Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 INTS11-227ENST00000525603 738 ntTSL 315.31■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 33.3
UTP3Q9NQZ2 RAB21-201ENST00000261263 15546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 33.3
UTP3Q9NQZ2 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.613e-6■■■■■ 33.3
UTP3Q9NQZ2 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.653e-6■■■■■ 33.3
UTP3Q9NQZ2 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.24e-6■■■■■ 33.3
UTP3Q9NQZ2 SKP1-212ENST00000523966 899 ntTSL 36.92□□□□□ -1.34e-6■■■■■ 33.3
UTP3Q9NQZ2 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.564e-6■■■■■ 33.3
UTP3Q9NQZ2 STXBP5-202ENST00000367475 521 ntTSL 511.06□□□□□ -0.642e-8■■■■■ 33.2
UTP3Q9NQZ2 STXBP5-205ENST00000392291 791 ntTSL 58.48□□□□□ -1.052e-8■■■■■ 33.2
UTP3Q9NQZ2 YWHAG-201ENST00000307630 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.519e-8■■■■■ 33.2
UTP3Q9NQZ2 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 33.2
UTP3Q9NQZ2 GRHPR-207ENST00000491488 602 ntTSL 520.73■□□□□ 0.914e-10■■■■■ 33.2
UTP3Q9NQZ2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.484e-10■■■■■ 33.2
UTP3Q9NQZ2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.414e-10■■■■■ 33.2
UTP3Q9NQZ2 GRHPR-203ENST00000460882 1080 ntTSL 1 (best)17.38■□□□□ 0.374e-10■■■■■ 33.2
UTP3Q9NQZ2 YBX1-202ENST00000332220 776 ntTSL 522.48■■□□□ 1.192e-7■■■■■ 33.2
UTP3Q9NQZ2 SKIV2L-213ENST00000491994 866 ntTSL 216.22■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 33.2
UTP3Q9NQZ2 SKIV2L-206ENST00000470453 455 ntTSL 315.9■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 33.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.757e-8■■■■■ 33.2
UTP3Q9NQZ2 CALR-207ENST00000590325 781 ntTSL 215.35■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 33.2
UTP3Q9NQZ2 HDAC1-208ENST00000482310 779 ntTSL 514.33□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 33.2
UTP3Q9NQZ2 HDAC1-210ENST00000490081 1047 ntTSL 313.27□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 33.2
UTP3Q9NQZ2 LDLR-206ENST00000557958 1881 ntTSL 218.09■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 33.2
UTP3Q9NQZ2 RBM39-236ENST00000490484 871 ntTSL 511.03□□□□□ -0.648e-7■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 TRAP1-203ENST00000570403 521 ntTSL 424.13■■□□□ 1.454e-9■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 TRAP1-205ENST00000571011 480 ntTSL 522.51■■□□□ 1.194e-9■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 ISYNA1-214ENST00000583816 860 ntTSL 315.73■□□□□ 0.114e-9■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 ARL10-204ENST00000514533 258 ntTSL 315.67■□□□□ 0.14e-9■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 SRSF6-202ENST00000483871 1680 ntTSL 215.26■□□□□ 0.034e-9■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.154e-9■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 GANAB-207ENST00000526732 824 ntTSL 213.44□□□□□ -0.264e-9■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 JPX-205ENST00000602546 762 ntTSL 310.64□□□□□ -0.714e-9■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 JPX-208ENST00000602895 829 ntTSL 310.61□□□□□ -0.714e-9■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 SRSF6-201ENST00000244020 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.774e-9■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 JPX-210ENST00000602938 581 ntTSL 28.95□□□□□ -0.984e-9■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 RABGGTB-203ENST00000459697 1177 ntTSL 27.08□□□□□ -1.285e-8■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 SRSF11-209ENST00000463877 617 ntTSL 230.32■■■□□ 2.442e-9■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 SRSF11-211ENST00000473950 796 ntTSL 525.66■■□□□ 1.72e-9■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 SRSF11-210ENST00000469170 668 ntTSL 220.6■□□□□ 0.892e-9■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.973e-10■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.663e-10■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.113e-10■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 FAM83A-208ENST00000536633 3701 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.493e-10■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 HMGCR-204ENST00000504466 1107 ntTSL 28.03□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 CLASRP-214ENST00000591904 506 ntTSL 519.63■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 CLASRP-206ENST00000585615 633 ntTSL 216.12■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 SUGP2-204ENST00000593795 747 ntTSL 514.49□□□□□ -0.094e-8■■■■■ 33.1
