Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.581e-7■■■■□ 22
FMR1Q06787 HYOU1-210ENST00000531968 550 ntTSL 418.22■□□□□ 0.516e-11■■■■□ 22
FMR1Q06787 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.092e-6■■■■□ 22
FMR1Q06787 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.992e-6■■■■□ 22
FMR1Q06787 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.432e-6■■■■□ 22
FMR1Q06787 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.292e-6■■■■□ 22
FMR1Q06787 SLC4A2-210ENST00000480107 793 ntTSL 216.73■□□□□ 0.272e-6■■■■□ 22
FMR1Q06787 TBC1D10B-206ENST00000490703 1031 ntTSL 321.42■■□□□ 1.025e-10■■■■□ 22
FMR1Q06787 TBC1D10B-204ENST00000475872 558 ntTSL 420.51■□□□□ 0.875e-10■■■■□ 22
FMR1Q06787 TBC1D10B-207ENST00000566671 561 ntTSL 217.7■□□□□ 0.425e-10■■■■□ 22
FMR1Q06787 TBC1D10B-203ENST00000475650 2484 ntTSL 217.36■□□□□ 0.375e-10■■■■□ 22
FMR1Q06787 DCTN1-218ENST00000466110 5414 ntTSL 213.47□□□□□ -0.252e-6■■■■□ 22
FMR1Q06787 DCTN1-227ENST00000633691 4160 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 22
FMR1Q06787 DCTN1-204ENST00000409438 4145 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 22
FMR1Q06787 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.651e-7■■■■□ 22
FMR1Q06787 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.681e-7■■■■□ 22
FMR1Q06787 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.48■□□□□ 0.551e-7■■■■□ 22
FMR1Q06787 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.441e-7■■■■□ 22
FMR1Q06787 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.441e-7■■■■□ 22
FMR1Q06787 SMARCC2-205ENST00000548130 1238 ntTSL 510.97□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 22
FMR1Q06787 ACAP2-205ENST00000447662 700 ntTSL 521.23■□□□□ 0.996e-7■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 ACAP2-214ENST00000490224 578 ntTSL 421.23■□□□□ 0.996e-7■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 ACAP2-211ENST00000480906 1802 ntTSL 1 (best)18.63■□□□□ 0.576e-7■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.166e-7■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 ACAP2-215ENST00000618471 3207 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.696e-7■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 SNRNP200-201ENST00000323853 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.541e-7■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 TLE3-209ENST00000557919 4294 ntTSL 516.64■□□□□ 0.253e-6■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 LTBP4-229ENST00000601032 2019 ntTSL 1 (best)18.67■□□□□ 0.589e-7■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.343e-7■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 VPS18-201ENST00000220509 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.553e-7■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 IPO4-220ENST00000561462 1864 ntTSL 218.65■□□□□ 0.581e-7■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 SPG11-219ENST00000559822 561 ntTSL 515.66■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 IPO4-218ENST00000561199 3249 ntTSL 213.75□□□□□ -0.211e-7■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 IPO4-203ENST00000558046 3440 ntTSL 213.69□□□□□ -0.221e-7■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 IPO4-207ENST00000558780 3540 ntTSL 213.61□□□□□ -0.231e-7■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 IPO4-214ENST00000560798 3581 ntTSL 213.5□□□□□ -0.251e-7■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 IPO4-211ENST00000560155 3485 ntTSL 1 (best)13.24□□□□□ -0.291e-7■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 SPG11-212ENST00000558790 858 ntTSL 312.89□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 AL136295.4-201ENST00000561419 4351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.361e-7■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 IPO4-217ENST00000561090 3632 ntTSL 212.74□□□□□ -0.371e-7■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 SPG11-217ENST00000559511 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.61□□□□□ -0.391e-6■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 IPO4-201ENST00000354464 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.431e-7■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 IPO4-209ENST00000559588 3537 ntTSL 1 (best)11.92□□□□□ -0.51e-7■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 KLHL21-205ENST00000496707 824 ntTSL 1 (best)21.63■■□□□ 1.051e-7■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 HUWE1-201ENST00000218328 5488 ntTSL 518.94■□□□□ 0.629e-7■■■■□ 21.9
FMR1Q06787 MSH6-207ENST00000456246 846 ntTSL 322.49■■□□□ 1.194e-7■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.144e-8■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.014e-8■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 POLG-213ENST00000631044 4668 ntTSL 514.71□□□□□ -0.064e-8■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 POLG-217ENST00000636774 4151 ntTSL 514.01□□□□□ -0.174e-8■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 DNMT1-215ENST00000588913 1775 ntTSL 521.64■■□□□ 1.061e-6■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.047e-7■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.142e-7■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.893e-6■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.073e-6■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.13e-6■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.069e-7■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.129e-7■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.149e-7■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 MSH6-204ENST00000445503 4158 ntTSL 1 (best)13.47□□□□□ -0.259e-7■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.619e-7■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.412e-7■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.112e-7■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.532e-7■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.072e-7■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 DIAPH1-213ENST00000523100 1180 ntTSL 530.11■■■□□ 2.415e-7■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 PKN1-214ENST00000592794 322 ntTSL 421.64■■□□□ 1.052e-6■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 EPRS-206ENST00000609181 2968 ntTSL 1 (best)12.17□□□□□ -0.462e-9■■■■□ 21.8
FMR1Q06787 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.647e-7■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.497e-7■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 MTA2-203ENST00000526844 627 ntTSL 313.27□□□□□ -0.295e-8■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 KIAA0100-211ENST00000581064 555 ntTSL 216.11■□□□□ 0.177e-7■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 USP5-206ENST00000542087 438 ntTSL 318.63■□□□□ 0.577e-6■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.317e-6■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.027e-6■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.057e-6■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 USP5-202ENST00000389231 3083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.217e-6■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 EIF4G1-236ENST00000484862 590 ntTSL 212.27□□□□□ -0.456e-8■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 AARS-207ENST00000569825 871 ntTSL 220.43■□□□□ 0.861e-19■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 HSPA4-204ENST00000615899 2204 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.033e-9■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.341e-6■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.525e-9■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.371e-6■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 VCP-205ENST00000479300 559 ntTSL 1 (best)8.94□□□□□ -0.983e-7■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.054e-7■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.054e-7■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.312e-6■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 STAT5A-203ENST00000468096 893 ntTSL 312.94□□□□□ -0.342e-6■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 NUP98-215ENST00000529063 544 ntTSL 38.02□□□□□ -1.133e-7■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.559e-7■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.59e-7■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 TRAP1-215ENST00000576106 555 ntTSL 428.55■■■□□ 2.161e-6■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 TRAP1-205ENST00000571011 480 ntTSL 527.22■■□□□ 1.951e-6■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 TRAP1-211ENST00000574941 558 ntTSL 424.17■■□□□ 1.461e-6■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 COPA-202ENST00000368069 4664 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.363e-8■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 COPA-201ENST00000241704 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.523e-8■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.081e-6■■■■□ 21.7
FMR1Q06787 LCP1-207ENST00000494531 537 ntTSL 310.53□□□□□ -0.723e-11■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.561e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.151e-6■■■■□ 21.6
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 99.4 ms