RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565383.5

TRAF7-203, Transcript of TNF receptor associated factor 7, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAF7, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7-203ENST00000565383 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.81■■■■■ 6.85
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TRAF7-203ENST00000565383 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.62■■■■■ 5.53
TRAF7-203ENST00000565383 NACADO15069 1562 aa49.24■■■■■ 5.47
TRAF7-203ENST00000565383 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.96■■■■■ 5.43
TRAF7-203ENST00000565383 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.88■■■■■ 5.42
TRAF7-203ENST00000565383 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.49■■■■■ 5.35
TRAF7-203ENST00000565383 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.46■■■■■ 5.35
TRAF7-203ENST00000565383 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.44■■■■■ 5.35
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TRAF7-203ENST00000565383 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.56■■■■■ 5.2
TRAF7-203ENST00000565383 SCRIBQ14160 1630 aa47.34■■■■■ 5.17
TRAF7-203ENST00000565383 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.11■■■■■ 5.13
TRAF7-203ENST00000565383 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.02■■■■■ 5.12
TRAF7-203ENST00000565383 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.97■■■■■ 5.11
TRAF7-203ENST00000565383 NCAPD3P42695 1498 aa45.42■■■■■ 4.86
TRAF7-203ENST00000565383 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.23■■■■■ 4.83
TRAF7-203ENST00000565383 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.21■■■■■ 4.83
TRAF7-203ENST00000565383 SMARCA2P51531 1590 aa45.16■■■■■ 4.82
TRAF7-203ENST00000565383 SMARCA4P51532 1647 aa45.15■■■■■ 4.82
TRAF7-203ENST00000565383 ERCC6Q03468 1493 aa45.1■■■■■ 4.81
TRAF7-203ENST00000565383 HMGXB3Q12766 1538 aa45.09■■■■■ 4.81
TRAF7-203ENST00000565383 CUX2O14529 1486 aa45.08■■■■■ 4.81
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TRAF7-203ENST00000565383 NESP48681 1621 aa44.69■■■■■ 4.74
TRAF7-203ENST00000565383 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.51■■■■■ 4.72
TRAF7-203ENST00000565383 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.47■■■■■ 4.71
TRAF7-203ENST00000565383 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.34■■■■■ 4.69
TRAF7-203ENST00000565383 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.22■■■■■ 4.67
TRAF7-203ENST00000565383 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.17■■■■■ 4.66
TRAF7-203ENST00000565383 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.02■■■■■ 4.64
TRAF7-203ENST00000565383 WIZO95785 1651 aa43.98■■■■■ 4.63
TRAF7-203ENST00000565383 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.82■■■■■ 4.6
TRAF7-203ENST00000565383 WDR62O43379 1518 aa43.71■■■■■ 4.59
TRAF7-203ENST00000565383 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.63■■■■■ 4.57
TRAF7-203ENST00000565383 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.53■■■■■ 4.56
TRAF7-203ENST00000565383 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.52■■■■■ 4.56
TRAF7-203ENST00000565383 CFTRP13569 1480 aa43.48■■■■■ 4.55
TRAF7-203ENST00000565383 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.46■■■■■ 4.55
TRAF7-203ENST00000565383 TRIM41Q8WV44 630 aa43.15■■■■■ 4.5
TRAF7-203ENST00000565383 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.14■■■■■ 4.5
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TRAF7-203ENST00000565383 OSCARQ8IYS5 282 aa42.97■■■■■ 4.47
TRAF7-203ENST00000565383 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.92■■■■■ 4.46
TRAF7-203ENST00000565383 IFT140Q96RY7 1462 aa42.75■■■■■ 4.43
TRAF7-203ENST00000565383 TOPBP1Q92547 1522 aa42.67■■■■■ 4.42
TRAF7-203ENST00000565383 ABCC8Q09428 1581 aa42.65■■■■■ 4.42
TRAF7-203ENST00000565383 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
TRAF7-203ENST00000565383 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.52■■■■■ 4.4
TRAF7-203ENST00000565383 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.39
TRAF7-203ENST00000565383 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.41■■■■■ 4.38
TRAF7-203ENST00000565383 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.41■■■■■ 4.38
TRAF7-203ENST00000565383 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.41■■■■■ 4.38
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TRAF7-203ENST00000565383 ARHGEF11O15085 1522 aa42.26■■■■■ 4.36
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TRAF7-203ENST00000565383 CHD1O14646 1710 aa42.17■■■■■ 4.34
TRAF7-203ENST00000565383 SOGA1O94964 1423 aa42.04■■■■■ 4.32
TRAF7-203ENST00000565383 FBLN2P98095 1184 aa42.04■■■■■ 4.32
TRAF7-203ENST00000565383 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.03■■■■■ 4.32
TRAF7-203ENST00000565383 WDR97A6NE52 1622 aa41.95■■■■■ 4.31
TRAF7-203ENST00000565383 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.95■■■■■ 4.31
TRAF7-203ENST00000565383 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
TRAF7-203ENST00000565383 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.93■■■■■ 4.3
TRAF7-203ENST00000565383 CUX1P39880 1505 aa41.85■■■■■ 4.29
TRAF7-203ENST00000565383 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.83■■■■■ 4.29
TRAF7-203ENST00000565383 ARAP1Q96P48 1450 aa41.8■■■■■ 4.28
TRAF7-203ENST00000565383 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
TRAF7-203ENST00000565383 GRIN2BQ13224 1484 aa41.72■■■■■ 4.27
TRAF7-203ENST00000565383 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
TRAF7-203ENST00000565383 SYNJ1O43426 1573 aa41.68■■■■■ 4.26
TRAF7-203ENST00000565383 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.66■■■■■ 4.26
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TRAF7-203ENST00000565383 PBRM1Q86U86 1689 aa41.55■■■■■ 4.24
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TRAF7-203ENST00000565383 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
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TRAF7-203ENST00000565383 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.28■■■■■ 4.2
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TRAF7-203ENST00000565383 GRIN2AQ12879 1464 aa41.17■■■■■ 4.18
TRAF7-203ENST00000565383 TOP2BQ02880 1626 aa41.16■■■■■ 4.18
TRAF7-203ENST00000565383 ADAMTS12P58397 1594 aa41.12■■■■■ 4.17
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TRAF7-203ENST00000565383 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.01■■■■■ 4.16
TRAF7-203ENST00000565383 CEP170Q5SW79 1584 aa41■■■■■ 4.15
TRAF7-203ENST00000565383 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.97■■■■■ 4.15
TRAF7-203ENST00000565383 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.94■■■■■ 4.14
TRAF7-203ENST00000565383 SHROOM2Q13796 1616 aa40.88■■■■■ 4.13
TRAF7-203ENST00000565383 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
TRAF7-203ENST00000565383 JPH4Q96JJ6 628 aa40.61■■■■■ 4.09
TRAF7-203ENST00000565383 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
TRAF7-203ENST00000565383 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.55■■■■■ 4.08
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