UTP3Q9NQZ2 HNRNPU-217ENST00000638952 5678 ntTSL 520.55■□□□□ 0.886e-7■■■■■ 33
UTP3Q9NQZ2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.726e-7■■■■■ 33
UTP3Q9NQZ2 HNRNPU-209ENST00000476241 4844 ntTSL 518.35■□□□□ 0.536e-7■■■■■ 33
UTP3Q9NQZ2 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.46e-7■■■■■ 33
UTP3Q9NQZ2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.256e-7■■■■■ 33
UTP3Q9NQZ2 MACF1-224ENST00000496804 5065 ntTSL 59.68□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 33
UTP3Q9NQZ2 CANX-218ENST00000514032 1876 ntTSL 222.32■■□□□ 1.167e-7■■■■■ 33
UTP3Q9NQZ2 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.287e-7■■■■■ 33
UTP3Q9NQZ2 MSH5-214ENST00000468602 637 ntTSL 311.95□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 33
UTP3Q9NQZ2 LONP1-209ENST00000590206 725 ntTSL 313.59□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 33
UTP3Q9NQZ2 LENG8-AS1-203ENST00000448978 464 ntTSL 512.39□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 33
UTP3Q9NQZ2 LENG8-AS1-202ENST00000429922 871 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 33
UTP3Q9NQZ2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.651e-6■■■■■ 33
UTP3Q9NQZ2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 33
UTP3Q9NQZ2 BHLHE40-203ENST00000467610 1366 ntTSL 218.96■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 32.9
UTP3Q9NQZ2 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.068e-8■■■■■ 32.9
UTP3Q9NQZ2 RPS10-203ENST00000464218 615 ntTSL 513.57□□□□□ -0.248e-8■■■■■ 32.9
UTP3Q9NQZ2 RPS10-206ENST00000494077 781 ntTSL 212.56□□□□□ -0.48e-8■■■■■ 32.9
UTP3Q9NQZ2 RPS10-204ENST00000467531 777 ntTSL 211.96□□□□□ -0.498e-8■■■■■ 32.9
UTP3Q9NQZ2 RPS10-201ENST00000326199 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.638e-8■■■■■ 32.9
UTP3Q9NQZ2 RPS10-202ENST00000344700 650 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.698e-8■■■■■ 32.9
UTP3Q9NQZ2 REPIN1-205ENST00000467980 899 ntTSL 328.36■■■□□ 2.139e-7■■■■■ 32.9
UTP3Q9NQZ2 REPIN1-206ENST00000469309 910 ntTSL 226.13■■□□□ 1.779e-7■■■■■ 32.9
UTP3Q9NQZ2 REPIN1-215ENST00000495535 672 ntTSL 324.91■■□□□ 1.589e-7■■■■■ 32.9
UTP3Q9NQZ2 REPIN1-219ENST00000522266 480 ntTSL 224.91■■□□□ 1.589e-7■■■■■ 32.9
UTP3Q9NQZ2 REPIN1-207ENST00000473391 1064 ntTSL 221.14■□□□□ 0.979e-7■■■■■ 32.9
UTP3Q9NQZ2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.769e-7■■■■■ 32.9
UTP3Q9NQZ2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.619e-7■■■■■ 32.9
UTP3Q9NQZ2 REPIN1-218ENST00000519397 583 ntTSL 416.37■□□□□ 0.219e-7■■■■■ 32.9
UTP3Q9NQZ2 REPIN1-212ENST00000487455 464 ntTSL 49.85□□□□□ -0.839e-7■■■■■ 32.9
UTP3Q9NQZ2 CCNL2-215ENST00000482621 2059 ntTSL 216.77■□□□□ 0.278e-7■■■■■ 32.9
UTP3Q9NQZ2 NELFA-208ENST00000443203 553 ntTSL 415.11■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 32.8
UTP3Q9NQZ2 BRD4-211ENST00000602230 751 ntTSL 314.07□□□□□ -0.166e-12■■■■■ 32.8
UTP3Q9NQZ2 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 32.8
UTP3Q9NQZ2 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 32.8
UTP3Q9NQZ2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.373e-6■■■■■ 32.8
UTP3Q9NQZ2 NELFCD-201ENST00000460601 2137 ntTSL 1 (best)18.32■□□□□ 0.523e-6■■■■■ 32.8
UTP3Q9NQZ2 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.056e-7■■■■■ 32.8
UTP3Q9NQZ2 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.086e-7■■■■■ 32.8
UTP3Q9NQZ2 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.256e-7■■■■■ 32.8
UTP3Q9NQZ2 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.266e-7■■■■■ 32.8
UTP3Q9NQZ2 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.36e-7■■■■■ 32.8
UTP3Q9NQZ2 ZC3H11A-213ENST00000638800 7078 ntTSL 56.07□□□□□ -1.446e-7■■■■■ 32.8
UTP3Q9NQZ2 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.666e-7■■■■■ 32.8
UTP3Q9NQZ2 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.156e-10■■■■■ 32.7
UTP3Q9NQZ2 ERP29-201ENST00000261735 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.366e-10■■■■■ 32.7
UTP3Q9NQZ2 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.17e-11■■■■■ 32.7
UTP3Q9NQZ2 TXNDC12-204ENST00000472624 800 ntTSL 514.38□□□□□ -0.117e-11■■■■■ 32.7
UTP3Q9NQZ2 TXNDC12-202ENST00000469458 446 ntTSL 310.38□□□□□ -0.757e-11■■■■■ 32.7
UTP3Q9NQZ2 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.687e-7■■■■■ 32.7
UTP3Q9NQZ2 MCM7-205ENST00000463722 1327 ntTSL 512.97□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 32.7
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