RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576106.5

TRAP1-215, Transcript of TNF receptor associated protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene TRAP1, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAP1-215ENST00000576106 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.8■■■■■ 6.52
TRAP1-215ENST00000576106 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.63■■■■■ 5.54
TRAP1-215ENST00000576106 ABCC9O60706 1549 aa48.99■■■■■ 5.43
TRAP1-215ENST00000576106 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.97■■■■■ 5.11
TRAP1-215ENST00000576106 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.9■■■■■ 5.1
TRAP1-215ENST00000576106 NACADO15069 1562 aa46.86■■■■■ 5.09
TRAP1-215ENST00000576106 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.49■■■■■ 5.03
TRAP1-215ENST00000576106 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.4■■■■■ 5.02
TRAP1-215ENST00000576106 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.16■■■■■ 4.98
TRAP1-215ENST00000576106 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.8■■■■■ 4.92
TRAP1-215ENST00000576106 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.64■■■■■ 4.9
TRAP1-215ENST00000576106 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.49■■■■■ 4.87
TRAP1-215ENST00000576106 SCRIBQ14160 1630 aa45.3■■■■■ 4.84
TRAP1-215ENST00000576106 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.28■■■■■ 4.84
TRAP1-215ENST00000576106 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.1■■■■■ 4.81
TRAP1-215ENST00000576106 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.36■■■■■ 4.69
TRAP1-215ENST00000576106 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.24■■■■■ 4.67
TRAP1-215ENST00000576106 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.08■■■■■ 4.65
TRAP1-215ENST00000576106 SMARCA4P51532 1647 aa43.3■■■■■ 4.52
TRAP1-215ENST00000576106 NCAPD3P42695 1498 aa43.28■■■■■ 4.52
TRAP1-215ENST00000576106 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.28■■■■■ 4.52
TRAP1-215ENST00000576106 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.24■■■■■ 4.51
TRAP1-215ENST00000576106 SMARCA2P51531 1590 aa43.16■■■■■ 4.5
TRAP1-215ENST00000576106 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.98■■■■■ 4.47
TRAP1-215ENST00000576106 HMGXB3Q12766 1538 aa42.97■■■■■ 4.47
TRAP1-215ENST00000576106 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.9■■■■■ 4.46
TRAP1-215ENST00000576106 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
TRAP1-215ENST00000576106 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.44■■■■■ 4.38
TRAP1-215ENST00000576106 WIZO95785 1651 aa42.42■■■■■ 4.38
TRAP1-215ENST00000576106 ERCC6Q03468 1493 aa42.3■■■■■ 4.36
TRAP1-215ENST00000576106 NESP48681 1621 aa42.27■■■■■ 4.36
TRAP1-215ENST00000576106 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.12■■■■■ 4.33
TRAP1-215ENST00000576106 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.04■■■■■ 4.32
TRAP1-215ENST00000576106 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
TRAP1-215ENST00000576106 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.96■■■■■ 4.31
TRAP1-215ENST00000576106 CUX2O14529 1486 aa41.95■■■■■ 4.31
TRAP1-215ENST00000576106 CFTRP13569 1480 aa41.68■■■■■ 4.26
TRAP1-215ENST00000576106 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
TRAP1-215ENST00000576106 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.62■■■■■ 4.25
TRAP1-215ENST00000576106 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.58■■■■■ 4.25
TRAP1-215ENST00000576106 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.51■■■■■ 4.24
TRAP1-215ENST00000576106 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.49■■■■■ 4.23
TRAP1-215ENST00000576106 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.48■■■■■ 4.23
TRAP1-215ENST00000576106 WDR62O43379 1518 aa41.31■■■■■ 4.2
TRAP1-215ENST00000576106 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
TRAP1-215ENST00000576106 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.09■■■■■ 4.17
TRAP1-215ENST00000576106 PRDM2Q13029 1718 aa41.07■■■■■ 4.17
