562 aa		37.02	■■■■□ 3.52
HDLBP-208	ENST00000422080	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		36.97	■■■■□ 3.51
HDLBP-208	ENST00000422080	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		36.67	■■■■□ 3.46
HDLBP-208	ENST00000422080	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	36.43	■■■■□ 3.42
HDLBP-208	ENST00000422080	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	36.33	■■■■□ 3.41
HDLBP-208	ENST00000422080	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		36.31	■■■■□ 3.4
HDLBP-208	ENST00000422080	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		36.26	■■■■□ 3.4
HDLBP-208	ENST00000422080	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.11	■■■■□ 3.37
HDLBP-208	ENST00000422080	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.03	■■■■□ 3.36
HDLBP-208	ENST00000422080	SCRIB	Q14160	1630 aa		35.68	■■■■□ 3.3
HDLBP-208	ENST00000422080	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		35.67	■■■■□ 3.3
HDLBP-208	ENST00000422080	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	35.14	■■■■□ 3.22
HDLBP-208	ENST00000422080	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.1	■■■■□ 3.21
HDLBP-208	ENST00000422080	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.03	■■■■□ 3.2
HDLBP-208	ENST00000422080	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.23	■■■■□ 3.07
HDLBP-208	ENST00000422080	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.14	■■■■□ 3.06
HDLBP-208	ENST00000422080	SMARCA4	P51532	1647 aa		34.1	■■■■□ 3.05
HDLBP-208	ENST00000422080	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.03	■■■■□ 3.04
HDLBP-208	ENST00000422080	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	34.03	■■■■□ 3.04
HDLBP-208	ENST00000422080	HMGXB3	Q12766	1538 aa		33.93	■■■■□ 3.02
HDLBP-208	ENST00000422080	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		33.81	■■■■□ 3
HDLBP-208	ENST00000422080	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	33.8	■■■■□ 3
HDLBP-208	ENST00000422080	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		33.8	■■■■□ 3
HDLBP-208	ENST00000422080	ERCC6	Q03468	1493 aa		33.56	■■■□□ 2.96
HDLBP-208	ENST00000422080	NES	P48681	1621 aa		33.48	■■■□□ 2.95
HDLBP-208	ENST00000422080	CUX2	O14529	1486 aa		33.42	■■■□□ 2.94
HDLBP-208	ENST00000422080	WIZ	O95785	1651 aa		33.33	■■■□□ 2.93
HDLBP-208	ENST00000422080	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.32	■■■□□ 2.92
HDLBP-208	ENST00000422080	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
HDLBP-208	ENST00000422080	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.22	■■■□□ 2.91
HDLBP-208	ENST00000422080	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.2	■■■□□ 2.91
HDLBP-208	ENST00000422080	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		33.1	■■■□□ 2.89
HDLBP-208	ENST00000422080	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
HDLBP-208	ENST00000422080	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
HDLBP-208	ENST00000422080	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		32.94	■■■□□ 2.86
HDLBP-208	ENST00000422080	CFTR	P13569	1480 aa		32.88	■■■□□ 2.85
HDLBP-208	ENST00000422080	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		32.84	■■■□□ 2.85
HDLBP-208	ENST00000422080	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		32.77	■■■□□ 2.84
HDLBP-208	ENST00000422080	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		32.77	■■■□□ 2.84
HDLBP-208	ENST00000422080	WDR62	O43379	1518 aa		32.72	■■■□□ 2.83
HDLBP-208	ENST00000422080	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		32.67	■■■□□ 2.82
HDLBP-208	ENST00000422080	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
HDLBP-208	ENST00000422080	PRDM2	Q13029	1718 aa		32.33	■■■□□ 2.77
HDLBP-208	ENST00000422080	ABCC8	Q09428	1581 aa		32.2	■■■□□ 2.75
HDLBP-208	ENST00000422080	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.18	■■■□□ 2.74
HDLBP-208	ENST00000422080	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.14	■■■□□ 2.74
HDLBP-208	ENST00000422080	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
HDLBP-208	ENST00000422080	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.07	■■■□□ 2.72
