RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498208.1

ATP6V0B-210, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit b, humanhuman

TSL 5

Gene ATP6V0B, Length 419 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0B-210ENST00000498208 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.16■■■■■ 6.9
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ATP6V0B-210ENST00000498208 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.75■■■■■ 5.55
ATP6V0B-210ENST00000498208 NACADO15069 1562 aa49.38■■■■■ 5.5
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ATP6V0B-210ENST00000498208 SCRIBQ14160 1630 aa47.59■■■■■ 5.21
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ATP6V0B-210ENST00000498208 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.09■■■■■ 5.13
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ATP6V0B-210ENST00000498208 CUX2O14529 1486 aa45.07■■■■■ 4.81
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ATP6V0B-210ENST00000498208 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.93■■■■■ 4.62
ATP6V0B-210ENST00000498208 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.85■■■■■ 4.61
ATP6V0B-210ENST00000498208 WDR62O43379 1518 aa43.84■■■■■ 4.61
ATP6V0B-210ENST00000498208 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.75■■■■■ 4.59
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ATP6V0B-210ENST00000498208 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.7■■■■■ 4.59
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ATP6V0B-210ENST00000498208 OSCARQ8IYS5 282 aa42.99■■■■■ 4.47
ATP6V0B-210ENST00000498208 IFT140Q96RY7 1462 aa42.87■■■■■ 4.45
ATP6V0B-210ENST00000498208 TOPBP1Q92547 1522 aa42.87■■■■■ 4.45
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ATP6V0B-210ENST00000498208 ABCC8Q09428 1581 aa42.77■■■■■ 4.44
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ATP6V0B-210ENST00000498208 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
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ATP6V0B-210ENST00000498208 CHD1O14646 1710 aa42.32■■■■■ 4.36
ATP6V0B-210ENST00000498208 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.27■■■■■ 4.36
ATP6V0B-210ENST00000498208 SOGA1O94964 1423 aa42.21■■■■■ 4.35
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ATP6V0B-210ENST00000498208 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.99■■■■■ 4.31
ATP6V0B-210ENST00000498208 ARAP1Q96P48 1450 aa41.9■■■■■ 4.3
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ATP6V0B-210ENST00000498208 SYNJ1O43426 1573 aa41.77■■■■■ 4.28
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ATP6V0B-210ENST00000498208 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.64■■■■■ 4.26
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ATP6V0B-210ENST00000498208 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.48■■■■■ 4.23
ATP6V0B-210ENST00000498208 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.44■■■■■ 4.22
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ATP6V0B-210ENST00000498208 ADAMTS12P58397 1594 aa41.32■■■■■ 4.2
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ATP6V0B-210ENST00000498208 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.18■■■■■ 4.18
ATP6V0B-210ENST00000498208 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.15■■■■■ 4.18
ATP6V0B-210ENST00000498208 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.15■■■■■ 4.18
ATP6V0B-210ENST00000498208 SHROOM2Q13796 1616 aa41.04■■■■■ 4.16
ATP6V0B-210ENST00000498208 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
ATP6V0B-210ENST00000498208 JPH4Q96JJ6 628 aa40.75■■■■■ 4.11
ATP6V0B-210ENST00000498208 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.74■■■■■ 4.11
ATP6V0B-210ENST00000498208 KIF27Q86VH2 1401 aa40.59■■■■■ 4.09
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