TRAP1-215ENST00000576106 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.16
TRAP1-215ENST00000576106 ABCC8Q09428 1581 aa40.82■■■■■ 4.12
TRAP1-215ENST00000576106 TOPBP1Q92547 1522 aa40.78■■■■■ 4.12
TRAP1-215ENST00000576106 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.69■■■■■ 4.1
TRAP1-215ENST00000576106 IFT140Q96RY7 1462 aa40.64■■■■■ 4.1
TRAP1-215ENST00000576106 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
TRAP1-215ENST00000576106 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
TRAP1-215ENST00000576106 CUX1P39880 1505 aa40.34■■■■■ 4.05
TRAP1-215ENST00000576106 SOGA1O94964 1423 aa40.32■■■■■ 4.04
TRAP1-215ENST00000576106 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
TRAP1-215ENST00000576106 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.27■■■■■ 4.04
TRAP1-215ENST00000576106 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.26■■■■■ 4.03
TRAP1-215ENST00000576106 OSCARQ8IYS5 282 aa40.25■■■■■ 4.03
TRAP1-215ENST00000576106 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.22■■■■■ 4.033e-7■■■■□ 25.5
TRAP1-215ENST00000576106 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
TRAP1-215ENST00000576106 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
TRAP1-215ENST00000576106 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.04■■■■■ 43e-7■■■■□ 25.1
TRAP1-215ENST00000576106 WDR97A6NE52 1622 aa40■■■■□ 3.99
TRAP1-215ENST00000576106 FBLN2P98095 1184 aa39.89■■■■□ 3.98
TRAP1-215ENST00000576106 TOP2BQ02880 1626 aa39.89■■■■□ 3.98
TRAP1-215ENST00000576106 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.89■■■■□ 3.98
TRAP1-215ENST00000576106 GRIN2BQ13224 1484 aa39.87■■■■□ 3.97
TRAP1-215ENST00000576106 SYNJ1O43426 1573 aa39.84■■■■□ 3.97
TRAP1-215ENST00000576106 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.83■■■■□ 3.97
TRAP1-215ENST00000576106 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.81■■■■□ 3.96
TRAP1-215ENST00000576106 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.81■■■■□ 3.96
TRAP1-215ENST00000576106 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
TRAP1-215ENST00000576106 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.73■■■■□ 3.95
TRAP1-215ENST00000576106 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.66■■■■□ 3.94
TRAP1-215ENST00000576106 CHD1O14646 1710 aa39.66■■■■□ 3.94
TRAP1-215ENST00000576106 SYNJ2O15056 1496 aa39.62■■■■□ 3.93
TRAP1-215ENST00000576106 TRIM41Q8WV44 630 aa39.61■■■■□ 3.93
TRAP1-215ENST00000576106 PBRM1Q86U86 1689 aa39.56■■■■□ 3.92
TRAP1-215ENST00000576106 ARHGEF11O15085 1522 aa39.47■■■■□ 3.91
TRAP1-215ENST00000576106 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.43■■■■□ 3.9
TRAP1-215ENST00000576106 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.43■■■■□ 3.9
TRAP1-215ENST00000576106 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.43■■■■□ 3.9
TRAP1-215ENST00000576106 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.4■■■■□ 3.9
TRAP1-215ENST00000576106 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.37■■■■□ 3.89
TRAP1-215ENST00000576106 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.35■■■■□ 3.89
TRAP1-215ENST00000576106 ADAMTS12P58397 1594 aa39.33■■■■□ 3.89
TRAP1-215ENST00000576106 GRIN2AQ12879 1464 aa39.31■■■■□ 3.88
TRAP1-215ENST00000576106 KIF27Q86VH2 1401 aa39.25■■■■□ 3.87
TRAP1-215ENST00000576106 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.23■■■■□ 3.87
TRAP1-215ENST00000576106 NUP160Q12769 1436 aa39.17■■■■□ 3.86
TRAP1-215ENST00000576106 ARAP1Q96P48 1450 aa39.13■■■■□ 3.85
TRAP1-215ENST00000576106 IGF1RP08069 1367 aa39.13■■■■□ 3.85
TRAP1-215ENST00000576106 CEP170Q5SW79 1584 aa39.06■■■■□ 3.84
TRAP1-215ENST00000576106 CUL7Q14999 1698 aa38.91■■■■□ 3.82
TRAP1-215ENST00000576106 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.9■■■■□ 3.82
TRAP1-215ENST00000576106 JPH4Q96JJ6 628 aa38.84■■■■□ 3.81
TRAP1-215ENST00000576106 SHROOM2Q13796 1616 aa38.8■■■■□ 3.8
TRAP1-215ENST00000576106 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.76■■■■□ 3.8
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