Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.177e-7■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.153e-7■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.143e-7■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RPL10-215ENST00000489200 1519 ntTSL 215.38■□□□□ 0.054e-10■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 ZNF692-216ENST00000491971 805 ntTSL 215.01□□□□□ -0.015e-26■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.023e-7■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.027e-7■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.023e-7■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 PRAME-213ENST00000492657 2831 ntTSL 1 (best)14.82□□□□□ -0.043e-7■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RPL10-218ENST00000618723 2210 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.074e-10■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 INTS11-246ENST00000534345 485 ntTSL 414.51□□□□□ -0.092e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RPL10-214ENST00000485196 839 ntTSL 214.5□□□□□ -0.094e-10■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.116e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 COX4I1-211ENST00000566405 490 ntTSL 514.27□□□□□ -0.136e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RPL10-207ENST00000436473 657 ntTSL 214.25□□□□□ -0.134e-10■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RPL8-208ENST00000529163 556 ntTSL 214.12□□□□□ -0.152e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RPL10-204ENST00000424325 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.214e-10■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.266e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RPL10-213ENST00000482732 1731 ntTSL 1 (best)13.07□□□□□ -0.324e-10■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RPL10-216ENST00000491035 1369 ntTSL 512.88□□□□□ -0.354e-10■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RPL10-201ENST00000344746 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)12.43□□□□□ -0.424e-10■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 NCAPG2-203ENST00000409423 3957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.66e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 SH2B1-210ENST00000566176 546 ntTSL 411.29□□□□□ -0.66e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 COX4I1-217ENST00000569997 3946 nt10.85□□□□□ -0.676e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2K-205ENST00000510719 566 ntTSL 310.56□□□□□ -0.726e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 COX4I1-207ENST00000564648 1235 ntTSL 510.42□□□□□ -0.746e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 NCAPG2-205ENST00000441982 2926 ntTSL 29.8□□□□□ -0.846e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 NCAPG2-206ENST00000467785 3276 ntTSL 1 (best)9.69□□□□□ -0.866e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 NCAPG2-204ENST00000432615 4134 ntTSL 59.62□□□□□ -0.876e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.226e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 KSR1-208ENST00000579309 343 ntTSL 57.07□□□□□ -1.282e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0.66□□□□□ -2.33e-7■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 OAZ1-208ENST00000592727 726 ntTSL 218.4■□□□□ 0.541e-20■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 SNHG1-216ENST00000541416 996 ntTSL 215.04■□□□□ -01e-323■□□□□ 9
AATFQ9NY61 SNHG1-207ENST00000537965 578 ntTSL 56.48□□□□□ -1.371e-323■□□□□ 9
AATFQ9NY61 SNHG1-214ENST00000540865 784 ntTSL 55.62□□□□□ -1.511e-323■□□□□ 9
AATFQ9NY61 SNHG1-203ENST00000537024 532 ntTSL 54.34□□□□□ -1.711e-323■□□□□ 9
AATFQ9NY61 SNHG1-222ENST00000545308 646 ntTSL 23.53□□□□□ -1.841e-323■□□□□ 9
AATFQ9NY61 SNHG1-202ENST00000535689 550 ntTSL 23.34□□□□□ -1.871e-323■□□□□ 9
AATFQ9NY61 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.951e-323■□□□□ 9
AATFQ9NY61 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41e-323■□□□□ 9
AATFQ9NY61 MAP3K2-202ENST00000409179 689 ntTSL 530.69■■■□□ 2.55e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 NFE2L2-205ENST00000430047 451 ntTSL 328.49■■■□□ 2.155e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 ATP6V0B-210ENST00000498208 419 ntTSL 528.4■■■□□ 2.145e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.845e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 ATP6V0B-208ENST00000473485 1664 ntTSL 226.25■■□□□ 1.795e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 SNRPA-211ENST00000601545 695 ntTSL 525.77■■□□□ 1.725e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.715e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 ATP6V0B-203ENST00000468183 2432 ntTSL 1 (best)25.2■■□□□ 1.625e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.435e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 