RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397062.7

NFE2L2-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2L2, Length 2,853 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L2-201ENST00000397062 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.12■■■□□ 2.25
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NFE2L2-201ENST00000397062 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
NFE2L2-201ENST00000397062 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.28■■□□□ 1.8
NFE2L2-201ENST00000397062 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
NFE2L2-201ENST00000397062 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
NFE2L2-201ENST00000397062 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.54■■□□□ 1.68
NFE2L2-201ENST00000397062 MYT1Q01538 1121 aa25.49■■□□□ 1.67
NFE2L2-201ENST00000397062 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.48■■□□□ 1.67
NFE2L2-201ENST00000397062 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.18■■□□□ 1.62
NFE2L2-201ENST00000397062 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.06■■□□□ 1.6
NFE2L2-201ENST00000397062 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.99■■□□□ 1.59
NFE2L2-201ENST00000397062 NEUROD1Q13562 356 aa24.98■■□□□ 1.59
NFE2L2-201ENST00000397062 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
NFE2L2-201ENST00000397062 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.92■■□□□ 1.58
NFE2L2-201ENST00000397062 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
NFE2L2-201ENST00000397062 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
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NFE2L2-201ENST00000397062 BCL11AQ9H165 835 aa24.29■■□□□ 1.48
NFE2L2-201ENST00000397062 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.26■■□□□ 1.47
NFE2L2-201ENST00000397062 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
NFE2L2-201ENST00000397062 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
NFE2L2-201ENST00000397062 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
NFE2L2-201ENST00000397062 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
NFE2L2-201ENST00000397062 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.13■■□□□ 1.45
NFE2L2-201ENST00000397062 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
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NFE2L2-201ENST00000397062 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.79■■□□□ 1.4
NFE2L2-201ENST00000397062 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.74■■□□□ 1.39
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NFE2L2-201ENST00000397062 MIER1Q8N108 512 aa23.64■■□□□ 1.38
NFE2L2-201ENST00000397062 TRIM41Q8WV44 630 aa23.62■■□□□ 1.37
NFE2L2-201ENST00000397062 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.52■■□□□ 1.36
NFE2L2-201ENST00000397062 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
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NFE2L2-201ENST00000397062 NACADO15069 1562 aa23.32■■□□□ 1.32
NFE2L2-201ENST00000397062 BCANQ96GW7 911 aa23.21■■□□□ 1.31
NFE2L2-201ENST00000397062 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.07■■□□□ 1.28
NFE2L2-201ENST00000397062 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
NFE2L2-201ENST00000397062 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
NFE2L2-201ENST00000397062 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.87■■□□□ 1.25
NFE2L2-201ENST00000397062 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.86■■□□□ 1.25
NFE2L2-201ENST00000397062 MSH5O43196 834 aa22.83■■□□□ 1.25
NFE2L2-201ENST00000397062 ITGAEP38570 1179 aa22.83■■□□□ 1.24
NFE2L2-201ENST00000397062 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
NFE2L2-201ENST00000397062 FKBP8Q14318 412 aa22.82■■□□□ 1.24
NFE2L2-201ENST00000397062 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
NFE2L2-201ENST00000397062 KCNH8Q96L42 1107 aa22.75■■□□□ 1.23
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NFE2L2-201ENST00000397062 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.65■■□□□ 1.22
NFE2L2-201ENST00000397062 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.6■■□□□ 1.21
NFE2L2-201ENST00000397062 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.59■■□□□ 1.21
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NFE2L2-201ENST00000397062 WIZO95785 1651 aa22.43■■□□□ 1.18
NFE2L2-201ENST00000397062 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
NFE2L2-201ENST00000397062 NBR1Q14596 966 aa22.38■■□□□ 1.17
NFE2L2-201ENST00000397062 TRIM52Q96A61 297 aa22.36■■□□□ 1.17
NFE2L2-201ENST00000397062 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
NFE2L2-201ENST00000397062 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NFE2L2-201ENST00000397062 CEP162Q5TB80 1403 aa22.33■■□□□ 1.16
NFE2L2-201ENST00000397062 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NFE2L2-201ENST00000397062 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
NFE2L2-201ENST00000397062 SMARCA4P51532 1647 aa22.3■■□□□ 1.16
NFE2L2-201ENST00000397062 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
NFE2L2-201ENST00000397062 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.26■■□□□ 1.15
NFE2L2-201ENST00000397062 IL27Q8NEV9 243 aa22.21■■□□□ 1.15
NFE2L2-201ENST00000397062 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NFE2L2-201ENST00000397062 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NFE2L2-201ENST00000397062 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.13■■□□□ 1.13
NFE2L2-201ENST00000397062 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NFE2L2-201ENST00000397062 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NFE2L2-201ENST00000397062 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
NFE2L2-201ENST00000397062 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.04■■□□□ 1.12
NFE2L2-201ENST00000397062 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NFE2L2-201ENST00000397062 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NFE2L2-201ENST00000397062 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.98■■□□□ 1.11
NFE2L2-201ENST00000397062 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.97■■□□□ 1.11
NFE2L2-201ENST00000397062 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.97■■□□□ 1.11
NFE2L2-201ENST00000397062 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
NFE2L2-201ENST00000397062 SOGA1O94964 1423 aa21.95■■□□□ 1.1
NFE2L2-201ENST00000397062 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
NFE2L2-201ENST00000397062 SMARCA2P51531 1590 aa21.95■■□□□ 1.1
NFE2L2-201ENST00000397062 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.92■■□□□ 1.1
NFE2L2-201ENST00000397062 ABCC8Q09428 1581 aa21.91■■□□□ 1.1
NFE2L2-201ENST00000397062 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
NFE2L2-201ENST00000397062 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.89■■□□□ 1.09
NFE2L2-201ENST00000397062 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
NFE2L2-201ENST00000397062 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.86■■□□□ 1.09
NFE2L2-201ENST00000397062 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.83■■□□□ 1.08
NFE2L2-201ENST00000397062 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.081e-9■■■□□ 17
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