HDLBP-208	ENST00000422080	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.04	■■■□□ 2.72
HDLBP-208	ENST00000422080	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
HDLBP-208	ENST00000422080	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
HDLBP-208	ENST00000422080	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
HDLBP-208	ENST00000422080	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	31.8	■■■□□ 2.68	2e-16	■■■■□ 25
HDLBP-208	ENST00000422080	SOGA1	O94964	1423 aa		31.8	■■■□□ 2.68
HDLBP-208	ENST00000422080	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
HDLBP-208	ENST00000422080	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		31.76	■■■□□ 2.67
HDLBP-208	ENST00000422080	CUX1	P39880	1505 aa		31.74	■■■□□ 2.67
HDLBP-208	ENST00000422080	TRIM41	Q8WV44	630 aa		31.72	■■■□□ 2.67
HDLBP-208	ENST00000422080	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		31.72	■■■□□ 2.67
HDLBP-208	ENST00000422080	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
HDLBP-208	ENST00000422080	WDR97	A6NE52	1622 aa		31.56	■■■□□ 2.64
HDLBP-208	ENST00000422080	FBLN2	P98095	1184 aa		31.55	■■■□□ 2.64
HDLBP-208	ENST00000422080	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.46	■■■□□ 2.63
HDLBP-208	ENST00000422080	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.45	■■■□□ 2.62
HDLBP-208	ENST00000422080	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.41	■■■□□ 2.62
HDLBP-208	ENST00000422080	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		31.41	■■■□□ 2.62
HDLBP-208	ENST00000422080	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.41	■■■□□ 2.62
HDLBP-208	ENST00000422080	CHD1	O14646	1710 aa		31.4	■■■□□ 2.62
HDLBP-208	ENST00000422080	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		31.39	■■■□□ 2.62
HDLBP-208	ENST00000422080	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		31.39	■■■□□ 2.62
HDLBP-208	ENST00000422080	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		31.39	■■■□□ 2.62
HDLBP-208	ENST00000422080	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		31.39	■■■□□ 2.62
HDLBP-208	ENST00000422080	ARHGEF11	O15085	1522 aa		31.39	■■■□□ 2.61
HDLBP-208	ENST00000422080	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	31.38	■■■□□ 2.61
HDLBP-208	ENST00000422080	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.3	■■■□□ 2.6
HDLBP-208	ENST00000422080	TOP2B	Q02880	1626 aa		31.29	■■■□□ 2.6
HDLBP-208	ENST00000422080	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		31.25	■■■□□ 2.59
HDLBP-208	ENST00000422080	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		31.24	■■■□□ 2.59
HDLBP-208	ENST00000422080	SYNJ1	O43426	1573 aa		31.24	■■■□□ 2.59
HDLBP-208	ENST00000422080	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		31.24	■■■□□ 2.59
HDLBP-208	ENST00000422080	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.17	■■■□□ 2.58
HDLBP-208	ENST00000422080	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		31.17	■■■□□ 2.58
HDLBP-208	ENST00000422080	ARAP1	Q96P48	1450 aa		31.11	■■■□□ 2.57
HDLBP-208	ENST00000422080	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.03	■■■□□ 2.56
HDLBP-208	ENST00000422080	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.02	■■■□□ 2.56
HDLBP-208	ENST00000422080	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		31.01	■■■□□ 2.55
HDLBP-208	ENST00000422080	ADAMTS12	P58397	1594 aa		30.99	■■■□□ 2.55
HDLBP-208	ENST00000422080	NUP160	Q12769	1436 aa		30.94	■■■□□ 2.54
HDLBP-208	ENST00000422080	CEP170	Q5SW79	1584 aa		30.83	■■■□□ 2.53
HDLBP-208	ENST00000422080	KIF27	Q86VH2	1401 aa		30.8	■■■□□ 2.52
HDLBP-208	ENST00000422080	IGF1R	P08069	1367 aa		30.78	■■■□□ 2.52
HDLBP-208	ENST00000422080	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	30.76	■■■□□ 2.51
HDLBP-208	ENST00000422080	JPH4	Q96JJ6	628 aa		30.7	■■■□□ 2.51
HDLBP-208	ENST00000422080	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		30.68	■■■□□ 2.5
HDLBP-208	ENST00000422080	SHROOM2	Q13796	1616 aa		30.67	■■■□□ 2.5
HDLBP-208	ENST00000422080	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	30.61	■■■□□ 2.49

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