ATP6V0B-206ENST00000472277 536 ntTSL 322.9■■□□□ 1.265e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.245e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 ATP6V0B-202ENST00000461670 530 ntTSL 521.51■■□□□ 1.035e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.995e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 SNRPA-210ENST00000601393 969 ntTSL 320.43■□□□□ 0.865e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 NFE2L2-210ENST00000462023 521 ntTSL 219.11■□□□□ 0.655e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.585e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.585e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.355e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 ATP6V0B-209ENST00000496131 962 ntTSL 316.87■□□□□ 0.295e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 ATP6V0B-207ENST00000472505 411 ntTSL 515.99■□□□□ 0.155e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 NFE2L2-211ENST00000464747 2749 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.295e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 UPF1-213ENST00000601981 556 ntTSL 512.1□□□□□ -0.475e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 NFE2L2-214ENST00000588123 814 ntTSL 511.45□□□□□ -0.585e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 ATP6V0B-212ENST00000532072 577 ntTSL 48.56□□□□□ -1.045e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 NFE2L2-213ENST00000586532 942 ntTSL 53.28□□□□□ -1.885e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.965e-6■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.442e-35■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.092e-35■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 SRSF5-215ENST00000556587 1863 ntTSL 1 (best)14.47□□□□□ -0.092e-35■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.172e-35■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 SRSF5-217ENST00000557154 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.462e-35■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 SRSF5-212ENST00000556184 2443 ntTSL 1 (best)11.92□□□□□ -0.52e-35■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 SRSF5-208ENST00000554929 947 ntTSL 211.9□□□□□ -0.52e-35■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 SRSF5-216ENST00000556647 644 ntTSL 211.9□□□□□ -0.52e-35■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 SRSF5-211ENST00000555547 2057 ntTSL 510.34□□□□□ -0.752e-35■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 SRSF5-207ENST00000554465 3044 ntTSL 1 (best)9.29□□□□□ -0.922e-35■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.975e-8■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 LRCH4-205ENST00000485554 774 ntTSL 321.86■■□□□ 1.095e-8■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 SRRM2-221ENST00000574866 638 ntTSL 321.7■■□□□ 1.065e-8■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 SRRM2-228ENST00000576878 1141 ntTSL 221.15■□□□□ 0.985e-8■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 SRRM2-218ENST00000574331 1759 ntTSL 220.72■□□□□ 0.915e-8■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 SRRM2-220ENST00000574593 1440 ntTSL 319.25■□□□□ 0.675e-8■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.615e-8■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.55e-8■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.74e-22■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 GGA2-208ENST00000566685 571 ntTSL 419.93■□□□□ 0.784e-22■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 GGA2-213ENST00000568922 1807 ntTSL 214.97□□□□□ -0.014e-22■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 GGA2-201ENST00000309859 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.494e-22■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 GGA2-210ENST00000567339 293 ntTSL 311.91□□□□□ -0.54e-22■□□□□ 8.9
AATFQ9NY61 PFKL-210ENST00000496824 1063 ntTSL 524.19■■□□□ 1.461e-7■□□□□ 8.8
AATFQ9NY61 SNRPA-202ENST00000596860 336 ntTSL 210.48□□□□□ -0.733e-6■□□□□ 8.8
AATFQ9NY61 U1.22-201ENST00000605806 164 ntBASIC9.55□□□□□ -0.887e-7■□□□□ 8.8
AATFQ9NY61 GLUL-205ENST00000461447 689 ntTSL 213.96□□□□□ -0.172e-6■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.84e-7■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 MVD-213ENST00000566636 863 ntTSL 324■■□□□ 1.434e-7■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.274e-7■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 MVD-214ENST00000567064 758 ntTSL 322.75■■□□□ 1.234e-7■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 MVD-216ENST00000568709 809 ntTSL 522.68■■□□□ 1.224e-7■□□□□ 8.7
AATFQ9NY61 MVD-208ENST00000563785 888 ntTSL 222.67■■□□□ 1.224e-7■□□□□ 8.7
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