Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 NCAPD2-208ENST00000539714 533 ntTSL 37.55□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 29.7
UTP3Q9NQZ2 NCAPD2-210ENST00000541399 584 ntTSL 57.13□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 29.7
UTP3Q9NQZ2 CDC27-203ENST00000526866 1420 ntTSL 219.51■□□□□ 0.713e-7■■■■■ 29.6
UTP3Q9NQZ2 CDC27-210ENST00000533415 2570 ntTSL 214.87□□□□□ -0.033e-7■■■■■ 29.6
UTP3Q9NQZ2 CDC27-202ENST00000525495 1459 ntTSL 512.69□□□□□ -0.383e-7■■■■■ 29.6
UTP3Q9NQZ2 CDC27-204ENST00000527547 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.813e-7■■■■■ 29.6
UTP3Q9NQZ2 CDC27-201ENST00000066544 5801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.953e-7■■■■■ 29.6
UTP3Q9NQZ2 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.833e-7■■■■■ 29.6
UTP3Q9NQZ2 XIST-211ENST00000635841 1734 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.882e-8■■■■■ 29.6
UTP3Q9NQZ2 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 29.6
UTP3Q9NQZ2 RPL13A-206ENST00000476268 1623 ntTSL 319.48■□□□□ 0.712e-18■■■■■ 29.6
UTP3Q9NQZ2 RPL13A-205ENST00000474171 521 ntTSL 211.95□□□□□ -0.52e-18■■■■■ 29.6
UTP3Q9NQZ2 RPL13A-207ENST00000476300 619 ntTSL 311.03□□□□□ -0.642e-18■■■■■ 29.6
UTP3Q9NQZ2 RPL13A-203ENST00000468655 407 ntTSL 29.75□□□□□ -0.852e-18■■■■■ 29.6
UTP3Q9NQZ2 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.51e-7■■■■■ 29.6
UTP3Q9NQZ2 LONP1-207ENST00000588589 684 ntTSL 215.29■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 29.5
UTP3Q9NQZ2 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 29.5
UTP3Q9NQZ2 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 29.5
UTP3Q9NQZ2 TRIM28-209ENST00000597423 733 ntTSL 316.36■□□□□ 0.212e-9■■■■■ 29.5
UTP3Q9NQZ2 TRIM28-210ENST00000597618 609 ntTSL 210.73□□□□□ -0.692e-9■■■■■ 29.5
UTP3Q9NQZ2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 29.5
UTP3Q9NQZ2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 29.5
UTP3Q9NQZ2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 29.5
UTP3Q9NQZ2 ACTL6A-207ENST00000468767 622 ntTSL 316.31■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 29.5
UTP3Q9NQZ2 ACTL6A-214ENST00000494843 591 ntTSL 27.22□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 29.5
UTP3Q9NQZ2 ACTL6A-211ENST00000487978 916 ntTSL 55.9□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 29.5
UTP3Q9NQZ2 UBAP2L-207ENST00000428931 3988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 29.5
UTP3Q9NQZ2 UBAP2L-201ENST00000271877 3997 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 29.5
UTP3Q9NQZ2 UBAP2L-220ENST00000613315 3451 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 29.5
UTP3Q9NQZ2 UBAP2L-202ENST00000343815 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 29.5
UTP3Q9NQZ2 HDAC1-206ENST00000476391 2409 ntTSL 1 (best)14.87□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 29.4
UTP3Q9NQZ2 GPI-204ENST00000586392 1706 ntTSL 216.6■□□□□ 0.252e-8■■■■■ 29.4
UTP3Q9NQZ2 KMT2C-204ENST00000418061 710 ntTSL 56.99□□□□□ -1.292e-6■■■■■ 29.4
UTP3Q9NQZ2 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 29.4
UTP3Q9NQZ2 BSDC1-206ENST00000455895 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 29.4
UTP3Q9NQZ2 BSDC1-204ENST00000444377 2925 ntTSL 1 (best)12.65□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 29.4
UTP3Q9NQZ2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 29.4
UTP3Q9NQZ2 MFN2-201ENST00000235329 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 29.4
UTP3Q9NQZ2 SRSF4-208ENST00000634348 8128 ntTSL 513.76□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 29.4
UTP3Q9NQZ2 AHSA2-205ENST00000471542 1971 ntTSL 215.82■□□□□ 0.125e-6■■■■■ 29.4
UTP3Q9NQZ2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.239e-8■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.099e-8■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.029e-8■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.029e-8■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.039e-8■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.039e-8■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.179e-8■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.419e-8■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 CNBP-206ENST00000502372 1026 ntTSL 510.71□□□□□ -0.699e-8■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 MARCH3-203ENST00000504239 455 ntTSL 38.64□□□□□ -1.039e-8■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.069e-8■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 CTNND1-235ENST00000533189 498 ntTSL 311.31□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.015e-8■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.85e-8■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.545e-8■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 CFL1-210ENST00000530945 1509 ntTSL 218.06■□□□□ 0.485e-8■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.435e-8■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.085e-8■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 CFL1-207ENST00000527752 766 ntTSL 512.28□□□□□ -0.445e-8■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 P4HB-214ENST00000570907 353 ntTSL 36.43□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.723e-6■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 C19orf48-216ENST00000641834 1718 nt18.8■□□□□ 0.63e-6■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 C19orf48-203ENST00000593287 578 ntTSL 514.69□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 C19orf48-209ENST00000597705 892 ntTSL 313.4□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 C19orf48-208ENST00000597493 971 ntTSL 213.11□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 C19orf48-213ENST00000601267 782 ntTSL 212.91□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 CCNL2-220ENST00000505849 1503 ntTSL 217.06■□□□□ 0.325e-7■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 CCNL2-214ENST00000482365 2620 ntTSL 214.24□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 CCNL2-204ENST00000418865 3082 ntTSL 1 (best)11.82□□□□□ -0.525e-7■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.481e-11■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 PKN1-211ENST00000588200 548 ntTSL 314.06□□□□□ -0.161e-11■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 DNM2-215ENST00000590806 5651 ntTSL 217.45■□□□□ 0.383e-7■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 DNM2-214ENST00000590787 4299 ntTSL 212.78□□□□□ -0.363e-7■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.498e-7■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.188e-7■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.018e-7■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.598e-7■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.138e-7■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -08e-7■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.118e-7■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 SLC25A3-214ENST00000551123 1417 ntTSL 1 (best)13.45□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 SLC25A3-204ENST00000546766 3236 ntTSL 1 (best)11.27□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 SLC25A3-210ENST00000548480 722 ntTSL 25.42□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 29.3
UTP3Q9NQZ2 GPI-206ENST00000587384 810 ntTSL 319.97■□□□□ 0.793e-6■■■■■ 29.2
UTP3Q9NQZ2 GPI-207ENST00000587521 557 ntTSL 512.25□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 29.2
UTP3Q9NQZ2 RAB2A-206ENST00000481569 506 ntTSL 27.52□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 29.2
UTP3Q9NQZ2 MATR3-218ENST00000511978 573 ntTSL 39.53□□□□□ -0.885e-8■■■■■ 29.2
UTP3Q9NQZ2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 29.2
UTP3Q9NQZ2 P4HB-206ENST00000471535 579 ntTSL 425.42■■□□□ 1.662e-6■■■■■ 29.2
UTP3Q9NQZ2 P4HB-205ENST00000467086 785 ntTSL 524.85■■□□□ 1.572e-6■■■■■ 29.2
UTP3Q9NQZ2 P4HB-218ENST00000574007 1053 ntTSL 214.88□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 29.2
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